More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3040 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3040  acetyltransferase  100 
 
 
255 aa  508  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.964066  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5775  transferase hexapeptide repeat containing protein  56.42 
 
 
231 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6417  hypothetical protein  58.72 
 
 
239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701218  normal  0.982762 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4807  hypothetical protein  58.8 
 
 
233 aa  249  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281149  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6221  putative acetyltransferase protein  55.05 
 
 
239 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67697  normal  0.119117 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4982  hypothetical protein  40.62 
 
 
170 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.659232 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2691  galactoside O-acetyltransferase  33.16 
 
 
178 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000193243  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3106  acetyltransferase  42.39 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.440449  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1952  acetyltransferase  39.81 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.582602  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1576  hexapaptide repeat-containing transferase  40 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0423  acetyltransferase  35.71 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  hitchhiker  0.00641556 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0913  chloramphenicol acetyltransferase  58.7 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1802  acetyltransferase  30.51 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0131  acetyltransferase  41.74 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02592  O-acetyltransferase  40.87 
 
 
192 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3784  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.57 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3187  hexapaptide repeat-containing transferase  31.82 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4918  hexapaptide repeat-containing transferase  33.9 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198536  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7339  transacetylase  33.57 
 
 
545 aa  69.3  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0206236  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1673  transferase hexapeptide repeat containing protein  50.67 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160587  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2162  maltose O-acetyltransferase  35.29 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.225842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2194  hypothetical protein  39.82 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  decreased coverage  0.00108321 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0455  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  35.17 
 
 
571 aa  68.9  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4804  hexapaptide repeat-containing transferase  49.3 
 
 
166 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159641  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2073  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.62 
 
 
187 aa  67.8  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4589  transferase hexapeptide repeat containing protein  24.88 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  34.69 
 
 
194 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560945  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6224  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.55 
 
 
168 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.164318 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0163  putative acetyl transferase  30.54 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2197  putative sugar acetyltransferase  33.55 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0030  hypothetical protein  32.41 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0213318  hitchhiker  0.00700368 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4506  hexapaptide repeat-containing transferase  30.95 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.039815  normal  0.175474 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2895  putative acetyltransferase  36.28 
 
 
198 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1486  isoleucine patch superfamily acetyltransferase-like protein  31.66 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  28.75 
 
 
217 aa  67  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4214  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.36 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28390  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  32.89 
 
 
244 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1396  acetyltransferase  35.76 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1843  acetyltransferase  31.58 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1575  hexapaptide repeat-containing transferase  33.73 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0821  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  56.6 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.468594  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0936  hexapaptide repeat-containing transferase  25.3 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5772  transferase hexapeptide repeat containing protein  54.39 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1672  acetyltransferase  40.52 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0578  transferase hexapeptide repeat containing protein  29.94 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.566139  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0587  acetyltransferase  37.6 
 
 
219 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.307892  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4244  hexapaptide repeat-containing transferase  62.5 
 
 
187 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.587532  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2531  hexapaptide repeat-containing transferase  46.58 
 
 
179 aa  64.7  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0941217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7631  putative acetyltransferase  38.16 
 
 
206 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196092  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4614  transferase hexapeptide repeat containing protein  62.5 
 
 
187 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0602  hypothetical protein  36.36 
 
 
198 aa  64.7  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.774795  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3561  hexapaptide repeat-containing transferase  71.43 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.367656  normal  0.425944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4612  hexapaptide repeat-containing transferase  68.09 
 
 
182 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.796744  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5291  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.88 
 
 
550 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.111996 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4039  maltose O-acetyltransferase  34.78 
 
 
191 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.184379 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3038  hexapaptide repeat-containing transferase  54.39 
 
 
169 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1864  putative transferase  32.59 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1390  hexapaptide repeat-containing transferase  38.32 
 
 
163 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0276639 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4847  transferase hexapeptide repeat containing protein  29.45 
 
 
550 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0521363 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2688  transferase hexapeptide repeat containing protein  58.06 
 
 
198 aa  63.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00225103  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1911  putative transferase  32.59 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2849  putative acetyltransferase  33.99 
 
 
187 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1845  putative transferase  32.59 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.713416 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3692  acetyltransferase  67.39 
 
 
250 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0357  transferase hexapeptide repeat containing protein  59.62 
 
 
192 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2683  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  36.3 
 
 
240 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000102069  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0078  transferase hexapeptide repeat containing protein  60.38 
 
 
244 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3011  hexapaptide repeat-containing transferase  35.11 
 
 
192 aa  63.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3027  WxcM-like protein  54 
 
 
153 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0683597  normal  0.28553 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3559  acetyltransferase  61.22 
 
 
185 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00169424  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1136  acetyltransferase  31.61 
 
 
240 aa  63.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2408  transferase hexapeptide repeat containing protein  28.87 
 
 
186 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4083  hexapaptide repeat-containing transferase  65.22 
 
 
221 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636222  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3653  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  61.22 
 
 
185 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0895  hexapaptide repeat-containing transferase  53.45 
 
 
202 aa  63.2  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4764  transferase hexapeptide repeat containing protein  60.42 
 
 
187 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.935522 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0169  hexapaptide repeat-containing transferase  32.93 
 
 
254 aa  62.8  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0546103  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0577  transferase hexapeptide repeat containing protein  48.53 
 
 
194 aa  62.8  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12060  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  34.46 
 
 
193 aa  62.8  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3248  chloramphenicol acetyltransferase  59.18 
 
 
185 aa  62.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000882178  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4516  maltose O-acetyltransferase protein  41.96 
 
 
182 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17584  normal  0.0230348 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6420  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.67 
 
 
167 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1814  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2-carboxylate N-succinyltransferase  56.6 
 
 
232 aa  62.4  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000825508  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3563  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  59.18 
 
 
185 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000342506  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4185  hexapaptide repeat-containing transferase  32.4 
 
 
186 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3722  hypothetical protein  53.33 
 
 
195 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3583  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.63 
 
 
193 aa  62.4  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1177  hypothetical protein  41.96 
 
 
193 aa  62.4  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4264  hypothetical protein  31.11 
 
 
274 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1900  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  63.04 
 
 
236 aa  62.4  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1660  acetyltransferase  32.61 
 
 
175 aa  62  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135233  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2989  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  34.11 
 
 
284 aa  62  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685626  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3254  acetyltransferase  57.14 
 
 
185 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00705468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1664  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  59.18 
 
 
185 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000881874  hitchhiker  1.93873e-17 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1079  putative acetyltransferase  35.71 
 
 
177 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.770563  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0290  acetyltransferase  33.82 
 
 
194 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  33.13 
 
 
196 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0668  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-succinyltransferase  58.49 
 
 
233 aa  61.6  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  30.87 
 
 
189 aa  61.6  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.532773  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5875  chloramphenicol acetyltransferase  40.82 
 
 
200 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0086312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>