More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1809 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1809  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 507 aa  1026    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.850311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2723  glucose-6-phosphate isomerase  63.4 
 
 		 500 aa  624  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1215  glucose-6-phosphate isomerase  66.16 
 
 		 501 aa  601  1e-170  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0709148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1971  glucose-6-phosphate isomerase  44.78 
 
 		 537 aa  411  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.799071  normal  0.708924 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1950  glucose-6-phosphate isomerase  46.86 
 
 		 533 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.328568  normal  0.0244382 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2736  glucose-6-phosphate isomerase  43.39 
 
 		 533 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1776  glucose-6-phosphate isomerase  43.87 
 
 		 533 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.243279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1394  glucose-6-phosphate isomerase  43 
 
 		 533 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  42.02 
 
 		 549 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  42.78 
 
 		 549 aa  385  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  42.78 
 
 		 549 aa  385  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1682  glucose-6-phosphate isomerase  41.47 
 
 		 534 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419793  normal  0.180807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0753  glucose-6-phosphate isomerase  45.16 
 
 		 525 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1127  glucose-6-phosphate isomerase  44.42 
 
 		 522 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0378  glucose-6-phosphate isomerase  40.69 
 
 		 536 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.419467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2119  Glucose-6-phosphate isomerase  43.65 
 
 		 552 aa  364  2e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0430441 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  41.63 
 
 		 548 aa  363  3e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0070  glucose-6-phosphate isomerase  41.03 
 
 		 545 aa  363  4e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  40.3 
 
 		 562 aa  359  7e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0932  glucose-6-phosphate isomerase  39.96 
 
 		 548 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0922928  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2132  glucose-6-phosphate isomerase  41.57 
 
 		 615 aa  356  5e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163418  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2347  glucose-6-phosphate isomerase  41.41 
 
 		 540 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2466  glucose-6-phosphate isomerase  41.41 
 
 		 540 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3385  glucose-6-phosphate isomerase  41.63 
 
 		 545 aa  355  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1942  glucose-6-phosphate isomerase  41.41 
 
 		 540 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1449  glucose-6-phosphate isomerase  41.41 
 
 		 540 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.446361  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  41.41 
 
 		 540 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1215  glucose-6-phosphate isomerase  41.41 
 
 		 540 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  39.96 
 
 		 551 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2308  glucose-6-phosphate isomerase  41.21 
 
 		 540 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764178  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0944  glucose-6-phosphate isomerase  44.73 
 
 		 532 aa  353  5e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  40.27 
 
 		 540 aa  352  8e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  45.29 
 
 		 944 aa  352  8e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2287  glucose-6-phosphate isomerase  40.48 
 
 		 540 aa  352  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384563  normal  0.236333 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  40.27 
 
 		 556 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3094  glucose-6-phosphate isomerase  43.57 
 
 		 545 aa  352  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  39.89 
 
 		 540 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5218  glucose-6-phosphate isomerase  41.09 
 
 		 556 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  40 
 
 		 547 aa  350  4e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  39.52 
 
 		 549 aa  350  4e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6162  glucose-6-phosphate isomerase  39.89 
 
 		 556 aa  349  7e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  39.89 
 
 		 556 aa  349  7e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0665  glucose-6-phosphate isomerase  39.74 
 
 		 553 aa  348  9e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0581  glucose-6-phosphate isomerase  40.11 
 
 		 526 aa  348  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  37.45 
 
 		 545 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  37.27 
 
 		 545 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  38.56 
 
 		 552 aa  346  4e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  37.27 
 
 		 545 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1103  glucose-6-phosphate isomerase  44.29 
 
 		 520 aa  346  6e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  37.27 
 
 		 545 aa  346  6e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  38.78 
 
 		 559 aa  345  8e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  40.43 
 
 		 541 aa  345  8.999999999999999e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0697  glucose-6-phosphate isomerase  43.03 
 
 		 538 aa  345  1e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000815409 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04050  glucose-6-phosphate isomerase, putative  38.08 
 
 		 556 aa  345  1e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1357  glucose-6-phosphate isomerase  40.64 
 
 		 540 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553854  normal  0.605631 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0307  glucose-6-phosphate isomerase  38.35 
 
 		 549 aa  344  2e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0608  glucose-6-phosphate isomerase  36.51 
 
 		 543 aa  343  5e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.028095  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00687  glucose-6-phosphate isomerase  43.28 
 
 		 504 aa  342  1e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0675  glucose-6-phosphate isomerase  42.72 
 
 		 538 aa  341  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0534  glucose-6-phosphate isomerase  39.54 
 
 		 541 aa  340  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0137  glucose-6-phosphate isomerase  39.69 
 
 		 541 aa  340  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.574148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0143  glucose-6-phosphate isomerase  40.08 
 
 		 541 aa  340  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0655  glucose-6-phosphate isomerase  45.84 
 
 		 521 aa  340  4e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0621546  decreased coverage  0.00285419 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2735  glucose-6-phosphate isomerase  39.89 
 
 		 547 aa  340  4e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1006  glucose-6-phosphate isomerase  38.01 
 
 		 547 aa  340  5e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.777587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1521  glucose-6-phosphate isomerase  47.83 
 
 		 504 aa  339  5.9999999999999996e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1914  glucose-6-phosphate isomerase  38.88 
 
 		 540 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1250  glucose-6-phosphate isomerase  41.17 
 
 		 547 aa  339  8e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  37.62 
 
 		 550 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  37.24 
 
 		 545 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  37.93 
 
 		 531 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  38.5 
 
 		 548 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1267  glucose-6-phosphate isomerase  36.42 
 
 		 547 aa  336  5e-91  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  39.44 
 
 		 548 aa  336  5e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0200  glucose-6-phosphate isomerase  42.4 
 
 		 502 aa  336  5.999999999999999e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.525891  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0012  glucose-6-phosphate isomerase  36.58 
 
 		 553 aa  336  5.999999999999999e-91  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.350529  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  37.69 
 
 		 545 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  37.43 
 
 		 545 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3080  glucose-6-phosphate isomerase  41.8 
 
 		 550 aa  336  7e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562717  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0109  glucose-6-phosphate isomerase  40 
 
 		 541 aa  336  7e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3178  glucose-6-phosphate isomerase  41.94 
 
 		 546 aa  335  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1019  glucose-6-phosphate isomerase  38.28 
 
 		 540 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1859  Glucose-6-phosphate isomerase  40.42 
 
 		 549 aa  335  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1279  glucose-6-phosphate isomerase  37.62 
 
 		 545 aa  335  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000145573  normal  0.0332252 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  37.62 
 
 		 550 aa  335  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  37.4 
 
 		 545 aa  335  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  37.5 
 
 		 545 aa  335  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  37.98 
 
 		 550 aa  333  3e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  39.46 
 
 		 541 aa  333  3e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  37.55 
 
 		 550 aa  334  3e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0176  glucose-6-phosphate isomerase  42.2 
 
 		 502 aa  333  3e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  40.54 
 
 		 550 aa  333  4e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  38.02 
 
 		 548 aa  333  4e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  40.4 
 
 		 547 aa  333  6e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0912  glucose-6-phosphate isomerase  38.92 
 
 		 545 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3272  glucose-6-phosphate isomerase  41.5 
 
 		 546 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.701393  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1088  glucose-6-phosphate isomerase  38.72 
 
 		 545 aa  332  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000310593  normal  0.0429778 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  38.2 
 
 		 548 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2901  glucose-6-phosphate isomerase  36.9 
 
 		 545 aa  330  3e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  38.2 
 
 		 548 aa  330  3e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>