More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0231 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0231  (2Fe-2S)-binding  100 
 
 
152 aa  313  5e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0584  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.55 
 
 
158 aa  186  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00001317  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5426  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.79 
 
 
187 aa  178  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0200  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  54.97 
 
 
156 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4140  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.97 
 
 
157 aa  174  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478107  normal  0.124056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6243  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.05 
 
 
151 aa  173  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0905  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.16 
 
 
162 aa  172  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0049  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.05 
 
 
188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0706173  normal  0.653074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0731  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.94 
 
 
151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4893  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
148 aa  171  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2854  putative oxidoreductase  54.17 
 
 
155 aa  171  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2920  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.48 
 
 
150 aa  171  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3868  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.41 
 
 
181 aa  169  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.505784  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3446  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.74 
 
 
153 aa  168  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0763161 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2173  ferredoxin  55.03 
 
 
151 aa  168  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.634408  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0863  (2Fe-2S)-binding protein  52.41 
 
 
153 aa  169  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2803  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.98 
 
 
163 aa  168  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.020197 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3103  (2Fe-2S)-binding ferredoxin  53.38 
 
 
155 aa  167  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02524  putative aldehyde dehydrogenase subunit III  54.61 
 
 
166 aa  167  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269034  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3147  hypothetical protein  53.74 
 
 
152 aa  167  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.483124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1890  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  48.03 
 
 
155 aa  167  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0051746  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2091  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.4 
 
 
155 aa  166  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.512796 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4547  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.1 
 
 
152 aa  166  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1530  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  52.63 
 
 
153 aa  166  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1154  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  52.63 
 
 
153 aa  166  9e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.669322  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2250  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  52.63 
 
 
153 aa  166  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1746  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  52.63 
 
 
153 aa  166  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.446262  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0086  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  52.63 
 
 
153 aa  166  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0922  putative oxidoreductase, iron-sulfur cluster-binding subunit  52.63 
 
 
153 aa  166  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0747581  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1007  putative oxidoreductase, iron-sulfur cluster-binding subunit  52.63 
 
 
153 aa  166  9e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.408478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0838  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  52.35 
 
 
154 aa  166  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4836  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.41 
 
 
153 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102836 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3530  (2Fe-2S)-binding  52.41 
 
 
153 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2511  (2Fe-2S)-binding  52 
 
 
166 aa  166  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0626  aldehyde dehydrogenase subunit III  56.25 
 
 
152 aa  165  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7215  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.1 
 
 
153 aa  165  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5448  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.72 
 
 
153 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0179621 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1987  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.47 
 
 
155 aa  165  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249056 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1768  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.68 
 
 
155 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1692  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
146 aa  164  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.814616 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3950  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.41 
 
 
164 aa  164  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.0539481 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4733  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.72 
 
 
153 aa  164  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.211012  normal  0.305671 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3368  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.32 
 
 
157 aa  164  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2899  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.3 
 
 
155 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0288309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1037  (2Fe-2S)-binding  52.35 
 
 
179 aa  163  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.365772  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3046  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.02 
 
 
155 aa  163  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561487  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3758  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.34 
 
 
153 aa  163  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566675  normal  0.0134234 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0154  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.81 
 
 
148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal  0.081437 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0177  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.34 
 
 
152 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0550651  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2280  (2Fe-2S)-binding protein  52.74 
 
 
154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.938299  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0210  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.81 
 
 
148 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0068  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.74 
 
 
167 aa  162  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4210  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.03 
 
 
153 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6606  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.67 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0063446  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3977  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.48 
 
 
153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156195  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3087  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.99 
 
 
157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.544744  normal  0.0177824 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40180  putative oxidoreductase  51.01 
 
 
153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.948778  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1891  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  52.78 
 
 
152 aa  161  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1703  (2Fe-2S)-binding protein  51.66 
 
 
167 aa  161  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281289  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.35 
 
 
171 aa  161  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2224  (2Fe-2S)-binding  50 
 
 
150 aa  161  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1103  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.68 
 
 
163 aa  161  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00357841  normal  0.792999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4569  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.98 
 
 
155 aa  161  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3614  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.03 
 
 
164 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6324  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.03 
 
 
156 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.633542  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3426  ferredoxin  50 
 
 
154 aa  160  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3902  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.55 
 
 
152 aa  160  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3164  ferredoxin like protein  54.55 
 
 
152 aa  160  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.758839  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3606  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.01 
 
 
154 aa  160  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.20509  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2287  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  50.35 
 
 
148 aa  159  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.418047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1272  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.33 
 
 
148 aa  159  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4470  ferredoxin/oxidoreductase  52.38 
 
 
153 aa  159  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325176  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1629  (2Fe-2S)-binding domain protein  50 
 
 
172 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403047 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2461  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.03 
 
 
159 aa  159  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0714  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.33 
 
 
148 aa  159  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566241  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3679  (2Fe-2S)-binding  48.94 
 
 
165 aa  159  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0200  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.19 
 
 
159 aa  159  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1033  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.62 
 
 
148 aa  158  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0569229  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4888  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
155 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7868  putative aldehyde dehydrogenase  48.99 
 
 
162 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3490  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  48.67 
 
 
153 aa  159  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1256  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.38 
 
 
153 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2425  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
167 aa  159  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4529  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.15 
 
 
161 aa  158  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0685018 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2730  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.29 
 
 
172 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3465  (2Fe-2S)-binding  53.52 
 
 
154 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2747  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
172 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3213  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.04 
 
 
155 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0014  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.43 
 
 
151 aa  159  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.652545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2021  putative aldehyde dehydrogenase  49.32 
 
 
162 aa  158  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290531  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3298  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.3 
 
 
155 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114503  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3933  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.85 
 
 
159 aa  159  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0782071  normal  0.326869 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5480  (2Fe-2S)-binding  50 
 
 
155 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2823  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
172 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0515601 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5382  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
155 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4989  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.15 
 
 
161 aa  158  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.824412 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5042  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.85 
 
 
159 aa  159  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179496  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1231  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.38 
 
 
153 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2473  ferredoxin  49.65 
 
 
151 aa  158  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411449  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0018  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.63 
 
 
163 aa  157  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>