16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0254 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0254  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  376  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.941246  normal  0.425073 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2228  OmpA-like transmembrane region  36.22 
 
 		 193 aa  104  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01464  putative outer membrane protein A  30.81 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3691  OmpA domain-containing protein  29.84 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004315  outer membrane protein A precursor  28.27 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0734  OmpA domain-containing protein  28.93 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0604  OmpA domain-containing protein  28.28 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.303363  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3870  OmpA domain-containing protein  30.08 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  normal  0.416173 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1171  hypothetical protein  29.24 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0548  OmpA domain-containing protein  26.67 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0998  hypothetical protein  27.48 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0523  OmpA domain-containing protein  26.67 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0553  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  26.67 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3428  outer membrane protein, putative  29.86 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02499  hypothetical protein  26.43 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2541  OmpA domain-containing protein  25 
 
 		 196 aa  42  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.480511 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>