More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3485 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3485  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases-like  100 
 
 		 557 aa  1149    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  36.54 
 
 		 531 aa  236  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  33.53 
 
 		 544 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  32.81 
 
 		 414 aa  203  7e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  37.5 
 
 		 535 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  33.84 
 
 		 505 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  34.23 
 
 		 461 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  31.04 
 
 		 574 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  34.36 
 
 		 529 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  33.89 
 
 		 548 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  31.75 
 
 		 575 aa  171  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  32.03 
 
 		 518 aa  171  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  30.92 
 
 		 388 aa  170  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  34.15 
 
 		 486 aa  170  8e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  34.65 
 
 		 493 aa  169  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  31.65 
 
 		 548 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  31.65 
 
 		 548 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  31.14 
 
 		 549 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  32.23 
 
 		 489 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2111  monooxygenase, FAD-binding  31.59 
 
 		 511 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0054618  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  27.7 
 
 		 548 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2975  monooxygenase FAD-binding protein  33.43 
 
 		 506 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0868842  hitchhiker  0.000653809 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  28.01 
 
 		 571 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  33.03 
 
 		 486 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  31.79 
 
 		 550 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  34.97 
 
 		 546 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  34.33 
 
 		 540 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5651  monooxygenase FAD-binding  30.99 
 
 		 547 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  33.53 
 
 		 548 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  33.53 
 
 		 548 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  31.52 
 
 		 550 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  28.99 
 
 		 574 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  32.96 
 
 		 968 aa  160  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  32.81 
 
 		 515 aa  160  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  33.24 
 
 		 548 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  32.22 
 
 		 546 aa  160  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  33.24 
 
 		 548 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  30.89 
 
 		 506 aa  160  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  29.86 
 
 		 511 aa  160  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  32.28 
 
 		 511 aa  159  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  33.24 
 
 		 611 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  31.75 
 
 		 552 aa  158  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  32.95 
 
 		 538 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  33.08 
 
 		 485 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  32.95 
 
 		 538 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  33.8 
 
 		 553 aa  158  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  34.72 
 
 		 479 aa  158  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  33.07 
 
 		 475 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  32.13 
 
 		 486 aa  156  9e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  32.11 
 
 		 474 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  31.33 
 
 		 475 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  32.72 
 
 		 494 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  28.18 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  32.83 
 
 		 480 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3372  monooxygenase FAD-binding protein  32 
 
 		 553 aa  151  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  30.53 
 
 		 488 aa  151  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  29.38 
 
 		 502 aa  150  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  32.77 
 
 		 522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  29.35 
 
 		 500 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  30.56 
 
 		 502 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  30.95 
 
 		 488 aa  148  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  29.47 
 
 		 566 aa  147  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  33.14 
 
 		 481 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  29.38 
 
 		 502 aa  147  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  30.64 
 
 		 547 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  29.38 
 
 		 502 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  31.76 
 
 		 503 aa  146  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  31.66 
 
 		 497 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  32.51 
 
 		 489 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4203  monooxygenase FAD-binding  33.14 
 
 		 487 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  30.89 
 
 		 478 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.24 
 
 		 569 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  31.14 
 
 		 478 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  31.14 
 
 		 478 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5676  monooxygenase, FAD-binding  31.27 
 
 		 515 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5297  monooxygenase, FAD-binding protein  31.27 
 
 		 515 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.85745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5386  monooxygenase, FAD-binding  31.27 
 
 		 515 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.416517 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  32.3 
 
 		 477 aa  144  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  30.48 
 
 		 511 aa  143  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  30.63 
 
 		 512 aa  143  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  31.69 
 
 		 473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  31.69 
 
 		 473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  31.69 
 
 		 473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  32.75 
 
 		 506 aa  141  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2199  monooxygenase, FAD-binding  31.72 
 
 		 492 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  28.88 
 
 		 497 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  33.43 
 
 		 486 aa  140  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  29.66 
 
 		 489 aa  139  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  32.85 
 
 		 477 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  32.83 
 
 		 477 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  30.03 
 
 		 537 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3769  hypothetical protein  30.79 
 
 		 564 aa  137  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.28 
 
 		 569 aa  137  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  33.33 
 
 		 497 aa  137  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  30.03 
 
 		 537 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  30.03 
 
 		 537 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  29.89 
 
 		 594 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.51 
 
 		 568 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.22 
 
 		 510 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.78 
 
 		 573 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>