86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12150 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_12150  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  100 
 
 		 160 aa  320  5e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.46276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0618  GCN5-related N-acetyltransferase  37.58 
 
 		 193 aa  100  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1580  GCN5-related N-acetyltransferase  43.42 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00424013  hitchhiker  0.00000000112827 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2778  GCN5-related N-acetyltransferase  43.42 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00083065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2873  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2798  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000101695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3248  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0965869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0176  GCN5-related N-acetyltransferase  38.93 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.398675  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2833  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.25 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3103  acetyltransferase  39.08 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2619  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3100  acetyltransferase, GNAT family  40 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00198579  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2125  GCN5-related N-acetyltransferase  38.17 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2861  acetyltransferase  40 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.160389  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1771  acetyltransferase, GNAT family  32.62 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.023064 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2793  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3075  acetyltransferase  40 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.664564  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0930  GCN5-related N-acetyltransferase  36.27 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.18586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2855  GCN5-related N-acetyltransferase  38.75 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00871224  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2812  GCN5-related N-acetyltransferase  36.79 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3069  acetyltransferase, GNAT family  37.5 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3084  acetyltransferase, GNAT family  38.75 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2469  GCN5-related N-acetyltransferase  35.45 
 
 		 182 aa  51.6  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0713  GCN5-related N-acetyltransferase  32.98 
 
 		 172 aa  51.6  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.853775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2633  GCN5-related N-acetyltransferase  37.62 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.192007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7134  GCN5-related N-acetyltransferase  28.45 
 
 		 174 aa  50.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18120  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  40.38 
 
 		 194 aa  50.4  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.760342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4333  GCN5-related N-acetyltransferase  31.09 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.156347 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0931  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811036  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2178  acetyltransferase, GNAT family  37.5 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.810556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8761  hypothetical protein  32.38 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13254  transferase  50 
 
 		 474 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.323872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5819  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.340539 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0791  GCN5-related N-acetyltransferase  37.89 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.144012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  34.43 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488487  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00540  expressed protein  34.78 
 
 		 225 aa  48.9  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.187547  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3402  GCN5-related N-acetyltransferase  28.29 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.774509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2550  GCN5-related N-acetyltransferase  44.07 
 
 		 181 aa  48.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0192  GCN5-related N-acetyltransferase  42.53 
 
 		 177 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.470214 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0820  GCN5-related N-acetyltransferase  35.78 
 
 		 180 aa  47.8  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350892  normal  0.227447 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19930  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  44.07 
 
 		 176 aa  47.8  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193802  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0149  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0158  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270382  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5042  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668366  normal  0.445888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  49.23 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  hitchhiker  0.00000000407656 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1840  GCN5-related N-acetyltransferase  44.62 
 
 		 369 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2197  GCN5-related N-acetyltransferase  39.24 
 
 		 184 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1855  GCN5-related N-acetyltransferase  39.22 
 
 		 377 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2892  GCN5-related N-acetyltransferase  34.59 
 
 		 186 aa  44.3  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.166818  hitchhiker  0.00354193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2570  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 		 192 aa  44.3  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.345636  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1897  GCN5-related N-acetyltransferase  41.77 
 
 		 170 aa  44.3  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.312294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7367  GCN5-related N-acetyltransferase  37.63 
 
 		 180 aa  44.3  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2004  GCN5-related N-acetyltransferase  31.62 
 
 		 164 aa  44.3  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3829  GCN5-related N-acetyltransferase  43.1 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1187  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 		 171 aa  43.9  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.773581 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0139  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.123516 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4082  GCN5-related N-acetyltransferase  37.89 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8007  GCN5-related N-acetyltransferase  44.07 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0186  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2558  hypothetical protein  34.41 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0371121  normal  0.114182 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2618  GCN5-related N-acetyltransferase  31.31 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.397987  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  43.55 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.204345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1848  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.905398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1801  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.427986  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2477  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.362276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2373  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.251106  normal  0.86295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2493  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.807404  hitchhiker  0.00667381 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2303  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00517346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1740  GCN5-related N-acetyltransferase  47.17 
 
 		 183 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.303621  normal  0.0640122 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2138  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 205 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2900  GCN5-related N-acetyltransferase  45.9 
 
 		 108 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153843  normal  0.249566 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2854  GCN5-related N-acetyltransferase  28.71 
 
 		 169 aa  42  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.931965  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0808  GCN5-related N-acetyltransferase  38.57 
 
 		 173 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2744  GCN5-related N-acetyltransferase  31 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  33.91 
 
 		 177 aa  42  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1666  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0244  GNAT family acetyltransferase  35.35 
 
 		 178 aa  41.2  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17840  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  37.5 
 
 		 359 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1803  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  41.24 
 
 		 187 aa  40.8  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2295  GCN5-related N-acetyltransferase  35.58 
 
 		 183 aa  40.8  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  0.695488 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2773  GCN5-related N-acetyltransferase  36.17 
 
 		 188 aa  40.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  33.66 
 
 		 171 aa  40.8  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  25.58 
 
 		 180 aa  40.4  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>