More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0628 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  30.35 
 
 		 3021 aa  675    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  30.43 
 
 		 2258 aa  639    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  31.59 
 
 		 2350 aa  649    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  30.76 
 
 		 3002 aa  692    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  30.74 
 
 		 3252 aa  695    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  30.46 
 
 		 2230 aa  722    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0628  amino acid adenylation  100 
 
 		 1837 aa  3797    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  30.66 
 
 		 2619 aa  629  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  29.31 
 
 		 3739 aa  624  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  32.15 
 
 		 1514 aa  621  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3024  amino acid adenylation domain protein  35 
 
 		 1157 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3097  amino acid adenylation domain protein  34.91 
 
 		 1157 aa  602  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  30.62 
 
 		 2174 aa  599  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  28.38 
 
 		 2338 aa  592  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  28.13 
 
 		 2336 aa  589  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  28.24 
 
 		 2345 aa  586  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1029  amino acid adenylation domain protein  29.84 
 
 		 2310 aa  569  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0131723 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  33.11 
 
 		 3194 aa  556  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  34.16 
 
 		 2706 aa  551  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  34.9 
 
 		 1835 aa  548  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1030  amino acid adenylation domain protein  37.68 
 
 		 1845 aa  548  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63087  normal  0.0425488 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  32.89 
 
 		 1487 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  35.5 
 
 		 1734 aa  519  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1335  amino acid adenylation domain protein  33.39 
 
 		 1104 aa  515  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  31.78 
 
 		 2896 aa  517  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  32.33 
 
 		 1131 aa  506  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  32.98 
 
 		 1321 aa  501  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  35.47 
 
 		 4268 aa  498  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1761  amino acid adenylation domain protein  34.93 
 
 		 1837 aa  497  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361217  normal  0.0352507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1811  putative siderophore synthetase protein  34.96 
 
 		 2006 aa  495  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2674  amino acid adenylation domain protein  33.59 
 
 		 1862 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2071  amino acid adenylation domain-containing protein  32.88 
 
 		 1326 aa  481  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564639  normal  0.531105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  27.09 
 
 		 4882 aa  481  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3481  amino acid adenylation domain-containing protein  32.98 
 
 		 1167 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10847  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3032  amino acid adenylation  33.63 
 
 		 1884 aa  482  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3470  amino acid adenylation  33.16 
 
 		 1167 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3533  amino acid adenylation domain-containing protein  33.16 
 
 		 1167 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5942  amino acid adenylation domain-containing protein  30.59 
 
 		 1678 aa  479  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  29.94 
 
 		 3875 aa  478  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0622  amino acid adenylation domain protein  31.5 
 
 		 1174 aa  477  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  30.74 
 
 		 3293 aa  478  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12408  phenyloxazoline synthase mbtB  31.82 
 
 		 1414 aa  475  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2806  amino acid adenylation domain-containing protein  32.79 
 
 		 1317 aa  477  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0752  amino acid adenylation domain-containing protein  34.12 
 
 		 1897 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0684  putative pyochelin synthetase  33.58 
 
 		 1888 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  26.84 
 
 		 6676 aa  466  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  26.59 
 
 		 4531 aa  463  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1337  amino acid adenylation domain protein  31.22 
 
 		 1158 aa  463  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  32.2 
 
 		 2200 aa  461  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  32.97 
 
 		 4165 aa  459  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  25.54 
 
 		 6889 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54930  putative non-ribosomal peptide synthetase  30.82 
 
 		 1113 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000953001  unclonable  2.81239e-20 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3849  amino acid adenylation domain-containing protein  31.36 
 
 		 1149 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239228  normal  0.864277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2692  amino acid adenylation domain-containing protein  29.99 
 
 		 1152 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131895  normal  0.389847 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4326  amino acid adenylation domain protein  32.98 
 
 		 1163 aa  447  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3966  amino acid adenylation domain protein  29.85 
 
 		 1193 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0788  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  33.99 
 
 		 2023 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2151  pyochelin synthetase  33.88 
 
 		 2084 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.332048  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1827  pyochelin synthetase  33.92 
 
 		 1894 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433589  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2098  yersiniabactin synthetase, HMWP2 component  32.79 
 
 		 2035 aa  450  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3965  amino acid adenylation domain protein  32.02 
 
 		 1889 aa  444  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3088  amino acid adenylation domain protein  31.3 
 
 		 1084 aa  442  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24748  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  25.74 
 
 		 5953 aa  439  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2602  yersiniabactin non-ribosomal peptide synthetase  30.2 
 
 		 2057 aa  439  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0875  pyochelin synthetase  33.52 
 
 		 1809 aa  440  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0878  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  33.66 
 
 		 2090 aa  440  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  27.1 
 
 		 8646 aa  436  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  25.42 
 
 		 5328 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5290  amino acid adenylation domain-containing protein  32.96 
 
 		 1825 aa  432  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626618  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0673  non-ribosomal peptide synthetase modules  33.03 
 
 		 1824 aa  433  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0459649  normal  0.889523 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3370  amino acid adenylation  32.99 
 
 		 1825 aa  432  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09280  pyochelin synthetase  32.92 
 
 		 1809 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4997  amino acid adenylation domain-containing protein  32.99 
 
 		 1825 aa  432  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  24.12 
 
 		 2581 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  26.35 
 
 		 9498 aa  426  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  24.87 
 
 		 4960 aa  423  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  24.6 
 
 		 4960 aa  422  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  24.84 
 
 		 3086 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1764  amino acid adenylation domain protein  28.32 
 
 		 1497 aa  419  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  24.47 
 
 		 3695 aa  416  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  24.49 
 
 		 3086 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  25.56 
 
 		 6403 aa  417  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0874  dihydroaeruginoic acid synthetase  32.82 
 
 		 1436 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  26.39 
 
 		 2573 aa  414  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  25.04 
 
 		 3291 aa  414  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  24.26 
 
 		 4196 aa  411  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  24.82 
 
 		 7168 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  25.62 
 
 		 13537 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  24.49 
 
 		 3308 aa  406  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  26.52 
 
 		 2370 aa  405  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  26.25 
 
 		 5926 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  23.98 
 
 		 4968 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  25.91 
 
 		 3176 aa  403  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  24.58 
 
 		 4747 aa  398  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  24.84 
 
 		 9175 aa  398  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  25.58 
 
 		 2201 aa  400  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1780  amino acid adenylation domain-containing protein  23.62 
 
 		 1922 aa  399  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276348  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  24.63 
 
 		 3432 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09270  dihydroaeruginoic acid synthetase  32 
 
 		 1438 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.720802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0787  non-ribosomal peptide synthase  32.45 
 
 		 1489 aa  397  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>