32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3771 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3771  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  157  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0421  CRISPR-associated protein Cas2  56.52 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0703097  normal  0.029266 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2990  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.94 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.2106  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0404  CRISPR-associated protein Cas2  46.15 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3584  CRISPR-associated protein Cas2  54.35 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0857  hypothetical protein  59.52 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1593  hypothetical protein  44.23 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.243436  normal  0.417431 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0958  hypothetical protein  48.94 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0934  CRISPR-associated protein Cas2  48.94 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3540  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.83 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.186786  normal  0.0703067 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0837  hypothetical protein  52.38 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2336  hypothetical protein  52.38 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000986814  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1393  hypothetical protein  48.89 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67162  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1601  CRISPR-associated protein Cas2  44.23 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0865232  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3091  hypothetical protein  48.94 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2472  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3147  hypothetical protein  48.94 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.886022 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0600  hypothetical protein  45.24 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000609963  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1374  hypothetical protein  43.75 
 
 		 97 aa  50.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0105683  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00873  CRISPR-associated protein Cas2  44.68 
 
 		 59 aa  50.4  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.745385  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2831  hypothetical protein  44.68 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3131  hypothetical protein  51.28 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0965  hypothetical protein  47.62 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0168  hypothetical protein  45.1 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4007  hypothetical protein  44.68 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.396918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3248  hypothetical protein  51.28 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.271107  normal  0.862142 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3065  hypothetical protein  51.28 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3120  hypothetical protein  44.68 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2882  hypothetical protein  51.28 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.653694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0233  hypothetical protein  46.51 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5408  hypothetical protein  43.48 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0479014  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3754  hypothetical protein  38.78 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.369105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>