55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2259 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2259  hypothetical protein  100 
 
 
55 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2257  hypothetical protein  78.38 
 
 
57 aa  61.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  70.27 
 
 
325 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  75.76 
 
 
325 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  75.76 
 
 
325 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  75.76 
 
 
325 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  70.27 
 
 
325 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  61.36 
 
 
323 aa  54.3  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  72.73 
 
 
186 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  75.76 
 
 
325 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  75.76 
 
 
329 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  75.76 
 
 
325 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  75.76 
 
 
325 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  75.76 
 
 
326 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  75.76 
 
 
325 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  75.76 
 
 
325 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  75 
 
 
325 aa  53.9  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0979  hypothetical protein  75.76 
 
 
80 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1728  hypothetical protein  72.73 
 
 
80 aa  53.9  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  75.76 
 
 
325 aa  53.9  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  75 
 
 
325 aa  53.5  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  75 
 
 
238 aa  53.5  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  72.73 
 
 
325 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  72.73 
 
 
325 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  75 
 
 
293 aa  53.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  77.42 
 
 
186 aa  52.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3113  hypothetical protein  67.57 
 
 
207 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  75 
 
 
325 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  77.42 
 
 
325 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  75 
 
 
325 aa  53.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  75 
 
 
325 aa  53.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  72.73 
 
 
325 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  69.44 
 
 
325 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  77.42 
 
 
325 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0495  hypothetical protein  69.7 
 
 
56 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  72.73 
 
 
325 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  72.73 
 
 
325 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  72.73 
 
 
319 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  74.19 
 
 
325 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  62.16 
 
 
325 aa  50.4  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  59.46 
 
 
325 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  62.16 
 
 
325 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  67.65 
 
 
325 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1609  hypothetical protein  73.33 
 
 
49 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  65.62 
 
 
326 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  65.62 
 
 
326 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  50 
 
 
325 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  50 
 
 
325 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  54.05 
 
 
325 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  61.29 
 
 
325 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  47.73 
 
 
325 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  47.73 
 
 
325 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2256  hypothetical protein  70.37 
 
 
37 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  67.86 
 
 
316 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  58.06 
 
 
325 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>