68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3676 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  99.75 
 
 		 978 bp  771    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3677    100 
 
 		 902 bp  1681    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  100 
 
 		 978 bp  779    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3676    100 
 
 		 1107 bp  2194    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  94.6 
 
 		 978 bp  658    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  90.85 
 
 		 978 bp  531  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2541    90.88 
 
 		 387 bp  470  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.494511  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3678  hypothetical protein  100 
 
 		 207 bp  410  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  86.17 
 
 		 717 bp  365  2e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  85.96 
 
 		 882 bp  347  4e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  80.61 
 
 		 978 bp  184  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  85.55 
 
 		 978 bp  145  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0548    82.1 
 
 		 446 bp  135  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  85.09 
 
 		 978 bp  129  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  85.09 
 
 		 978 bp  129  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1538    89.81 
 
 		 1007 bp  127  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.987441  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3575    89.36 
 
 		 515 bp  107  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  78.97 
 
 		 978 bp  91.7  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4372    85.58 
 
 		 808 bp  87.7  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  94.55 
 
 		 978 bp  85.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  85.86 
 
 		 978 bp  85.7  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  85.86 
 
 		 960 bp  85.7  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  78.75 
 
 		 991 bp  85.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  93.1 
 
 		 978 bp  83.8  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2256  hypothetical protein  86.52 
 
 		 114 bp  81.8  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0945    81.37 
 
 		 479 bp  81.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.836757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0979  hypothetical protein  81.37 
 
 		 243 bp  81.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  92.86 
 
 		 978 bp  79.8  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  81.1 
 
 		 978 bp  79.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  94.12 
 
 		 978 bp  77.8  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1609  hypothetical protein  84.47 
 
 		 150 bp  77.8  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0324    88.73 
 
 		 1072 bp  77.8  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  85.71 
 
 		 978 bp  77.8  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  82.22 
 
 		 978 bp  77.8  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  88.73 
 
 		 978 bp  77.8  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  89.23 
 
 		 978 bp  73.8  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  97.56 
 
 		 978 bp  73.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  89.23 
 
 		 978 bp  73.8  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  81.21 
 
 		 978 bp  73.8  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1695    86.84 
 
 		 1086 bp  71.9  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.165602  normal  0.365956 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  84.38 
 
 		 981 bp  71.9  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2394  hypothetical protein  83.84 
 
 		 315 bp  69.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.176236  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3113  hypothetical protein  90.74 
 
 		 624 bp  67.9  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1377    90.74 
 
 		 1010 bp  67.9  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  95.12 
 
 		 978 bp  65.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  87.69 
 
 		 597 bp  65.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  87.69 
 
 		 597 bp  65.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  95.12 
 
 		 978 bp  65.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  87.69 
 
 		 978 bp  65.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2257  hypothetical protein  86.3 
 
 		 174 bp  65.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1693    87.69 
 
 		 1055 bp  65.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.514185  normal  0.247616 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2822    91.67 
 
 		 526 bp  63.9  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.348547  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  93.02 
 
 		 951 bp  61.9  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  93.02 
 
 		 978 bp  61.9  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  94.74 
 
 		 978 bp  60  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2002    85.14 
 
 		 756 bp  60  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.923889 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  92.68 
 
 		 978 bp  58  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1859    86.15 
 
 		 930 bp  58  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2259  hypothetical protein  85.07 
 
 		 168 bp  54  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3747  hypothetical protein  96.67 
 
 		 159 bp  52  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.738111  normal  0.298889 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3782  hypothetical protein  96.67 
 
 		 156 bp  52  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2502    96.55 
 
 		 1090 bp  50.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.674339  normal  0.0724762 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3679  hypothetical protein  100 
 
 		 306 bp  50.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  80.53 
 
 		 561 bp  50.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1777    91.67 
 
 		 1042 bp  48.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  90 
 
 		 561 bp  48.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4464    85.71 
 
 		 753 bp  48.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  85.71 
 
 		 978 bp  48.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>