28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1709 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1709  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  637    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.53026  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2642  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.88 
 
 		 313 aa  322  4e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1743  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  53.67 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1009  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  50 
 
 		 308 aa  286  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0469  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  50.74 
 
 		 307 aa  262  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0294161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6459  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.34 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1044  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.08 
 
 		 305 aa  245  6e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0534  hypothetical protein  43.41 
 
 		 318 aa  243  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.434063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4673  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  39.7 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0589  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.06 
 
 		 337 aa  189  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102847 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2372  hypothetical protein  29.67 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0241326  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.7 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0333  xylose isomerase-like TIM barrel  25.12 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.601498  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1349  xylose isomerase domain-containing protein  26.37 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1018  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.8 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0551  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.46 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  25.97 
 
 		 515 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1662  xylose isomerase domain-containing protein  25.89 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.36383  hitchhiker  0.00346458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.63 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3402  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.67 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.63 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2598  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.13 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1020  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.02 
 
 		 334 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0895  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.83 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0870  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.31 
 
 		 280 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.505971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1525  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.97 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5791  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.51 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.864508  normal  0.0412869 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31660  sugar phosphate isomerase/epimerase  19.82 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>