27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE00540 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE00540  expressed protein  100 
 
 
225 aa  454  1e-127  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.187547  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1769  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 
182 aa  52  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171854  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12150  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  33.94 
 
 
160 aa  50.1  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.46276  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3248  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
182 aa  49.7  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3250  GCN5-related N-acetyltransferase  26.55 
 
 
173 aa  49.3  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0931  GCN5-related N-acetyltransferase  27.1 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811036  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3361  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 
185 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0664869  normal  0.190912 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0779  sortase  36.26 
 
 
165 aa  47.8  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2854  GCN5-related N-acetyltransferase  28.17 
 
 
169 aa  47  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.931965  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1666  GCN5-related N-acetyltransferase  32.74 
 
 
170 aa  45.8  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2744  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
175 aa  45.8  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12370  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  37.93 
 
 
160 aa  45.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0846321  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2197  GCN5-related N-acetyltransferase  33.75 
 
 
184 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3248  GCN5-related N-acetyltransferase  28.68 
 
 
169 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0965869 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2303  GCN5-related N-acetyltransferase  26.29 
 
 
165 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00517346  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13254  transferase  32.95 
 
 
474 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.323872  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3136  GCN5-related N-acetyltransferase  32.67 
 
 
200 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2373  GCN5-related N-acetyltransferase  26.29 
 
 
165 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.251106  normal  0.86295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5418  GCN5-related N-acetyltransferase  39.34 
 
 
164 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.192124  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2493  GCN5-related N-acetyltransferase  30.69 
 
 
165 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.807404  hitchhiker  0.00667381 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2786  GCN5-related N-acetyltransferase  36.07 
 
 
173 aa  43.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0734111  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0192  GCN5-related N-acetyltransferase  28.9 
 
 
177 aa  42.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.470214 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  35.14 
 
 
601 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  30.11 
 
 
188 aa  42.4  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2047  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  35.21 
 
 
529 aa  41.6  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830123  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  35.59 
 
 
185 aa  41.6  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533995  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2271  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 
195 aa  41.6  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0401409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>