31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3408 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3408  aminoglycoside phosphotransferase-like  100 
 
 		 263 aa  542  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0833457 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01523  hypothetical protein  24.15 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  25 
 
 		 522 aa  63.2  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2817  hypothetical protein  25.63 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.575731 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1699  thiamine kinase  25.63 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1591  thiamine kinase  25.63 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196293  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003999  hypothetical protein  25.84 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2795  thiamine kinase  26.83 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2489  thiamine kinase  23.9 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.385558  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  22.63 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1483  hypothetical protein  21.08 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0577113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1923  thiamine kinase  24.39 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.592165  hitchhiker  0.0000295844 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1889  aminoglycoside phosphotransferase  27.2 
 
 		 349 aa  53.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2749  aminoglycoside phosphotransferase  37.33 
 
 		 345 aa  52.4  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.589565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  22.95 
 
 		 291 aa  52.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1307  putative antibiotic resistance protein  30 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0977  hypothetical membrane associated protein  30.19 
 
 		 363 aa  51.2  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1037  hypothetical protein  30.19 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1831  aminoglycoside phosphotransferase  24.89 
 
 		 353 aa  49.7  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0556162  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  24.37 
 
 		 304 aa  48.9  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  22.97 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1529  hypothetical protein  22.83 
 
 		 332 aa  47  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7782  aminoglycoside phosphotransferase  23.46 
 
 		 334 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.165999  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  26.13 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  24.12 
 
 		 611 aa  45.8  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  24.38 
 
 		 361 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1605  Thiamine kinase  21.74 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  23.31 
 
 		 355 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  21.65 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02802  Choline kinase involved in LPS biosynthesis  29.21 
 
 		 240 aa  42.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.994431  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1738  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 		 379 aa  42  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>