More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3819 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_3819  putative acetyltransferase (virginiamycin, streptogramin A, chloramphenicol)  100 
 
 
258 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0731893  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4083  hexapaptide repeat-containing transferase  87.27 
 
 
221 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636222  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0769  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  82.19 
 
 
225 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5859  putative acetyltransferase  81.55 
 
 
220 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.139039  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4433  putative acetyltransferase (virginiamycin, streptogramin A, chloramphenicol)  72.04 
 
 
226 aa  331  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1753  putative acetyltransferase  68.97 
 
 
209 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2921  hexapeptide repeat-containing phosphonate metabolisn transferase  68.97 
 
 
205 aa  266  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0821  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  55.5 
 
 
201 aa  236  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.468594  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4432  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  49.76 
 
 
205 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4229  hexapaptide repeat-containing transferase  51.72 
 
 
204 aa  218  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4118  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  49.25 
 
 
205 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3705  hexapaptide repeat-containing transferase  49.5 
 
 
204 aa  209  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0138  transferase hexapeptide protein  47.57 
 
 
215 aa  208  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0182883  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2190  putative acetyltransferase protein  52.58 
 
 
218 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.216919  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0513  putative acetyltransferase (virginiamycin, streptogramin A, chloramphenicol)  52.28 
 
 
200 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1762  hexapaptide repeat-containing transferase  47.98 
 
 
210 aa  202  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0277  acetyltransferase  54.68 
 
 
207 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.79326  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3571  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  49.03 
 
 
220 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.414497  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1991  antibiotic acetyltransferase  49.49 
 
 
207 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0933  hexapeptide repeat-containing transferase  47.21 
 
 
209 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.201434  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1415  antibiotic acetyltransferase  50.51 
 
 
229 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.241418  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3451  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  47.37 
 
 
215 aa  195  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164675  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0072  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  47.42 
 
 
209 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0913  chloramphenicol acetyltransferase  41.18 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4944  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  37.79 
 
 
174 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1978  hexapaptide repeat-containing transferase  38.82 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.811569  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3559  acetyltransferase  36.13 
 
 
185 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00169424  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3248  chloramphenicol acetyltransferase  36.77 
 
 
185 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000882178  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3653  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  36.77 
 
 
185 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3563  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  34.84 
 
 
185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000342506  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2073  VatB  39.26 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0183643  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2049  VatB  38.52 
 
 
211 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1664  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  36.13 
 
 
185 aa  108  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000881874  hitchhiker  1.93873e-17 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0994  acetyltransferase  41.48 
 
 
210 aa  108  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0332  putative acetyltransferase  45.59 
 
 
214 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130953  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0346  putative acetyltransferase  45.59 
 
 
214 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.735095 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4048  acetyltransferase  40.74 
 
 
209 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.638 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1706  putative acetyltransferase  45.59 
 
 
214 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.558833  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1575  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 
239 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3561  hexapaptide repeat-containing transferase  40.24 
 
 
211 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.367656  normal  0.425944 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3304  acetyltransferase  37.25 
 
 
185 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000354114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3254  acetyltransferase  37.25 
 
 
185 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00705468  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2973  streptogramin A acetyl transferase  42.65 
 
 
217 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1384  streptogramin A acetyl transferase  37.97 
 
 
226 aa  106  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0253879 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1155  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.7 
 
 
219 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0378081  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0391  streptogramin A acetyl transferase  38.52 
 
 
216 aa  106  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5557  hexapaptide repeat-containing transferase  35.44 
 
 
219 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102322 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2880  chloramphenicol acetyltransferase  36.08 
 
 
219 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2593  streptogramin A acetyl transferase  40.58 
 
 
224 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3169  streptogramin A acetyl transferase  37.84 
 
 
213 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.210498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3339  acetyltransferase  36.6 
 
 
185 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00224861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3600  acetyltransferase  36.6 
 
 
185 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000293004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2456  chloramphenicol acetyltransferase  36.08 
 
 
219 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1334  putative acetyltransferase  36.36 
 
 
257 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1258  transferase  37.82 
 
 
229 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1181  antibiotic acetyltransferase  43.48 
 
 
240 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0246811  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1763  streptogramin A acetyl transferase  39.42 
 
 
225 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2233  Chloramphenicol O-acetyltransferase  31.71 
 
 
213 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0104377  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0420  putative acetyltransferase  35.07 
 
 
241 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.857208  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2526  streptogramin A acetyl transferase  39.86 
 
 
167 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0155  hexapaptide repeat-containing transferase  39.26 
 
 
212 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479916 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0587  acetyltransferase  38.1 
 
 
219 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.307892  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2536  hypothetical protein  43.65 
 
 
212 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107266  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2692  streptogramin A acetyl transferase  40.58 
 
 
224 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2303  hexapaptide repeat-containing transferase  35.44 
 
 
219 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.025404  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0600  hexapaptide repeat-containing transferase  36.05 
 
 
226 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.152008  normal  0.590208 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0223  hexapaptide repeat-containing transferase  36.05 
 
 
226 aa  102  6e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0377  hexapaptide repeat-containing transferase  37.5 
 
 
212 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208373  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2866  streptogramin A acetyl transferase  39.53 
 
 
218 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.72072  normal  0.603625 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2950  chloramphenicol O-acetyltransferase  40.15 
 
 
210 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359614  normal  0.149612 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4299  chloramphenicol acetyltransferase  41.61 
 
 
210 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1494  chloramphenicol O-acetyltransferase  40.15 
 
 
218 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00845499  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1600  hexapaptide repeat-containing transferase  38.52 
 
 
218 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000573546  normal  0.406168 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1569  hexapaptide repeat-containing transferase  37.78 
 
 
218 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1563  hexapaptide repeat-containing transferase  38.24 
 
 
218 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1536  putative chloramphenicol acetyltransferase  38.69 
 
 
208 aa  99.8  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000290239  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1162  acetyltransferase  31.63 
 
 
202 aa  99.4  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00728294  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2756  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  34.12 
 
 
220 aa  99  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.801902  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14160  putative acetyltransferase  36.79 
 
 
229 aa  99  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.0980452 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2780  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.78 
 
 
218 aa  98.6  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737809  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1461  hexapaptide repeat-containing transferase  38.52 
 
 
218 aa  98.6  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04620  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  44.19 
 
 
218 aa  98.2  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1388  hexapaptide repeat-containing transferase  41.84 
 
 
211 aa  98.2  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.220754  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1678  hypothetical protein  33.16 
 
 
211 aa  97.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3901  hexapaptide repeat-containing transferase  37.91 
 
 
196 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0602656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3259  putative acetyltransferase  36.84 
 
 
206 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0738  hexapaptide repeat-containing transferase  39.58 
 
 
217 aa  96.3  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12843  normal  0.0447634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4504  streptogramin A acetyl transferase  41.73 
 
 
216 aa  95.9  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  32.65 
 
 
226 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.476323  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2289  hexapaptide repeat-containing transferase  39.71 
 
 
216 aa  95.1  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2793  putative chloramphenicol acetyltransferase  35.29 
 
 
210 aa  94.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0147  capsular polysaccharide synthesis enzyme O-acetyl transferase Cap5H, putative  31.97 
 
 
208 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0704  chloramphenicol O-acetyltransferase  37.04 
 
 
211 aa  94  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.191265  normal  0.790707 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0142  acetyltransferase  31.97 
 
 
208 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5872  streptogramin A acetyl transferase  32.3 
 
 
221 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000997  acetyltransferase  34.67 
 
 
219 aa  93.6  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1998  chloramphenicol acetyltransferase  32.1 
 
 
213 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.427174  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0116  hexapaptide repeat-containing transferase  36.67 
 
 
211 aa  92.4  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278258  hitchhiker  0.00730231 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2823  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.29 
 
 
217 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.469559  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4496  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  35.1 
 
 
212 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>