More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1155 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_1155  transferase hexapeptide repeat containing protein  100 
 
 
219 aa  453  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0378081  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2049  VatB  40.1 
 
 
211 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2073  VatB  40.1 
 
 
211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0183643  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3259  putative acetyltransferase  46.51 
 
 
206 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3248  chloramphenicol acetyltransferase  40.59 
 
 
185 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000882178  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3304  acetyltransferase  40 
 
 
185 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000354114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3254  acetyltransferase  40 
 
 
185 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00705468  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04620  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  38.07 
 
 
218 aa  135  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3559  acetyltransferase  40.59 
 
 
185 aa  135  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00169424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3653  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  40.59 
 
 
185 aa  134  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3169  streptogramin A acetyl transferase  38.54 
 
 
213 aa  134  9e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.210498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3339  acetyltransferase  39.41 
 
 
185 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00224861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3600  acetyltransferase  39.41 
 
 
185 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000293004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1664  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  40.59 
 
 
185 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000881874  hitchhiker  1.93873e-17 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2320  chloramphenicol O-acetyltransferase  43.16 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3563  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  38.82 
 
 
185 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000342506  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4299  chloramphenicol acetyltransferase  44.59 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0704  chloramphenicol O-acetyltransferase  38.61 
 
 
211 aa  133  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.191265  normal  0.790707 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0332  putative acetyltransferase  46.62 
 
 
214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130953  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0346  putative acetyltransferase  46.62 
 
 
214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.735095 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4048  acetyltransferase  38.58 
 
 
209 aa  131  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.638 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1706  putative acetyltransferase  46.62 
 
 
214 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.558833  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0600  hexapaptide repeat-containing transferase  43.95 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.152008  normal  0.590208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1331  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  38.76 
 
 
195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.956774  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2950  chloramphenicol O-acetyltransferase  43.92 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359614  normal  0.149612 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0155  hexapaptide repeat-containing transferase  35.44 
 
 
212 aa  129  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479916 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0587  acetyltransferase  41.76 
 
 
219 aa  129  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.307892  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1147  acetyltransferase  34.72 
 
 
213 aa  128  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2450  acetyltransferase  43.87 
 
 
210 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.602654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2629  acetyltransferase  43.87 
 
 
210 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2866  streptogramin A acetyl transferase  39.02 
 
 
218 aa  128  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.72072  normal  0.603625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4504  streptogramin A acetyl transferase  36.54 
 
 
216 aa  127  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0223  hexapaptide repeat-containing transferase  42.04 
 
 
226 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2656  acetyltransferase  42.58 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15233  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000997  acetyltransferase  40.26 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2536  hypothetical protein  36.32 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107266  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1181  antibiotic acetyltransferase  43.05 
 
 
240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0246811  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2698  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  43.62 
 
 
209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.832761  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  43.31 
 
 
226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.476323  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1536  putative chloramphenicol acetyltransferase  41.51 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000290239  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2233  Chloramphenicol O-acetyltransferase  42.48 
 
 
213 aa  125  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0104377  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3561  hexapaptide repeat-containing transferase  41.67 
 
 
211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.367656  normal  0.425944 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2375  virginiamycin A acetyltransferase  44.97 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.462397  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0913  chloramphenicol acetyltransferase  43.87 
 
 
212 aa  125  5e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2412  virginiamycin A acetyltransferase  43.87 
 
 
210 aa  125  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2647  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  43.23 
 
 
210 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000095527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5872  streptogramin A acetyl transferase  34.91 
 
 
221 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1600  hexapaptide repeat-containing transferase  33.5 
 
 
218 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000573546  normal  0.406168 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2511  virginiamycin A acetyltransferase  41.61 
 
 
213 aa  124  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.153817  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4496  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  37.25 
 
 
212 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0391  streptogramin A acetyl transferase  41.45 
 
 
216 aa  123  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2671  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  41.29 
 
 
210 aa  123  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0117743 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0377  hexapaptide repeat-containing transferase  36.59 
 
 
212 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208373  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2303  hexapaptide repeat-containing transferase  43.05 
 
 
219 aa  123  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.025404  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1569  hexapaptide repeat-containing transferase  33.17 
 
 
218 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2456  chloramphenicol acetyltransferase  43.05 
 
 
219 aa  122  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2780  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.17 
 
 
218 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737809  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1461  hexapaptide repeat-containing transferase  40 
 
 
218 aa  122  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1763  streptogramin A acetyl transferase  33.5 
 
 
225 aa  122  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2653  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  41.29 
 
 
210 aa  122  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5557  hexapaptide repeat-containing transferase  43.71 
 
 
219 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102322 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2593  streptogramin A acetyl transferase  34.47 
 
 
224 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1678  hypothetical protein  40.27 
 
 
211 aa  122  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1998  chloramphenicol acetyltransferase  39.74 
 
 
213 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.427174  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2880  chloramphenicol acetyltransferase  42.38 
 
 
219 aa  121  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0665  hexapaptide repeat-containing transferase  40.88 
 
 
226 aa  121  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1388  hexapaptide repeat-containing transferase  38.71 
 
 
211 aa  121  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.220754  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07054  acetyltransferase  40.13 
 
 
217 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2692  streptogramin A acetyl transferase  34.47 
 
 
224 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1384  streptogramin A acetyl transferase  42.11 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0253879 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0994  acetyltransferase  35.44 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2289  hexapaptide repeat-containing transferase  37.18 
 
 
216 aa  119  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2526  streptogramin A acetyl transferase  40.65 
 
 
167 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1563  hexapaptide repeat-containing transferase  33 
 
 
218 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0116  hexapaptide repeat-containing transferase  40 
 
 
211 aa  119  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278258  hitchhiker  0.00730231 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1762  hexapaptide repeat-containing transferase  44.37 
 
 
210 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1978  hexapaptide repeat-containing transferase  40 
 
 
221 aa  118  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.811569  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1415  antibiotic acetyltransferase  47.97 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.241418  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0749  chloramphenicol acetyltransferase  37.84 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.408816 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2973  streptogramin A acetyl transferase  35.32 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4229  chloramphenicol O-acetyltransferase  38.99 
 
 
215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4361  chloramphenicol O-acetyltransferase  38.99 
 
 
215 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4157  Chloramphenicol O-acetyltransferase  38.99 
 
 
215 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1494  chloramphenicol O-acetyltransferase  39.74 
 
 
218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00845499  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4944  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  40.25 
 
 
174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1883  hypothetical protein  33.83 
 
 
213 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2793  putative chloramphenicol acetyltransferase  38.41 
 
 
210 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0933  hexapeptide repeat-containing transferase  48.51 
 
 
209 aa  114  8.999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.201434  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1991  antibiotic acetyltransferase  42.76 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0738  hexapaptide repeat-containing transferase  43.48 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12843  normal  0.0447634 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0769  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  44.37 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2701  streptogramin A acetyltransferase  39.52 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97222  normal  0.589096 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0977  antibiotic acetyltransferase  39.22 
 
 
232 aa  112  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0046  hypothetical protein  37.11 
 
 
220 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04310  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  36.18 
 
 
220 aa  112  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0499  chloramphenicol acetyltransferase  41.07 
 
 
220 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0495191  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0591  acetyltransferase  41.38 
 
 
218 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2823  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.59 
 
 
217 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.469559  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0826  chloramphenicol acetyltransferase  36.72 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal  0.229885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2927  streptogramin A acetyltransferase  39.05 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0622049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>