114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3088 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3088  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  362  1e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2271  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 195 aa  97.1  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0401409  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3136  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 		 200 aa  96.3  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1562  ferrichrome-binding protein  29.93 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2425  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280339  normal  0.117727 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1509  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  29.82 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0850928  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2123  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0562469  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3215  GCN5-related N-acetyltransferase  27.04 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0395342 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3248  GCN5-related N-acetyltransferase  24.03 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2161  GCN5-related N-acetyltransferase  28.03 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.114722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 		 347 aa  51.6  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5418  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 		 164 aa  51.2  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.192124  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  36.84 
 
 		 601 aa  50.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  26.45 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003301  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2144  GCN5-related N-acetyltransferase  25.49 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  25.17 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2617  GCN5-related N-acetyltransferase  28.86 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000214426 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  26.92 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1481  GCN5-related N-acetyltransferase  24.67 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  24.5 
 
 		 180 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1192  GCN5-related N-acetyltransferase  27.55 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0681319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.81 
 
 		 180 aa  48.5  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1894  GCN5-related N-acetyltransferase  31.41 
 
 		 168 aa  48.5  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1747  GCN5-related N-acetyltransferase  28.07 
 
 		 176 aa  48.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00283378  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  25.81 
 
 		 180 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.81 
 
 		 180 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  25.81 
 
 		 180 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  25.81 
 
 		 180 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1680  GCN5-related N-acetyltransferase  22.75 
 
 		 173 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2111  GCN5-related N-acetyltransferase  27.88 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0586754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0162  GCN5-related N-acetyltransferase  27.15 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00540  expressed protein  39.13 
 
 		 225 aa  46.2  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.187547  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0192  GCN5-related N-acetyltransferase  29.61 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.470214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4367  GCN5-related N-acetyltransferase  27.97 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1904  GCN5-related N-acetyltransferase  24.09 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607979  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01621  conserved hypothetical protein  28.1 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.112063 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1891  acetyltransferase  25.32 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1834  acetyltransferase  27.52 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002738  acetyltransferase  23.08 
 
 		 237 aa  45.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000969588  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2455  GCN5-related N-acetyltransferase  27.21 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000222061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0253  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.068745 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2744  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 		 175 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3192  GCN5-related N-acetyltransferase  28.71 
 
 		 174 aa  45.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  24.34 
 
 		 187 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1789  GCN5-related N-acetyltransferase  34.07 
 
 		 182 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166942  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6199  GCN5-related N-acetyltransferase  26.19 
 
 		 173 aa  45.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  26.86 
 
 		 200 aa  45.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3387  GCN5-related N-acetyltransferase  25.89 
 
 		 163 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  26.88 
 
 		 183 aa  45.1  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2857  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 		 167 aa  44.7  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000286038  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1803  GCN5-related N-acetyltransferase  37.84 
 
 		 166 aa  44.7  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2550  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 		 181 aa  44.7  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0926  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 		 178 aa  44.7  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639831  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0956  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 		 163 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0991  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 		 163 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0977  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 		 163 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2071  acetyltransferase, GNAT family  25.23 
 
 		 289 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 		 178 aa  44.3  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.121319  unclonable  0.0000303298 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3550  GCN5-related N-acetyltransferase  30.59 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4439  GCN5-related N-acetyltransferase  24.84 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5819  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.340539 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0820  acetyltransferase  28.81 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1769  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171854  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0456  GCN5-related N-acetyltransferase  30.65 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0931  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811036  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1518  GNAT family acetyltransferase  26.53 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000034512  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2571  GCN5-related N-acetyltransferase  24.38 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000321902  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0843  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4749  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0399  GCN5-related N-acetyltransferase  30.65 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1833  GCN5-related N-acetyltransferase  25.22 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0388596  normal  0.552539 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00720  acetyltransferase, GNAT family  31.43 
 
 		 102 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3353  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6718  GCN5-related N-acetyltransferase  26.61 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  26.05 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01360  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  26.88 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0478  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1649  GCN5-related N-acetyltransferase  25.5 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2687  GCN5-related N-acetyltransferase  25.58 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000216102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0618  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1202  GCN5-related N-acetyltransferase  24.69 
 
 		 178 aa  42  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.221931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3606  GCN5-related N-acetyltransferase  30.93 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4577  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 		 166 aa  42.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000162939  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  29.46 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000218796  hitchhiker  0.000817429 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 196 aa  42  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  22.5 
 
 		 176 aa  42  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2612  GCN5-related N-acetyltransferase  24.38 
 
 		 163 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155253  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0509  GCN5-related N-acetyltransferase  28.97 
 
 		 176 aa  42  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06830  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  28.57 
 
 		 172 aa  42  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2464  acetyltransferase  26.5 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>