23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4563 on replicon NC_009998
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009998  Sbal195_4563  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 349 aa  705    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.079471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0037  Zn-dependent hydrolase  43.55 
 
 		 355 aa  272  8.000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000581778  hitchhiker  0.000547096 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2712  beta-lactamase domain-containing protein  36.83 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.6358  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4198  beta-lactamase domain protein  35.57 
 
 		 365 aa  159  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3042  hypothetical protein  33.84 
 
 		 348 aa  123  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3114  beta-lactamase domain-containing protein  29.88 
 
 		 345 aa  119  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0062  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)-like protein  29.76 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4020  beta-lactamase domain-containing protein  29.54 
 
 		 305 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1851  hypothetical protein  25.71 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1822  hypothetical protein  28.17 
 
 		 338 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5652  hypothetical protein  26.11 
 
 		 413 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0839  hypothetical protein  25.75 
 
 		 393 aa  82.8  0.000000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1793  hypothetical protein  24.25 
 
 		 427 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.934351  normal  0.0393077 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0217  hypothetical protein  23.35 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3308  beta-lactamase domain protein  31.31 
 
 		 393 aa  50.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.154188  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 453 aa  48.1  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.42 
 
 		 808 aa  46.2  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2771  beta-lactamase domain-containing protein  22.08 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3048  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.77 
 
 		 679 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.87 
 
 		 682 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3957  hypothetical protein  35.09 
 
 		 115 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.321543  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0612  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 305 aa  43.1  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2035  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  23.7 
 
 		 363 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.923739  normal  0.0106214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>