More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2122 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2122  CheW protein  100 
 
 
168 aa  343  8e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0925774  normal  0.486668 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2207  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.33 
 
 
190 aa  99.4  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1177  hypothetical protein  35.14 
 
 
193 aa  97.8  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2454  hypothetical protein  34.23 
 
 
202 aa  97.4  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0406418  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02592  O-acetyltransferase  32 
 
 
192 aa  92  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3056  hexapaptide repeat-containing transferase  32.64 
 
 
202 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4048  acetyltransferase  30.87 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2222  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5291  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.17 
 
 
550 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.111996 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2408  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.58 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2691  galactoside O-acetyltransferase  33.1 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000193243  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3784  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.28 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7339  transacetylase  35.4 
 
 
545 aa  68.2  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0206236  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0674  hypothetical protein  30.82 
 
 
194 aa  67.4  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1802  acetyltransferase  36.69 
 
 
188 aa  67  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2893  acetyl transferase  36.21 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000824087  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1576  hexapaptide repeat-containing transferase  30.32 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0720  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  28.9 
 
 
228 aa  63.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.490723  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3106  acetyltransferase  29.17 
 
 
183 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.440449  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0455  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  29.06 
 
 
571 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2861  hexapaptide repeat-containing transferase  32.52 
 
 
209 aa  62.4  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4847  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.28 
 
 
550 aa  62  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0521363 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4281  acetyltransferase  30.77 
 
 
177 aa  61.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4847  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  33.82 
 
 
179 aa  61.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4905  hexapaptide repeat-containing transferase  31.65 
 
 
174 aa  61.2  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3541  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.71 
 
 
198 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4807  hypothetical protein  29.89 
 
 
233 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281149  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2439  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  28.66 
 
 
173 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1660  acetyltransferase  36.07 
 
 
175 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135233  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4918  hexapaptide repeat-containing transferase  32.33 
 
 
191 aa  59.3  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198536  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4339  hypothetical protein  36.79 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.257588  normal  0.0431137 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3242  hexapaptide repeat-containing transferase  33.58 
 
 
204 aa  58.5  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0883  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  30 
 
 
163 aa  58.2  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00414991  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0561  putative acetyltransferase  36.7 
 
 
166 aa  58.2  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0124634  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2852  hexapaptide repeat-containing transferase  30.77 
 
 
185 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1146  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.04 
 
 
183 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0055  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  33.33 
 
 
268 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2752  hexapaptide repeat-containing transferase  29.85 
 
 
204 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0296384  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1961  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  34.38 
 
 
214 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.11607  hitchhiker  0.0000808015 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1079  putative acetyltransferase  27.21 
 
 
177 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.770563  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2989  hexapaptide repeat-containing transferase  32.14 
 
 
185 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29453  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6417  hypothetical protein  31.18 
 
 
239 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701218  normal  0.982762 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0587  acetyltransferase  32.61 
 
 
219 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.307892  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13018  hypothetical protein  36.97 
 
 
170 aa  55.5  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.569461  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6221  putative acetyltransferase protein  30.64 
 
 
239 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67697  normal  0.119117 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1399  hexapaptide repeat-containing transferase  33.83 
 
 
209 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.272877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3855  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  36.36 
 
 
212 aa  54.7  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895064  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08990  hypothetical protein  37.5 
 
 
207 aa  54.3  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0933  hexapeptide repeat-containing transferase  33.12 
 
 
209 aa  53.9  0.0000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.201434  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3152  acetyltransferase  32.33 
 
 
209 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3978  acetyltransferase  32.03 
 
 
202 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.680257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6294  acetyltransferase  34.82 
 
 
191 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148142  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1480  acetyltransferase  28.47 
 
 
187 aa  53.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0355  transferase hexapeptide protein  32.06 
 
 
184 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1163  acetyltransferase  30.15 
 
 
204 aa  53.9  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00410  maltose O-acetyltransferase  30.6 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3151  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.6 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594832  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3157  maltose O-acetyltransferase  30.6 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5031  Maltose O-acetyltransferase  29.5 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0046  hypothetical protein  33.61 
 
 
220 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2456  chloramphenicol acetyltransferase  32.04 
 
 
219 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2961  nodulation protein L, putative  30.34 
 
 
207 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1952  acetyltransferase  35.83 
 
 
191 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.582602  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5070  hexapaptide repeat-containing transferase  42.22 
 
 
188 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.826071  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3001  hexapaptide repeat-containing transferase  32.33 
 
 
214 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0535  maltose O-acetyltransferase  30.6 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00415  hypothetical protein  30.6 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4442  maltose O-acetyltransferase  37.74 
 
 
185 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.260239 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3040  acetyltransferase  35.9 
 
 
255 aa  53.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.964066  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1810  hypothetical protein  34.78 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210295 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4774  maltose O-acetyltransferase  36.11 
 
 
186 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.789771  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1411  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 
209 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2880  chloramphenicol acetyltransferase  32.04 
 
 
219 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0494  maltose O-acetyltransferase  30.6 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2869  nodulation protein L, putative  31.5 
 
 
207 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2855  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 
212 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.2596  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3345  hexapaptide repeat-containing transferase  32.65 
 
 
209 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.972352  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0391  maltose O-acetyltransferase  30.6 
 
 
183 aa  52.4  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1504  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.58 
 
 
214 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272036  normal  0.496738 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0048  hypothetical protein  33.61 
 
 
220 aa  52.4  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2366  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.64 
 
 
174 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0758  acetyltransferase  31.53 
 
 
209 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  0.0152344 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2872  hexapaptide repeat-containing transferase  31.58 
 
 
214 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.61489  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1346  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 
209 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0185286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2095  hexapaptide repeat-containing transferase  33.04 
 
 
245 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2590  hexapaptide repeat-containing transferase  29.1 
 
 
209 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4264  hypothetical protein  34.78 
 
 
274 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5448  hexapaptide repeat-containing transferase  37.65 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.848437  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0549  maltose O-acetyltransferase  30.6 
 
 
183 aa  52  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.299767  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0502  maltose O-acetyltransferase  29.85 
 
 
183 aa  52  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0513  maltose O-acetyltransferase  31.25 
 
 
183 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000528215  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08610  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase/acetyltransferase  34.13 
 
 
198 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000385  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  33.06 
 
 
160 aa  52  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2517  hexapaptide repeat-containing transferase  32.09 
 
 
209 aa  52  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.467085  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3095  hexapaptide repeat-containing transferase  34.23 
 
 
239 aa  51.6  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.165073 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4492  hexapaptide repeat-containing transferase  34.62 
 
 
185 aa  51.6  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2543  acetyltransferase  30.66 
 
 
204 aa  51.6  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567485  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1864  putative transferase  32.17 
 
 
245 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13050  transferase  33.04 
 
 
284 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0120242 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1911  putative transferase  32.17 
 
 
245 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1845  putative transferase  32.17 
 
 
245 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.713416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>