More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_B0027 on replicon NC_011204
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011204  SeD_B0027  transposase  100 
 
 		 141 aa  294  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.922302 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4236  transposase IS200-family protein  75 
 
 		 142 aa  218  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495198 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1500  transposase IS200  68.42 
 
 		 137 aa  192  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864128  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  48.06 
 
 		 315 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  48.82 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  46.21 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  47.29 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  46.15 
 
 		 146 aa  123  8.000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2032  IS605 family transposase  48.65 
 
 		 166 aa  103  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  39.72 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0393  transposase IS200-family protein  42.48 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3237  IS200 transposase orfA  43.2 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1678  transposase IS200-family protein  43.09 
 
 		 139 aa  101  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4188  transposase IS200-family protein  39.37 
 
 		 133 aa  100  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0101  transposase IS200  37.8 
 
 		 140 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5522  IS element transposase  40.94 
 
 		 147 aa  98.2  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1367  transposase IS200-family protein  36.51 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.434428  normal  0.591867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0839  transposase IS200-family protein  36.51 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0587  transposase IS200-family protein  35.71 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1338  transposase IS200-family protein  35.71 
 
 		 137 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1411  transposase IS200-family protein  35.71 
 
 		 137 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1599  transposase IS200-family protein  36.51 
 
 		 138 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1427  transposase IS200-family protein  38.03 
 
 		 142 aa  97.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3301  transposase IS200-family protein  37.88 
 
 		 138 aa  97.4  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4523  transposase IS200-family protein  34.92 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.998354  normal  0.81056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1852  transposase IS200-family protein  38.69 
 
 		 141 aa  95.9  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0725841  normal  0.0149515 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4642  transposase IS200-family protein  36.92 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0640  transposase IS200-family protein  37.96 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.363374  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1431  transposase IS200-family protein  35.16 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0173  transposase IS200-family protein  35.16 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406175 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2799  transposase IS200-family protein  35.16 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3900  transposase IS200-family protein  36.15 
 
 		 132 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1529  transposase IS200-family protein  36.15 
 
 		 132 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2667  transposase IS200-family protein  32.28 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.370645  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  35.2 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  36.84 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  35.66 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2706  transposase IS200-family protein  32.28 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000307222  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  34.75 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1731  transposase IS200-family protein  30.33 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.316539  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  33.91 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  33.91 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0888  transposase IS200-family protein  30.33 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2011  transposase IS200-family protein  33.61 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.206349  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1693  transposase IS200-family protein  34.78 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.217342  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0445  transposase IS200-family protein  36.52 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0387  transposase IS200  32.84 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1583  transposase IS200-family protein  29.51 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0461624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3803  transposase IS200-family protein  32.79 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  33.91 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0900  transposase IS200-family protein  32.79 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  hitchhiker  0.000000040473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  29.77 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  30.7 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0497  transposase IS200-family protein  28.69 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.254331  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2847  transposase IS200-family protein  31.97 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2179  transposase IS200-family protein  31.97 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.258783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0189  transposase IS200-family protein  31.97 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3001  transposase IS200-family protein  31.97 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000296892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2038  transposase IS200-family protein  31.97 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2487  transposase IS200-family protein  34.43 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1392  transposase IS200-family protein  31.5 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879011  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2321  transposase IS200-family protein  30.89 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.541219  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1192  transposase IS200-family protein  31.97 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.541746  normal  0.0271846 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0416  transposase IS200-family protein  31.97 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.179707  normal  0.0295664 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0456  transposase IS200-family protein  31.97 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.176435 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2998  transposase IS200-family protein  30.16 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3851  transposase IS200-family protein  31.97 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0764343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3555  transposase IS200-family protein  31.97 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  33.61 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  33.61 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  34.15 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4295  transposase IS200-family protein  29.51 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000924983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3265  transposase IS200-like  33.91 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.488417 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2273  transposase IS200-like protein  30.89 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.927347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1083  transposase IS200-family protein  30.95 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4520  transposase IS200  35.88 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2962  transposase IS200-like  33.9 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.343837  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0149  transposase IS200-family protein  32.79 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.225581  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2684  transposase IS200-like  32.79 
 
 		 193 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3365  transposase IS200-family protein  29.92 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2929  transposase IS200-family protein  29.92 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0218  transposase IS200-family protein  30.83 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2645  transposase IS200-family protein  29.51 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0972  transposase IS200-family protein  32.79 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.246434  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4105  transposase IS200-family protein  29.03 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1583  transposase IS200-family protein  32.17 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439761  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0151  transposase IS200-family protein  31.97 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.266582  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  32.79 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1915  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1181  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.1932 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3227  transposase IS200-family protein  29.51 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1129  transposase IS200-family protein  29.51 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0881  transposase  30.23 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0017451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3010  transposase IS200-family protein  30.51 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254942  normal  0.0411213 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2336  transposase IS200-family protein  30.51 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00527221  hitchhiker  0.00384725 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0751  IS1004 transposase  28.7 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0956  IS1004 transposase  28.7 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0130063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1025  IS1004 transposase  28.7 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0396  IS1004 transposase  28.7 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1777  IS1004 transposase  28.7 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>