More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3281 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3281  (2Fe-2S)-binding protein  100 
 
 
169 aa  342  2e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0825523  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1037  (2Fe-2S)-binding  68.1 
 
 
179 aa  238  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.365772  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3868  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  68.1 
 
 
181 aa  229  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.505784  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1074  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.64 
 
 
146 aa  174  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.847005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1074  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.25 
 
 
146 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0838259  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4569  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.46 
 
 
155 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3046  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.46 
 
 
155 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561487  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02378  Ferredoxin/oxidoreductase  47.2 
 
 
168 aa  163  9e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.458538  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2111  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.33 
 
 
146 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2767  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  52.7 
 
 
149 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647308  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1890  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  54.36 
 
 
155 aa  160  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0051746  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5426  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.66 
 
 
187 aa  160  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.25 
 
 
171 aa  158  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2021  putative aldehyde dehydrogenase  48.34 
 
 
162 aa  158  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290531  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6324  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.98 
 
 
156 aa  158  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.633542  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4140  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.99 
 
 
157 aa  158  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478107  normal  0.124056 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4893  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.39 
 
 
148 aa  158  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4167  (2Fe-2S)-binding  50.33 
 
 
152 aa  155  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1931  (2Fe-2S)-binding protein  52.41 
 
 
154 aa  155  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7868  putative aldehyde dehydrogenase  47.68 
 
 
162 aa  154  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2511  (2Fe-2S)-binding  49.32 
 
 
166 aa  154  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6243  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.67 
 
 
151 aa  154  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2314  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.63 
 
 
180 aa  154  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2173  ferredoxin  51.33 
 
 
151 aa  153  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.634408  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1692  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.72 
 
 
146 aa  153  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.814616 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1768  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.33 
 
 
155 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329121 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1831  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.74 
 
 
155 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.672438 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2091  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.33 
 
 
155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.512796 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3111  (2Fe-2S)-binding protein  52.9 
 
 
153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.215766  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1159  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.97 
 
 
149 aa  150  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4228  (2Fe-2S)-binding  51.7 
 
 
163 aa  149  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1890  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.68 
 
 
157 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0273  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.1 
 
 
157 aa  149  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0864  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.33 
 
 
152 aa  150  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.383234 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3947  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.68 
 
 
157 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0468181  normal  0.360415 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3614  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.46 
 
 
164 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0641  Iron sulfer protein  53.79 
 
 
164 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0200  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  48.98 
 
 
156 aa  148  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3426  ferredoxin  52.94 
 
 
154 aa  147  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0068  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.38 
 
 
167 aa  147  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2854  putative oxidoreductase  50.68 
 
 
155 aa  147  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2601  (2Fe-2S)-binding  49.33 
 
 
154 aa  147  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.346256  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02524  putative aldehyde dehydrogenase subunit III  48.3 
 
 
166 aa  147  9e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269034  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2234  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.36 
 
 
185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000284749  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3128  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0546642 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4546  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.02 
 
 
167 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.945817  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3147  (2Fe-2S)-binding  51.68 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00215108  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3446  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.97 
 
 
153 aa  145  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0763161 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0200  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.68 
 
 
159 aa  145  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3375  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.63 
 
 
155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3582  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.34 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3490  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  48.63 
 
 
153 aa  144  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3482  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.67 
 
 
167 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2287  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  47.95 
 
 
148 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.418047 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0864  (2Fe-2S)-binding  47.62 
 
 
158 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1256  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.68 
 
 
153 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1231  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.68 
 
 
153 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43780  putative oxidoreductase  48.99 
 
 
163 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0838  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  51.02 
 
 
154 aa  143  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4470  ferredoxin/oxidoreductase  50 
 
 
153 aa  143  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325176  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4819  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.67 
 
 
151 aa  143  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2280  (2Fe-2S)-binding protein  49.66 
 
 
154 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.938299  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6606  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.66 
 
 
159 aa  143  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0063446  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0905  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.03 
 
 
162 aa  143  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0416  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.34 
 
 
159 aa  143  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1418  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.52 
 
 
148 aa  143  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.129533  normal  0.166559 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0528  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.74 
 
 
171 aa  142  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0766  (2Fe-2S)-binding domain protein  46 
 
 
154 aa  142  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787546 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1962  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
153 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4323  (2Fe-2S)-binding  49.02 
 
 
167 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4043  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.02 
 
 
167 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281878  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3103  (2Fe-2S)-binding ferredoxin  51.03 
 
 
155 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2575  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48 
 
 
151 aa  141  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3672  putative oxidoreductase  47.37 
 
 
163 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0857  (2Fe-2S)-binding  49.32 
 
 
153 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774695  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1338  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.32 
 
 
153 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2882  putative oxidoreductase  47.37 
 
 
156 aa  141  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0123  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.32 
 
 
155 aa  140  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298276  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3368  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.39 
 
 
157 aa  140  7e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0584  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.77 
 
 
158 aa  140  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00001317  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0626  aldehyde dehydrogenase subunit III  49.01 
 
 
152 aa  140  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1317  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.65 
 
 
153 aa  140  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5195  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.99 
 
 
151 aa  140  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5082  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.99 
 
 
151 aa  140  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3173  (2Fe-2S)-binding  48.99 
 
 
151 aa  140  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4125  (2Fe-2S)-binding domain protein  50 
 
 
154 aa  140  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3147  hypothetical protein  48.68 
 
 
152 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.483124 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5951  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.99 
 
 
151 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588853  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3075  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  47.44 
 
 
160 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0806  (2Fe-2S)-binding protein  48.68 
 
 
153 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0756376  normal  0.191785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1603  (2Fe-2S)-binding protein  48.99 
 
 
151 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356413  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0231  (2Fe-2S)-binding  42.28 
 
 
152 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2803  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.1 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.020197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5042  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.3 
 
 
159 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179496  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3933  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.98 
 
 
159 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0782071  normal  0.326869 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3961  (2Fe-2S)-binding  48.99 
 
 
151 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1906  (2Fe-2S)-binding  45.64 
 
 
164 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0622007  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6069  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.32 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33890  putative oxidoreductase  46.71 
 
 
156 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.570354  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4406  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.99 
 
 
151 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.322434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>