25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2470 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1855  hypothetical protein  95.7 
 
 
389 aa  723    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.655192  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2470  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  795    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.932984  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1816  hypothetical protein  95.44 
 
 
387 aa  728    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1808  hypothetical protein  95.19 
 
 
384 aa  724    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1619  hypothetical protein  62.78 
 
 
363 aa  490  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1840  hypothetical protein  58.22 
 
 
357 aa  368  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1598  hypothetical protein  57.07 
 
 
354 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1592  hypothetical protein  56.53 
 
 
354 aa  361  1e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.644089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1531  hypothetical protein  56.27 
 
 
354 aa  358  7e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1844  hypothetical protein  37.43 
 
 
350 aa  178  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319257  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2047  hypothetical protein  30.77 
 
 
323 aa  143  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2511  MJ0042 family finger-like protein  31.28 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1474  hypothetical protein  26.82 
 
 
363 aa  99.4  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1712  MJ0042 family finger-like protein  31.31 
 
 
446 aa  94  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1298  membrane protein-like protein  30.61 
 
 
312 aa  88.6  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  38.97 
 
 
1006 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3070  hypothetical protein  29.77 
 
 
735 aa  80.1  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189766  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2992  hypothetical protein  29.45 
 
 
735 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3040  hypothetical protein  27.32 
 
 
342 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1253  hypothetical protein  31.76 
 
 
336 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3197  hypothetical protein  35.48 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4247  hypothetical protein  31.94 
 
 
325 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.990494 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1650  membrane protein-like protein  25.84 
 
 
758 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  27.62 
 
 
703 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2447  hypothetical protein  36.22 
 
 
351 aa  46.2  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>