34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0905 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0905  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 		 95 aa  193  6e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.505656  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2677  CRISPR-associated protein Cas2  85.53 
 
 		 80 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2165  CRISPR-associated protein Cas2  64.44 
 
 		 105 aa  133  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0152401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1412  CRISPR-associated protein Cas2  64.44 
 
 		 101 aa  133  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00285914  normal  0.0632504 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2336  hypothetical protein  31.82 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000986814  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0404  CRISPR-associated protein Cas2  28.41 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4007  hypothetical protein  26.14 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.396918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0837  hypothetical protein  29.55 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2472  hypothetical protein  29.55 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3120  hypothetical protein  26.14 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2882  hypothetical protein  26.14 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.653694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0421  CRISPR-associated protein Cas2  27.27 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0703097  normal  0.029266 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3248  hypothetical protein  26.14 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.271107  normal  0.862142 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3065  hypothetical protein  26.14 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3091  hypothetical protein  27.27 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3131  hypothetical protein  26.14 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0958  hypothetical protein  26.14 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0233  hypothetical protein  28.09 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3584  CRISPR-associated protein Cas2  26.14 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1902  CRISPR-associated protein Cas2  26.6 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0934  CRISPR-associated protein Cas2  26.14 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3754  hypothetical protein  29.55 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.369105 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2990  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.09 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.2106  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1393  hypothetical protein  27.27 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67162  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5408  hypothetical protein  29.55 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0479014  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0168  hypothetical protein  29.76 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0600  hypothetical protein  27.27 
 
 		 93 aa  43.5  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000609963  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0965  hypothetical protein  26.14 
 
 		 102 aa  42.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3147  hypothetical protein  26.14 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.886022 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1593  hypothetical protein  26.14 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.243436  normal  0.417431 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0857  hypothetical protein  26.14 
 
 		 98 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3012  CRISPR-associated protein Cas2  25 
 
 		 126 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0235864  decreased coverage  0.00725817 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1237  CRISPR-associated protein Cas2  23.86 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0022864  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3540  CRISPR-associated Cas2 family protein  27.47 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.186786  normal  0.0703067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>