More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1194 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1194  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  100 
 
 		 476 aa  937    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1600  Na+/solute symporter  54.49 
 
 		 473 aa  481  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0101485  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2974  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  40.43 
 
 		 478 aa  290  5.0000000000000004e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4984  SSS sodium solute transporter superfamily  39.01 
 
 		 472 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386882 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  31.63 
 
 		 492 aa  188  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  30.73 
 
 		 492 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  30.96 
 
 		 492 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1229  sodium/proline symporter  28.78 
 
 		 504 aa  172  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  31.92 
 
 		 496 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1575  Sodium/proline symporter  32.56 
 
 		 498 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0675536  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  29.44 
 
 		 495 aa  159  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  31.73 
 
 		 518 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  26.57 
 
 		 513 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  29.3 
 
 		 488 aa  158  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  30.46 
 
 		 497 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1334  sodium/proline symporter  30.96 
 
 		 499 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  27.52 
 
 		 485 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  29.27 
 
 		 495 aa  152  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  27.37 
 
 		 484 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  29.54 
 
 		 482 aa  150  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  28.6 
 
 		 483 aa  150  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  28.98 
 
 		 486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  26.06 
 
 		 492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2137  SSS sodium solute transporter superfamily  27.35 
 
 		 528 aa  147  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00565072  normal  0.610314 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  28.09 
 
 		 483 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  29.29 
 
 		 498 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  28.36 
 
 		 498 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1396  Na+/proline symporter  27.68 
 
 		 553 aa  147  6e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.28 
 
 		 492 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1248  Sodium/proline symporter  29.73 
 
 		 496 aa  146  8.000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  28.98 
 
 		 493 aa  146  9e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.28 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  26.28 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  28.48 
 
 		 492 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1860  sodium/proline symporter  29.75 
 
 		 496 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0914218  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  27.73 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  26.28 
 
 		 492 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  26.28 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  28.04 
 
 		 493 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  26.28 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  28.04 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  31.73 
 
 		 498 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  27.49 
 
 		 488 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  28.04 
 
 		 492 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  26.28 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  28.26 
 
 		 487 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  28.04 
 
 		 493 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  28.04 
 
 		 493 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  26.51 
 
 		 492 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  27.43 
 
 		 492 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  27.42 
 
 		 489 aa  144  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  27.08 
 
 		 492 aa  144  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  28.04 
 
 		 492 aa  144  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  27 
 
 		 492 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1731  sodium/proline symporter  28.23 
 
 		 496 aa  143  7e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.253035  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  28.51 
 
 		 492 aa  143  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  27.42 
 
 		 489 aa  142  9e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  27.52 
 
 		 494 aa  142  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  27.94 
 
 		 483 aa  142  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  28.19 
 
 		 483 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09750  sodium/proline symporter  28.63 
 
 		 520 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000003829  hitchhiker  0.000045945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  28.41 
 
 		 483 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  27.13 
 
 		 499 aa  141  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  27.42 
 
 		 489 aa  141  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  28.04 
 
 		 492 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  28.32 
 
 		 492 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  26.48 
 
 		 494 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  27.91 
 
 		 483 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  28.66 
 
 		 506 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4147  sodium/proline symporter  29.46 
 
 		 497 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  28.19 
 
 		 483 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  27.67 
 
 		 492 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  28.24 
 
 		 492 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  28.29 
 
 		 484 aa  140  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0507  Na+/solute symporter  27.03 
 
 		 519 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  27.97 
 
 		 483 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  27.97 
 
 		 483 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  27.97 
 
 		 483 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  27.97 
 
 		 483 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  28.45 
 
 		 506 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  25.51 
 
 		 494 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05510  SSS sodium solute transporter  26.21 
 
 		 536 aa  139  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  29.88 
 
 		 529 aa  139  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2670  sodium/proline symporter  29.14 
 
 		 541 aa  139  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0491  sodium/proline symporter  29.39 
 
 		 495 aa  139  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  28.35 
 
 		 497 aa  139  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  28.13 
 
 		 491 aa  139  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  27.15 
 
 		 493 aa  139  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  28.15 
 
 		 493 aa  138  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5016  proline permease  26.82 
 
 		 495 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  27.07 
 
 		 512 aa  138  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  27.07 
 
 		 512 aa  138  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  27.61 
 
 		 488 aa  137  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  26.65 
 
 		 482 aa  137  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  26.77 
 
 		 502 aa  137  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  27.57 
 
 		 511 aa  136  8e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  31.25 
 
 		 496 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  29.59 
 
 		 499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631202 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2627  sodium/proline symporter  27.19 
 
 		 502 aa  134  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07840  sodium/ prolin symporter  29.66 
 
 		 544 aa  134  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>