50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17290 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_17290  CRISPR-associated protein, Cas2 family  100 
 
 		 93 aa  186  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0024  CRISPR-associated Cas2 family protein  73.91 
 
 		 92 aa  143  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.782096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3903  CRISPR-associated protein Cas2  53.33 
 
 		 116 aa  94.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0712399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1978  CRISPR-associated Cas2 family protein  51.14 
 
 		 113 aa  94.7  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.110587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1287  CRISPR-associated protein Cas2  47.83 
 
 		 116 aa  93.6  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0982  CRISPR-associated protein Cas2  49.46 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3048  CRISPR-associated protein Cas2  52.22 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000244697  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1529  CRISPR-associated protein Cas2  46.15 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00270035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0947  CRISPR-associated protein Cas2  52.27 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2686  CRISPR-associated protein Cas2  43.96 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00139784  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3012  CRISPR-associated protein Cas2  50 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0235864  decreased coverage  0.00725817 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17200  CRISPR-associated protein Cas2  46.59 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1237  CRISPR-associated protein Cas2  50 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0022864  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2579  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.67 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0586596 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0929  CRISPR-associated protein Cas2  45.65 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.525639  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1902  CRISPR-associated protein Cas2  46.15 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0857  hypothetical protein  46.99 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4087  CRISPR-associated protein Cas2  40.7 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0728059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2445  CRISPR-associated protein Cas2  39.53 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.568447 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2472  hypothetical protein  44.32 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2637  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.15 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0851527  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2990  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.02 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.2106  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5408  hypothetical protein  43.18 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0479014  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0837  hypothetical protein  43.18 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0965  hypothetical protein  43.02 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1601  CRISPR-associated protein Cas2  40.91 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0865232  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0421  CRISPR-associated protein Cas2  44.19 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0703097  normal  0.029266 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1393  hypothetical protein  43.02 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67162  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0600  hypothetical protein  44.19 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000609963  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3540  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.67 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.186786  normal  0.0703067 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2831  hypothetical protein  39.53 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3754  hypothetical protein  38.37 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.369105 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3584  CRISPR-associated protein Cas2  37.36 
 
 		 97 aa  67  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0168  hypothetical protein  42.31 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0958  hypothetical protein  38.1 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0934  CRISPR-associated protein Cas2  38.1 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1374  hypothetical protein  39.77 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0105683  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2882  hypothetical protein  36.36 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.653694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3120  hypothetical protein  36.36 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0404  CRISPR-associated protein Cas2  37.36 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4007  hypothetical protein  36.36 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.396918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2336  hypothetical protein  40.7 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000986814  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3147  hypothetical protein  34.52 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.886022 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0233  hypothetical protein  40.23 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3131  hypothetical protein  36.36 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3248  hypothetical protein  36.36 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.271107  normal  0.862142 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0766  CRISPR-associated endoribonuclease Cas2  37.33 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0695815 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3091  hypothetical protein  34.52 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3065  hypothetical protein  36.36 
 
 		 95 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1593  hypothetical protein  37.21 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.243436  normal  0.417431 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>