More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1941 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1941  ribosomal protein L17  100 
 
 		 116 aa  234  3e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  77.59 
 
 		 117 aa  186  1e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1583  50S ribosomal protein L17  76.72 
 
 		 117 aa  184  4e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1768  50S ribosomal protein L17  76.72 
 
 		 117 aa  184  4e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0060  50S ribosomal protein L17  79.31 
 
 		 118 aa  183  9e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.927708  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1949  50S ribosomal protein L17  74.14 
 
 		 117 aa  179  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0521234  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0204  50S ribosomal protein L17  75 
 
 		 118 aa  177  5.999999999999999e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0328  50S ribosomal protein L17  78.45 
 
 		 116 aa  164  4e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1007  50S ribosomal protein L17  76.29 
 
 		 99 aa  153  8e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.168469  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1750  50S ribosomal protein L17  75.26 
 
 		 99 aa  152  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00132391  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0342  ribosomal protein L17  52 
 
 		 125 aa  133  9e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  58.62 
 
 		 141 aa  130  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  56.03 
 
 		 139 aa  130  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 116 aa  127  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1048  ribosomal protein L17  53.45 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  56.03 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2143  ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 131 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  0.318394 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3416  50S ribosomal protein L17P  52.59 
 
 		 131 aa  121  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2346  ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 119 aa  120  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 		 140 aa  120  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 132 aa  120  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 137 aa  120  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 139 aa  120  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  51.72 
 
 		 137 aa  120  8e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 142 aa  119  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 142 aa  119  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 168 aa  120  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0588  50S ribosomal protein L17  50.83 
 
 		 132 aa  119  9e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.348029  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  50 
 
 		 126 aa  119  9e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  50.86 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  51.72 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  50.43 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 132 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  50.86 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0433  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 		 133 aa  118  3e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 138 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0346  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.962629  unclonable  0.0000000436647 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0346  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 133 aa  117  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.000393302 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 142 aa  117  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 141 aa  116  7.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 132 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 126 aa  116  9e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 126 aa  116  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3135  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 156 aa  116  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0512545  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 130 aa  116  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5044  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 132 aa  115  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 178 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  50 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0196  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00364658  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1839  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.501315  normal  0.68282 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0174  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000106796  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0461081 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3498  ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110108  hitchhiker  0.0000306031 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2878  ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 118 aa  115  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2615  ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.718134  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3617  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201184  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0245552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>