More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4807 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4807  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  466  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6417  hypothetical protein  74.45 
 
 		 239 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701218  normal  0.982762 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6221  putative acetyltransferase protein  72.69 
 
 		 239 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67697  normal  0.119117 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5775  transferase hexapeptide repeat containing protein  65 
 
 		 231 aa  303  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3040  acetyltransferase  58.8 
 
 		 255 aa  249  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.964066  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4982  hypothetical protein  42.86 
 
 		 170 aa  116  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.659232 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3000  hexapaptide repeat-containing transferase  30.32 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1952  acetyltransferase  44.25 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.582602  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2408  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.79 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0577  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.93 
 
 		 194 aa  75.1  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2691  galactoside O-acetyltransferase  30.06 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000193243  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3106  acetyltransferase  40.35 
 
 		 183 aa  72  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.440449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4804  hexapaptide repeat-containing transferase  36.2 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1576  hexapaptide repeat-containing transferase  39.47 
 
 		 179 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2547  putative acetyltransferase  30.87 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1136  acetyltransferase  32.35 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1802  acetyltransferase  32.16 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2194  hypothetical protein  41.9 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  decreased coverage  0.00108321 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1079  putative acetyltransferase  38.53 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.770563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2143  hexapaptide repeat-containing transferase  35.76 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.748162 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4589  transferase hexapeptide repeat containing protein  23.94 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0131  acetyltransferase  30.93 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1029  hexapaptide repeat-containing transferase  38.46 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6420  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.76 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2232  hexapaptide repeat-containing transferase  36.75 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0895  hexapaptide repeat-containing transferase  36.81 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0002  hexapeptide transferase family protein  39.84 
 
 		 190 aa  68.2  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123717 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1900  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  71.74 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3038  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 		 169 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1390  hexapaptide repeat-containing transferase  32.4 
 
 		 163 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0276639 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1722  hexapaptide repeat-containing transferase  31.25 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58644  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1421  hexapaptide repeat-containing transferase  40.31 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4862  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.93 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290079  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5772  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.15 
 
 		 168 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0251  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  33.83 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2258  putative acetyltransferase  36.25 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0569631  hitchhiker  0.00196203 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2046  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.8 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0357  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.42 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0355  transferase hexapeptide protein  40.87 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  37.16 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.532773  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0541  hexapaptide repeat-containing transferase  35.43 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2643  hexapaptide repeat-containing transferase  33.72 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2849  putative acetyltransferase  33.93 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3784  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.07 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0973  hexapaptide repeat-containing transferase  35.29 
 
 		 160 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0161902  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0913  chloramphenicol acetyltransferase  60.87 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3187  hexapaptide repeat-containing transferase  30.56 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1147  acetyltransferase  60.78 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4905  hexapaptide repeat-containing transferase  29.87 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1673  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.81 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160587  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1222  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  51.72 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6224  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.78 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.164318 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0605  hexapaptide repeat-containing transferase  36.56 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51526  normal  0.572168 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2961  nodulation protein L, putative  32.14 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0120  hexapaptide repeat-containing transferase  33.12 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4612  hexapaptide repeat-containing transferase  53.52 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.796744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2869  nodulation protein L, putative  31.43 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1331  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  60.78 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.956774  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3011  hexapaptide repeat-containing transferase  32.93 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0721  galactoside-O-acetyltransferase  38.94 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0542567  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0766  nodulation protein L  42.11 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352281  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0936  hexapaptide repeat-containing transferase  25.73 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3128  putative acetyltransferase WbpD  36.2 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1901  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.15 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1672  acetyltransferase  40.35 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4185  hexapaptide repeat-containing transferase  37.82 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4144  hexapaptide repeat-containing transferase  30.67 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2162  maltose O-acetyltransferase  35.33 
 
 		 184 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.225842 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0476  hexapaptide repeat-containing transferase  32.72 
 
 		 193 aa  62  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.269907  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1398  hexapaptide repeat-containing transferase  37.06 
 
 		 179 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.453151 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0413  acetyl/acyl transferase related protein  32.21 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1843  acetyltransferase  33.33 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4847  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  31.71 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5179  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.92 
 
 		 192 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3692  acetyltransferase  62.75 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0123  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  33.33 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0933  hexapeptide repeat-containing transferase  65.22 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.201434  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2073  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.62 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3027  WxcM-like protein  37.96 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0683597  normal  0.28553 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  35.4 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2895  putative acetyltransferase  33.33 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1849  putative acetyltransferase  32.93 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.291377 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1298  putative acetyltransferase  33.82 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.248019  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1859  Serine acetyltransferase-like protein  33.54 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0587  acetyltransferase  58.7 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.307892  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2122  CheW protein  29.89 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0925774  normal  0.486668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4614  transferase hexapeptide repeat containing protein  64.44 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3315  hexapaptide repeat-containing transferase  35.62 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4516  maltose O-acetyltransferase protein  39.13 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17584  normal  0.0230348 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0455  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  34.93 
 
 		 571 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0040  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.71 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4244  hexapaptide repeat-containing transferase  64.44 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.587532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1396  acetyltransferase  34.64 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  34.92 
 
 		 517 aa  60.5  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1022  hexapaptide repeat-containing transferase  34.18 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4214  transferase hexapeptide repeat containing protein  30 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  31.4 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0302  hexapaptide repeat-containing transferase  38.6 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.145068 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87610  predicted protein  30.13 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.568532  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1181  antibiotic acetyltransferase  56.25 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0246811  normal  0.254871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>