116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18120 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_18120  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  100 
 
 
194 aa  377  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.760342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4333  GCN5-related N-acetyltransferase  49.4 
 
 
169 aa  143  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.156347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8761  hypothetical protein  48.78 
 
 
188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0930  GCN5-related N-acetyltransferase  47.62 
 
 
186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.18586  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2633  GCN5-related N-acetyltransferase  40.57 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.192007  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2295  GCN5-related N-acetyltransferase  40.62 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  0.695488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0149  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
165 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0158  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
165 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270382  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0139  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.123516 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0791  GCN5-related N-acetyltransferase  30.52 
 
 
163 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.144012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488487  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3916  GCN5-related N-acetyltransferase  34.65 
 
 
179 aa  61.6  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.229048  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2140  GCN5-related N-acetyltransferase  39.77 
 
 
151 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3402  GCN5-related N-acetyltransferase  38.75 
 
 
179 aa  58.5  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.774509  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2812  GCN5-related N-acetyltransferase  34.35 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0068  GCN5-related N-acetyltransferase  45.33 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0769  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
168 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1757  GCN5-related N-acetyltransferase  40.26 
 
 
111 aa  54.7  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3248  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
169 aa  54.7  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0965869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3550  GCN5-related N-acetyltransferase  29.85 
 
 
167 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5256  GCN5-related N-acetyltransferase  30.17 
 
 
166 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.722266 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21500  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  33.86 
 
 
159 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.931857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0618  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
193 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2469  GCN5-related N-acetyltransferase  32.97 
 
 
182 aa  52  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2564  GCN5-related N-acetyltransferase  34.26 
 
 
121 aa  51.6  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451663  normal  0.927347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3804  hypothetical protein  27.71 
 
 
188 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0689439  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1059  GCN5-related N-acetyltransferase  28.26 
 
 
185 aa  51.2  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1771  acetyltransferase, GNAT family  33.93 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.023064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1806  GCN5-related N-acetyltransferase  40.23 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4593  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.722115  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7134  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12150  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  40.38 
 
 
160 aa  50.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.46276  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2969  GCN5-related N-acetyltransferase  33.79 
 
 
180 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294894  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2619  GCN5-related N-acetyltransferase  35.62 
 
 
171 aa  49.7  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1740  GCN5-related N-acetyltransferase  48.33 
 
 
183 aa  49.3  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.303621  normal  0.0640122 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2778  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 
163 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00083065  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1580  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 
163 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00424013  hitchhiker  0.00000000112827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1902  GCN5-related N-acetyltransferase  36.94 
 
 
182 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.99979  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2798  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 
163 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000101695  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2873  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 
163 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160424  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20860  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  30.5 
 
 
170 aa  48.9  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3105  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
177 aa  48.9  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0195  acetyltransferase  28.24 
 
 
189 aa  47.8  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1100  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00133264  hitchhiker  0.000173384 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2125  GCN5-related N-acetyltransferase  32.11 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2841  GCN5-related N-acetyltransferase  36.26 
 
 
172 aa  47.8  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0585  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.424519  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2939  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
171 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0256965  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2854  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.931965  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0820  GCN5-related N-acetyltransferase  30.37 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350892  normal  0.227447 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1431  putative acetyltransferase  27.16 
 
 
176 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684414  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0878  GCN5-related N-acetyltransferase  28.09 
 
 
291 aa  45.8  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 
334 aa  46.2  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  39.74 
 
 
152 aa  45.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0751  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
164 aa  45.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2792  ribosomal protein N-acetylase-like protein  27.96 
 
 
201 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7086  GCN5-related N-acetyltransferase  47.27 
 
 
236 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22370  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  31.21 
 
 
181 aa  45.8  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3069  acetyltransferase, GNAT family  37.5 
 
 
149 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2974  GCN5-related N-acetyltransferase  29.85 
 
 
183 aa  45.1  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5819  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
167 aa  45.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.340539 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4127  GCN5-related N-acetyltransferase  27.84 
 
 
174 aa  45.1  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
183 aa  45.1  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3667  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1834  acetyltransferase  26.61 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2753  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
174 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0359  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.77 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.605225  normal  0.0824399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1649  GCN5-related N-acetyltransferase  29.46 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2612  GCN5-related N-acetyltransferase  25.23 
 
 
163 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2687  GCN5-related N-acetyltransferase  25.23 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000216102  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3070  GCN5-related N-acetyltransferase  27.01 
 
 
178 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000252712  hitchhiker  0.000932566 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  24.32 
 
 
163 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000218796  hitchhiker  0.000817429 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5169  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  28.57 
 
 
173 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0318  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 
174 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3043  GCN5-related N-acetyltransferase  30.21 
 
 
196 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0186  GCN5-related N-acetyltransferase  38.16 
 
 
166 aa  43.5  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6718  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586463  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0713  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.853775  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003605  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  35.9 
 
 
177 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2876  acetyltransferase  26 
 
 
175 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0284819  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2455  GCN5-related N-acetyltransferase  25.98 
 
 
178 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000222061 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1263  acetyltransferase  30.43 
 
 
180 aa  42.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173592 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  28.68 
 
 
178 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135635  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2269  GCN5-related N-acetyltransferase  41.54 
 
 
199 aa  42.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.495125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5893  Acetyltransferase including N-acetylase of ribosomal protein-like protein  38.64 
 
 
352 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0132303 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  25.98 
 
 
178 aa  42.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1634  GCN5-related N-acetyltransferase  28.68 
 
 
178 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06848  acetyltransferase  23.81 
 
 
183 aa  42.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2709  GCN5-related N-acetyltransferase  28.68 
 
 
178 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000725277 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2178  acetyltransferase, GNAT family  32.29 
 
 
149 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.810556  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2861  acetyltransferase  37.5 
 
 
153 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.160389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3075  acetyltransferase  37.5 
 
 
153 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.664564  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2571  GCN5-related N-acetyltransferase  25.23 
 
 
163 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000321902  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1580  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
178 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125256  normal  0.248889 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2640  GCN5-related N-acetyltransferase  29.91 
 
 
184 aa  42  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221093  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1893  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
165 aa  42  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.993819  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3100  acetyltransferase, GNAT family  36.11 
 
 
153 aa  42  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00198579  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  26.09 
 
 
179 aa  41.6  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  28.75 
 
 
180 aa  41.6  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>