More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1706 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1706  putative acetyltransferase  100 
 
 
214 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.558833  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0332  putative acetyltransferase  98.6 
 
 
214 aa  417  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130953  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0346  putative acetyltransferase  98.6 
 
 
214 aa  417  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.735095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0738  hexapaptide repeat-containing transferase  68.91 
 
 
217 aa  269  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12843  normal  0.0447634 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2320  chloramphenicol O-acetyltransferase  56.04 
 
 
213 aa  232  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3169  streptogramin A acetyl transferase  44.55 
 
 
213 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.210498  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0391  streptogramin A acetyl transferase  42.79 
 
 
216 aa  171  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0704  chloramphenicol O-acetyltransferase  45.03 
 
 
211 aa  169  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.191265  normal  0.790707 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2692  streptogramin A acetyl transferase  44.95 
 
 
224 aa  169  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1883  hypothetical protein  47.47 
 
 
213 aa  167  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2973  streptogramin A acetyl transferase  44.27 
 
 
217 aa  167  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2049  VatB  40.64 
 
 
211 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0377  hexapaptide repeat-containing transferase  43.63 
 
 
212 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208373  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2593  streptogramin A acetyl transferase  44.16 
 
 
224 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2073  VatB  40.64 
 
 
211 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0183643  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2536  hypothetical protein  44.79 
 
 
212 aa  165  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107266  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1384  streptogramin A acetyl transferase  44.67 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0253879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1569  hexapaptide repeat-containing transferase  41.78 
 
 
218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1600  hexapaptide repeat-containing transferase  40.83 
 
 
218 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000573546  normal  0.406168 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1763  streptogramin A acetyl transferase  43.43 
 
 
225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4504  streptogramin A acetyl transferase  44.95 
 
 
216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04310  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  49.5 
 
 
220 aa  160  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1461  hexapaptide repeat-containing transferase  40.64 
 
 
218 aa  159  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1563  hexapaptide repeat-containing transferase  40.57 
 
 
218 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04620  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  44.56 
 
 
218 aa  158  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4048  acetyltransferase  41.18 
 
 
209 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.638 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2780  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.38 
 
 
218 aa  157  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737809  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5872  streptogramin A acetyl transferase  42.44 
 
 
221 aa  155  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0994  acetyltransferase  40.62 
 
 
210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2526  streptogramin A acetyl transferase  49.33 
 
 
167 aa  151  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0155  hexapaptide repeat-containing transferase  38.65 
 
 
212 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479916 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2233  Chloramphenicol O-acetyltransferase  37.44 
 
 
213 aa  148  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0104377  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1978  hexapaptide repeat-containing transferase  41.41 
 
 
221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.811569  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2866  streptogramin A acetyl transferase  43.52 
 
 
218 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.72072  normal  0.603625 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1678  hypothetical protein  38.95 
 
 
211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2653  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  36.71 
 
 
210 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2656  acetyltransferase  37.2 
 
 
210 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2671  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  36.23 
 
 
210 aa  135  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0117743 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2450  acetyltransferase  37.32 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.602654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2629  acetyltransferase  37.32 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2412  virginiamycin A acetyltransferase  36.71 
 
 
210 aa  132  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2375  virginiamycin A acetyltransferase  37.32 
 
 
210 aa  132  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.462397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2698  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  36.23 
 
 
209 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.832761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2511  virginiamycin A acetyltransferase  35.27 
 
 
213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.153817  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2647  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  36.84 
 
 
210 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000095527 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1155  transferase hexapeptide repeat containing protein  46.62 
 
 
219 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0378081  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0635  transferase hexapeptide protein  41.3 
 
 
214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2927  streptogramin A acetyltransferase  42.58 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2701  streptogramin A acetyltransferase  42.11 
 
 
217 aa  129  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97222  normal  0.589096 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0223  hexapaptide repeat-containing transferase  32.26 
 
 
226 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3653  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  38.3 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3559  acetyltransferase  37.23 
 
 
185 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00169424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1664  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  39.13 
 
 
185 aa  125  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000881874  hitchhiker  1.93873e-17 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3561  hexapaptide repeat-containing transferase  42.11 
 
 
211 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.367656  normal  0.425944 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0600  hexapaptide repeat-containing transferase  33.51 
 
 
226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.152008  normal  0.590208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2823  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.05 
 
 
217 aa  125  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.469559  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3259  putative acetyltransferase  45.27 
 
 
206 aa  124  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3248  chloramphenicol acetyltransferase  36.46 
 
 
185 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000882178  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1181  antibiotic acetyltransferase  38.42 
 
 
240 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0246811  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1494  chloramphenicol O-acetyltransferase  38.71 
 
 
218 aa  123  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00845499  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3304  acetyltransferase  36.17 
 
 
185 aa  122  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000354114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3254  acetyltransferase  36.17 
 
 
185 aa  122  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00705468  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3563  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  36.17 
 
 
185 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000342506  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3339  acetyltransferase  35.64 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00224861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3600  acetyltransferase  35.64 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000293004  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4299  chloramphenicol acetyltransferase  35.75 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1415  antibiotic acetyltransferase  42.54 
 
 
229 aa  119  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.241418  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1998  chloramphenicol acetyltransferase  34.55 
 
 
213 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.427174  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2289  hexapaptide repeat-containing transferase  32.16 
 
 
216 aa  119  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0913  chloramphenicol acetyltransferase  41.06 
 
 
212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4944  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  38.31 
 
 
174 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  31.94 
 
 
226 aa  118  6e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.476323  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1388  hexapaptide repeat-containing transferase  37.23 
 
 
211 aa  118  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.220754  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2950  chloramphenicol O-acetyltransferase  34.72 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359614  normal  0.149612 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4496  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  33.99 
 
 
212 aa  116  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0665  hexapaptide repeat-containing transferase  32.45 
 
 
226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1536  putative chloramphenicol acetyltransferase  34.22 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000290239  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1762  hexapaptide repeat-containing transferase  38.89 
 
 
210 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0933  hexapeptide repeat-containing transferase  45.32 
 
 
209 aa  115  5e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.201434  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07054  acetyltransferase  31.28 
 
 
217 aa  114  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0821  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  44.67 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.468594  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0072  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  45.14 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1991  antibiotic acetyltransferase  40.94 
 
 
207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000997  acetyltransferase  31.47 
 
 
219 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3451  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  45.39 
 
 
215 aa  112  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164675  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1331  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  42.76 
 
 
195 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.956774  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0420  putative acetyltransferase  39.9 
 
 
241 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.857208  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0116  hexapaptide repeat-containing transferase  35.05 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278258  hitchhiker  0.00730231 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3571  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  45.32 
 
 
220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.414497  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2793  putative chloramphenicol acetyltransferase  33.86 
 
 
210 aa  108  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5557  hexapaptide repeat-containing transferase  32.34 
 
 
219 aa  108  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102322 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3819  putative acetyltransferase (virginiamycin, streptogramin A, chloramphenicol)  45.59 
 
 
258 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0731893  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0138  transferase hexapeptide protein  42.03 
 
 
215 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0182883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2456  chloramphenicol acetyltransferase  32.5 
 
 
219 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2880  chloramphenicol acetyltransferase  32 
 
 
219 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5875  chloramphenicol acetyltransferase  47.93 
 
 
200 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0086312  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4432  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  45.26 
 
 
205 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0587  acetyltransferase  36.05 
 
 
219 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.307892  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4083  hexapaptide repeat-containing transferase  47.06 
 
 
221 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636222  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1147  acetyltransferase  38.78 
 
 
213 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.789995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>