91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4722 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_3801  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  99.15 
 
 
354 aa  733    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3821  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  99.44 
 
 
354 aa  736    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194518 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4663  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  98.87 
 
 
354 aa  733    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4752  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  99.44 
 
 
354 aa  736    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4436  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  99.44 
 
 
354 aa  736    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4722  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  100 
 
 
354 aa  740    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4743  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  96.61 
 
 
354 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4800  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  96.33 
 
 
354 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4650  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  96.61 
 
 
354 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4660  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  96.61 
 
 
354 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4779  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  96.61 
 
 
354 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.524787  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5708  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  99.44 
 
 
354 aa  736    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04021  hypothetical protein  99.15 
 
 
354 aa  735    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04059  predicted L-ascorbate 6-phosphate lactonase  99.15 
 
 
354 aa  735    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0643  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  73.45 
 
 
354 aa  578  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0119  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  73.31 
 
 
355 aa  568  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0288  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  73.6 
 
 
355 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.440104  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0133  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  74.29 
 
 
354 aa  555  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0141  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  74.29 
 
 
354 aa  555  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000169271  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0981  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  69.3 
 
 
355 aa  538  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1324  putative L-ascorbate-6-phosphate lactonase UlaG  63.56 
 
 
353 aa  496  1e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1998  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  61.82 
 
 
357 aa  479  1e-134  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0329  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  59.14 
 
 
372 aa  464  9.999999999999999e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1800  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  57.58 
 
 
363 aa  438  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1805  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.74 
 
 
276 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2540  hypothetical protein  25.94 
 
 
275 aa  94.7  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.641788  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4386  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.03 
 
 
278 aa  91.3  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0244983  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2496  hypothetical protein  26.12 
 
 
277 aa  89.7  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3589  beta-lactamase domain protein  24.74 
 
 
279 aa  87.8  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1220  hypothetical protein  24.84 
 
 
284 aa  85.5  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000702684 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1586  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.55 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.600595  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0210  hypothetical protein  23.22 
 
 
281 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4313  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.75 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.678939  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0944  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.19 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4432  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.47 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0167482  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  26.6 
 
 
383 aa  58.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.6 
 
 
590 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6275  hypothetical protein  22.46 
 
 
281 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  23.81 
 
 
377 aa  55.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.25 
 
 
380 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  23.05 
 
 
409 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  23.79 
 
 
371 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  25.58 
 
 
360 aa  50.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1883  putative mRNA 3-end processing factor  34.44 
 
 
327 aa  50.4  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  22.18 
 
 
372 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  22.01 
 
 
393 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1074  metal-dependent hydrolase  23.88 
 
 
225 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  23.53 
 
 
350 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2467  hypothetical protein  23.85 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  23.36 
 
 
372 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0803  metal-dependent hydrolase  22.99 
 
 
237 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000737495 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0291  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  24.87 
 
 
372 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1808  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  24.41 
 
 
302 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.72827  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  22.17 
 
 
227 aa  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0810  metal-dependent hydrolase  23.38 
 
 
225 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2786  hypothetical protein  28 
 
 
392 aa  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  22.89 
 
 
320 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  22.89 
 
 
320 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  21.96 
 
 
320 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1076  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.32 
 
 
419 aa  47  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3728  hypothetical protein  24.44 
 
 
356 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000279233 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  28.93 
 
 
332 aa  46.6  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1774  beta-lactamase domain protein  22.97 
 
 
239 aa  46.6  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613108  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  21.83 
 
 
320 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  21.83 
 
 
320 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3094  hypothetical protein  28.08 
 
 
337 aa  46.2  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.815715 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2131  hypothetical protein  26.53 
 
 
354 aa  46.2  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0291  hypothetical protein  24.31 
 
 
356 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619588  hitchhiker  0.0000166139 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  22.61 
 
 
367 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.76 
 
 
385 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1348  metal-dependent hydrolase  22.89 
 
 
225 aa  46.2  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.324127  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  22.22 
 
 
351 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  28.93 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2696  metal-dependent hydrolase  25 
 
 
226 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.4 
 
 
367 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1077  beta-lactamase domain-containing protein  25.56 
 
 
367 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.600818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  22.17 
 
 
365 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  22.33 
 
 
363 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5227  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 
224 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2256  Zn-dependent hydrolase  24.17 
 
 
348 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  22.16 
 
 
376 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2469  hypothetical protein  26.15 
 
 
353 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  24.21 
 
 
403 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  24.47 
 
 
358 aa  43.5  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0783  hypothetical protein  23.9 
 
 
225 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5751  hypothetical protein  24.3 
 
 
258 aa  43.5  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0973  putative mRNA 3-end processing factor  32.58 
 
 
314 aa  43.5  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.289039 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2279  beta-lactamase domain protein  25.6 
 
 
230 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25 
 
 
386 aa  43.1  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0767  metal-dependent hydrolase  23.48 
 
 
226 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  25 
 
 
364 aa  42.7  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>