37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0138 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0138  hypothetical protein  100 
 
 		 471 aa  979    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  42.15 
 
 		 344 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  40.23 
 
 		 344 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  41.47 
 
 		 344 aa  266  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  41.59 
 
 		 344 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  39.16 
 
 		 342 aa  259  6e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  37.43 
 
 		 348 aa  242  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  37.43 
 
 		 348 aa  238  3e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  34.71 
 
 		 368 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  35.78 
 
 		 357 aa  190  5.999999999999999e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  31.37 
 
 		 355 aa  184  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  30.29 
 
 		 361 aa  183  6e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  31.16 
 
 		 346 aa  176  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  32.96 
 
 		 354 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  29.82 
 
 		 349 aa  173  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  31.2 
 
 		 344 aa  168  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  30.37 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  30.56 
 
 		 355 aa  166  8e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  28.27 
 
 		 352 aa  166  8e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  26.46 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0665  hypothetical protein  30.95 
 
 		 345 aa  162  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0449506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  31.62 
 
 		 353 aa  160  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  26.86 
 
 		 356 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  29.04 
 
 		 343 aa  146  6e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  26.61 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3113  hypothetical protein  29.53 
 
 		 345 aa  137  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  26.93 
 
 		 349 aa  132  9e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  20.6 
 
 		 380 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  21.68 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  21.2 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  19.13 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  18.8 
 
 		 346 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  20.7 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2728  protein of unknown function DUF482  21.45 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5671  hypothetical protein  20.74 
 
 		 293 aa  50.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.597001  normal  0.0100919 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  19.33 
 
 		 372 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  23.1 
 
 		 335 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>