37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3133 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3133  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  303  7e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0163555  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1989  hypothetical protein  44.96 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.0000737355  normal  0.0314361 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0791  hypothetical protein  44.44 
 
 		 232 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1994  hypothetical protein  43.27 
 
 		 544 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3522  hypothetical protein  41.67 
 
 		 336 aa  80.9  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136391  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2123  hypothetical protein  45.1 
 
 		 455 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140853  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2767  hypothetical protein  37.74 
 
 		 455 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1182  hypothetical protein  36.54 
 
 		 640 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1121  hypothetical protein  39.62 
 
 		 243 aa  72  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1647  hypothetical protein  36.15 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1427  hypothetical protein  35.65 
 
 		 476 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3078  hypothetical protein  36.84 
 
 		 358 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_004310  BR0509  hypothetical protein  35.45 
 
 		 278 aa  67.8  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0512  hypothetical protein  35.45 
 
 		 278 aa  67.8  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0920  hypothetical protein  40.38 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3457  hypothetical protein  36.11 
 
 		 611 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.801555  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0269  hypothetical protein  37 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2598  hypothetical protein  41.57 
 
 		 554 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1691  hypothetical protein  40.91 
 
 		 360 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10741  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1413  hypothetical protein  34.04 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.328656  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1417  hypothetical protein  41.38 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237583  normal  0.104082 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4981  hypothetical protein  41.11 
 
 		 418 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000575205 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3627  hypothetical protein  41.57 
 
 		 246 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0324  hypothetical protein  27.72 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00000000426021  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0745  hypothetical protein  26.73 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0294492  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3719  IS66 Orf2 family protein  34.21 
 
 		 423 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3172  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  54.3  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1825  hypothetical protein  37.96 
 
 		 608 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949516  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3921  hypothetical protein  39.55 
 
 		 433 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2013  hypothetical protein  43.06 
 
 		 555 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6575  hypothetical protein  43.06 
 
 		 555 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7311  hypothetical protein  43.06 
 
 		 555 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4090  hypothetical protein  39.55 
 
 		 433 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150292 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2886  hypothetical protein  34.09 
 
 		 240 aa  48.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0470567  normal  0.128421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  36.49 
 
 		 590 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2162  hypothetical protein  29.41 
 
 		 235 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.683012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4297  hypothetical protein  34.13 
 
 		 555 aa  43.9  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>