More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2526 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2526  streptogramin A acetyl transferase  100 
 
 
167 aa  343  6e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2593  streptogramin A acetyl transferase  96.41 
 
 
224 aa  332  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2692  streptogramin A acetyl transferase  95.21 
 
 
224 aa  328  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1763  streptogramin A acetyl transferase  89.82 
 
 
225 aa  314  5e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1563  hexapaptide repeat-containing transferase  86.71 
 
 
218 aa  289  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1461  hexapaptide repeat-containing transferase  84.81 
 
 
218 aa  283  7e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2780  transferase hexapeptide repeat containing protein  83.75 
 
 
218 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737809  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1600  hexapaptide repeat-containing transferase  83.54 
 
 
218 aa  279  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000573546  normal  0.406168 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1569  hexapaptide repeat-containing transferase  83.54 
 
 
218 aa  277  6e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0155  hexapaptide repeat-containing transferase  72.84 
 
 
212 aa  252  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479916 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2973  streptogramin A acetyl transferase  70.51 
 
 
217 aa  240  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0391  streptogramin A acetyl transferase  70.51 
 
 
216 aa  238  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0704  chloramphenicol O-acetyltransferase  68.75 
 
 
211 aa  235  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.191265  normal  0.790707 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1384  streptogramin A acetyl transferase  68.35 
 
 
226 aa  227  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0253879 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3169  streptogramin A acetyl transferase  65.62 
 
 
213 aa  226  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.210498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2653  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  62.35 
 
 
210 aa  215  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2671  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  62.35 
 
 
210 aa  215  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0117743 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2656  acetyltransferase  61.73 
 
 
210 aa  214  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2450  acetyltransferase  61.73 
 
 
210 aa  214  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.602654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2629  acetyltransferase  61.73 
 
 
210 aa  214  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2698  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  62.89 
 
 
209 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.832761  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0994  acetyltransferase  66.45 
 
 
210 aa  213  7e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2647  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  61.11 
 
 
210 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000095527 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2511  virginiamycin A acetyltransferase  61.64 
 
 
213 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.153817  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2375  virginiamycin A acetyltransferase  61.73 
 
 
210 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.462397  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2412  virginiamycin A acetyltransferase  61.11 
 
 
210 aa  209  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117387  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2073  VatB  63.75 
 
 
211 aa  206  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0183643  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2049  VatB  63.12 
 
 
211 aa  205  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1678  hypothetical protein  56.6 
 
 
211 aa  204  6e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4048  acetyltransferase  61.88 
 
 
209 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.638 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2233  Chloramphenicol O-acetyltransferase  55.35 
 
 
213 aa  202  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0104377  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0377  hexapaptide repeat-containing transferase  57.32 
 
 
212 aa  197  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208373  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2823  transferase hexapeptide repeat containing protein  56.17 
 
 
217 aa  183  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.469559  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2927  streptogramin A acetyltransferase  56.17 
 
 
217 aa  181  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2701  streptogramin A acetyltransferase  54.94 
 
 
217 aa  180  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97222  normal  0.589096 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2536  hypothetical protein  51.88 
 
 
212 aa  175  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107266  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1978  hexapaptide repeat-containing transferase  53.12 
 
 
221 aa  175  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.811569  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2866  streptogramin A acetyl transferase  51.57 
 
 
218 aa  171  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.72072  normal  0.603625 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0635  transferase hexapeptide protein  58.6 
 
 
214 aa  171  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4504  streptogramin A acetyl transferase  51.88 
 
 
216 aa  171  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1883  hypothetical protein  50 
 
 
213 aa  167  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04620  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  48.41 
 
 
218 aa  165  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5872  streptogramin A acetyl transferase  48.43 
 
 
221 aa  164  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04310  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  50 
 
 
220 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0600  hexapaptide repeat-containing transferase  51.85 
 
 
226 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.152008  normal  0.590208 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0223  hexapaptide repeat-containing transferase  50.62 
 
 
226 aa  158  3e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  50 
 
 
226 aa  155  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.476323  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1706  putative acetyltransferase  49.33 
 
 
214 aa  151  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.558833  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0332  putative acetyltransferase  47.13 
 
 
214 aa  151  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130953  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0346  putative acetyltransferase  47.13 
 
 
214 aa  151  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.735095 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0665  hexapaptide repeat-containing transferase  50 
 
 
226 aa  149  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4299  chloramphenicol acetyltransferase  47.68 
 
 
210 aa  144  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2950  chloramphenicol O-acetyltransferase  45.03 
 
 
210 aa  141  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359614  normal  0.149612 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1494  chloramphenicol O-acetyltransferase  45.7 
 
 
218 aa  140  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00845499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3559  acetyltransferase  47.13 
 
 
185 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00169424  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1181  antibiotic acetyltransferase  44.97 
 
 
240 aa  136  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0246811  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0799  putative acetyltransferase  69.66 
 
 
105 aa  136  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1388  hexapaptide repeat-containing transferase  45.64 
 
 
211 aa  135  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.220754  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3248  chloramphenicol acetyltransferase  43.87 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000882178  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2320  chloramphenicol O-acetyltransferase  45.62 
 
 
213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1664  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  46.5 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000881874  hitchhiker  1.93873e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3653  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  47.13 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3304  acetyltransferase  46.2 
 
 
185 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000354114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3254  acetyltransferase  46.2 
 
 
185 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00705468  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3561  hexapaptide repeat-containing transferase  47.3 
 
 
211 aa  134  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.367656  normal  0.425944 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1998  chloramphenicol acetyltransferase  45.28 
 
 
213 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.427174  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3339  acetyltransferase  46.2 
 
 
185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00224861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3600  acetyltransferase  46.2 
 
 
185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000293004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3563  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  45.89 
 
 
185 aa  131  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000342506  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2289  hexapaptide repeat-containing transferase  43.33 
 
 
216 aa  128  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3259  putative acetyltransferase  40.41 
 
 
206 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000997  acetyltransferase  42.95 
 
 
219 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07054  acetyltransferase  44.38 
 
 
217 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0116  hexapaptide repeat-containing transferase  43.51 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278258  hitchhiker  0.00730231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2793  putative chloramphenicol acetyltransferase  47.3 
 
 
210 aa  125  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1536  putative chloramphenicol acetyltransferase  42.57 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000290239  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0587  acetyltransferase  49.63 
 
 
219 aa  122  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.307892  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0738  hexapaptide repeat-containing transferase  46.09 
 
 
217 aa  121  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12843  normal  0.0447634 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1155  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.65 
 
 
219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0378081  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5557  hexapaptide repeat-containing transferase  45.27 
 
 
219 aa  118  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102322 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2880  chloramphenicol acetyltransferase  44.59 
 
 
219 aa  117  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3345  hexapaptide repeat-containing transferase  42.04 
 
 
209 aa  116  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.972352  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000461  antibiotic acetyltransferase  42.86 
 
 
214 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2303  hexapaptide repeat-containing transferase  47.14 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.025404  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1331  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  40.14 
 
 
195 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.956774  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2456  chloramphenicol acetyltransferase  43.92 
 
 
219 aa  115  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1147  acetyltransferase  36.2 
 
 
213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0420  putative acetyltransferase  44.27 
 
 
241 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.857208  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1415  antibiotic acetyltransferase  40.26 
 
 
229 aa  114  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.241418  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0933  hexapeptide repeat-containing transferase  43.7 
 
 
209 aa  114  5e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.201434  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0322  antibiotic acetyltransferase  41.45 
 
 
215 aa  114  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.799706 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4157  Chloramphenicol O-acetyltransferase  40 
 
 
215 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4229  chloramphenicol O-acetyltransferase  40 
 
 
215 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4361  chloramphenicol O-acetyltransferase  40 
 
 
215 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0072  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  36.75 
 
 
209 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1762  hexapaptide repeat-containing transferase  40.97 
 
 
210 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0977  antibiotic acetyltransferase  39.62 
 
 
232 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55170  chloramphenicol acetyltransferase  48.12 
 
 
177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000006331 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1991  antibiotic acetyltransferase  36 
 
 
207 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0913  chloramphenicol acetyltransferase  44.44 
 
 
212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>