More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1177 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1177  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  394  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02592  O-acetyltransferase  52.85 
 
 
192 aa  208  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2454  hypothetical protein  48.96 
 
 
202 aa  191  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0406418  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3056  hexapaptide repeat-containing transferase  43.23 
 
 
202 aa  156  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2207  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.6 
 
 
190 aa  154  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0674  hypothetical protein  44.44 
 
 
194 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4048  acetyltransferase  34.04 
 
 
214 aa  115  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2222  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2122  CheW protein  35.14 
 
 
168 aa  97.8  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0925774  normal  0.486668 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0163  putative acetyl transferase  41.05 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3715  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  46.94 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.780244  normal  0.0511861 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2691  galactoside O-acetyltransferase  35.17 
 
 
178 aa  77  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000193243  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2408  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.17 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0450  hexapaptide repeat-containing transferase  27.55 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.667735  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3855  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  39.29 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895064  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7339  transacetylase  38.26 
 
 
545 aa  73.2  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0206236  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3000  hexapaptide repeat-containing transferase  29.73 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4220  hexapaptide repeat-containing transferase  35.09 
 
 
241 aa  72  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5291  transferase hexapeptide repeat containing protein  47.95 
 
 
550 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.111996 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2439  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  33.13 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4281  acetyltransferase  30.86 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1722  hexapaptide repeat-containing transferase  30.63 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58644  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0817  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.71 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1672  acetyltransferase  32.43 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14160  putative acetyltransferase  35.25 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.0980452 
 
 
-
 
NC_003296  RS02346  putative acyl transferase protein  32.73 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.876426  normal  0.444308 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6269  putative acetyltransferase  31.97 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501907  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4144  hexapaptide repeat-containing transferase  34.15 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3106  acetyltransferase  42.53 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.440449  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1576  hexapaptide repeat-containing transferase  42.53 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2893  acetyl transferase  34.13 
 
 
240 aa  68.6  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000824087  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1258  transferase  35.25 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1079  putative acetyltransferase  32.64 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.770563  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1504  maltose O-acetyltransferase  37.84 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0449788  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1843  acetyltransferase  38.94 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0536  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.4 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0455  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  40.21 
 
 
571 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0423  acetyltransferase  32.24 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  hitchhiker  0.00641556 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3819  putative acetyltransferase (virginiamycin, streptogramin A, chloramphenicol)  55.56 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0731893  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4847  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.21 
 
 
550 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0521363 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0821  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  34.29 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.468594  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2869  nodulation protein L, putative  30.89 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3249  acetyltransferase  31.06 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1961  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  40 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.11607  hitchhiker  0.0000808015 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1706  putative acetyltransferase  41.18 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.558833  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0587  acetyltransferase  37.61 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.307892  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87610  predicted protein  41.94 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.568532  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2566  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.11 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4847  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  34.19 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2895  putative acetyltransferase  40.91 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2830  acetyltransferase  30.28 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00579309  normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0332  putative acetyltransferase  57.69 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130953  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0346  putative acetyltransferase  57.69 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.735095 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1500  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  32.73 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2961  nodulation protein L, putative  40.35 
 
 
207 aa  64.7  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0769  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  53.7 
 
 
225 aa  64.3  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0913  chloramphenicol acetyltransferase  52.73 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4083  hexapaptide repeat-containing transferase  53.7 
 
 
221 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636222  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1864  putative transferase  28.09 
 
 
245 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1845  putative transferase  28.09 
 
 
245 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.713416 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1911  putative transferase  28.09 
 
 
245 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0123  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  38.05 
 
 
178 aa  63.2  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2197  putative sugar acetyltransferase  34.75 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2880  putative lipopolysaccharide biosynthesis O-acetyl transferase WbbJ  32.8 
 
 
176 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1260  maltose O-acetyltransferase  32.19 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3187  hexapaptide repeat-containing transferase  29.63 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4244  hexapaptide repeat-containing transferase  35.71 
 
 
187 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.587532  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3784  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.21 
 
 
181 aa  63.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4614  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.71 
 
 
187 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000385  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  33.33 
 
 
160 aa  63.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4589  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.82 
 
 
241 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4764  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.11 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.935522 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1390  hexapaptide repeat-containing transferase  33.73 
 
 
163 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0276639 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0959  hexapaptide repeat-containing transferase  32.88 
 
 
267 aa  63.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.642505  normal  0.321102 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06836  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family (AFU_orthologue; AFUA_2G08430)  39.47 
 
 
244 aa  62.8  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2366  transferase hexapeptide repeat containing protein  28.9 
 
 
174 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0245  hexapaptide repeat-containing transferase  34.84 
 
 
227 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4264  hypothetical protein  28.18 
 
 
274 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3040  acetyltransferase  41.96 
 
 
255 aa  62.4  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.964066  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0055  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  32.73 
 
 
268 aa  62.4  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4492  hexapaptide repeat-containing transferase  37.36 
 
 
185 aa  62.4  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4918  hexapaptide repeat-containing transferase  31.54 
 
 
191 aa  62.4  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198536  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1486  isoleucine patch superfamily acetyltransferase-like protein  27.22 
 
 
278 aa  62  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2883  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  29.45 
 
 
199 aa  62  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4774  maltose O-acetyltransferase  38.46 
 
 
186 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.789771  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1384  streptogramin A acetyl transferase  60.38 
 
 
226 aa  61.6  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0253879 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3169  streptogramin A acetyl transferase  40.21 
 
 
213 aa  61.6  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.210498  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2849  putative acetyltransferase  35.65 
 
 
187 aa  61.6  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  36.94 
 
 
194 aa  61.6  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560945  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4433  putative acetyltransferase (virginiamycin, streptogramin A, chloramphenicol)  35.92 
 
 
226 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4911  maltose O-acetyltransferase  30.67 
 
 
183 aa  61.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5031  Maltose O-acetyltransferase  35.4 
 
 
183 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2989  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  28.92 
 
 
284 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685626  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6061  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  31.36 
 
 
248 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1155  transferase hexapeptide repeat containing protein  44 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0378081  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0703  Maltose O-acetyltransferase  37.76 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998989  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2526  streptogramin A acetyl transferase  59.62 
 
 
167 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0420  putative acetyltransferase  37 
 
 
241 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.857208  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28390  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  32.2 
 
 
244 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2095  hexapaptide repeat-containing transferase  26.97 
 
 
245 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6221  putative acetyltransferase protein  32 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67697  normal  0.119117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>