119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4707 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4707  amino acid-binding ACT domain-containing protein  100 
 
 		 170 aa  323  6e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4333  normal  0.012003 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4273  amino acid-binding ACT domain-containing protein  89.41 
 
 		 179 aa  267  5e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340897  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8574  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  45.56 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2533  glycine cleavage system regulatory protein  41.24 
 
 		 179 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3969  amino acid-binding ACT domain protein  41.24 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4055  amino acid-binding ACT domain protein  39.55 
 
 		 188 aa  111  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  38.29 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  37.29 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  33.53 
 
 		 173 aa  101  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4386  amino acid-binding ACT domain-containing protein  38.59 
 
 		 188 aa  101  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523733  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  30.99 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3496  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3514  amino acid-binding ACT domain-containing protein  39.08 
 
 		 186 aa  95.5  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160997  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0527  amino acid-binding ACT domain protein  37.08 
 
 		 185 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05930  ACT domain-containing regulatory protein  36.72 
 
 		 172 aa  84.7  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000527553  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0599  amino acid-binding ACT domain protein  34.83 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0437  ACT domain protein  34.83 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1965  ACT domain-containing protein  28.57 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2032  amino acid-binding ACT domain protein  36.18 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169147  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3703  glycine cleavage system regulatory protein-like  31.4 
 
 		 183 aa  70.9  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5182  ACT domain-containing protein  33.33 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248291  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  34.44 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4845  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.14 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92913  predicted protein  34.46 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00941527  normal  0.3672 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06310  ACT domain-containing protein  35.71 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183389  normal  0.204088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4094  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.79 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2002  amino acid-binding ACT domain-containing protein  36.57 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0587  hypothetical protein  35.71 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000555119  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1150  cellulose-binding family II protein  28.65 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.768713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0385  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.38 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000250758  normal  0.230246 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.31 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1909  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  29.65 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0700677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0621  amino acid-binding ACT domain protein  31.37 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2479  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.68 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0357  ACT domain-containing protein  31.25 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000156308  normal  0.422502 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4173  formyl transferase-like  30.41 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1943  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.12 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0383  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.51 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000019763  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0481  ACT domain protein  31.21 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000098406  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0826  amino acid-binding ACT domain protein  26.44 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.892136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4699  amino acid-binding ACT  32.31 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000305264  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0411  amino acid-binding ACT domain protein  29.65 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3321  amino acid-binding ACT  26.32 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2229  amino acid-binding ACT domain protein  34.1 
 
 		 181 aa  51.6  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0964148 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03188  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.19 
 
 		 180 aa  51.6  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1273  amino acid-binding ACT domain protein  34.12 
 
 		 177 aa  51.6  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1979  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.89 
 
 		 178 aa  50.8  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00211865  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2746  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.06 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.989316  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1847  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.57 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00121314  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0122  ACT domain-containing protein  41.79 
 
 		 89 aa  50.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03152  ACT domain protein  23.53 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2380  glycine cleavage system transcriptional repressor (Gcv operon repressor)  28.57 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1701  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  22.99 
 
 		 183 aa  48.1  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0560544  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18740  glycine cleavage system regulatory protein  36.69 
 
 		 181 aa  48.1  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.960027  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0332  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.58 
 
 		 172 aa  48.1  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24.14 
 
 		 183 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000275101  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1878  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  22.99 
 
 		 183 aa  47.4  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2413  amino acid-binding ACT domain-containing protein  22.99 
 
 		 183 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.204037  hitchhiker  0.00509125 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2553  amino acid-binding ACT domain-containing protein  23.56 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000108497  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1739  putative glycine cleavage system transcriptional repressor  26.32 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2668  amino acid-binding ACT domain-containing protein  23.56 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000549184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1791  amino acid-binding ACT domain protein  23.56 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000108735  hitchhiker  0.00000000136293 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002792  glycine cleavage system transcriptional antiactivator GcvR  27.43 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2341  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  22.99 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  hitchhiker  0.000000443735 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1356  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.75 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1655  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  22.99 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3510  glycine cleavage system transcriptional repressor  25.85 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.261645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2176  amino acid-binding ACT domain-containing protein  21.86 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00808907  normal  0.900227 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45408  predicted protein  28.35 
 
 		 220 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14440  hypothetical protein  46.51 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3182  hypothetical protein  38.03 
 
 		 92 aa  45.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  hitchhiker  0.00106731 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2525  glycine cleavage system transcriptional repressor  25.43 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1623  amino acid-binding ACT  28.3 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.181178  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1378  hypothetical protein  30.12 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000129759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3180  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.49 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0612  hypothetical protein  31.33 
 
 		 92 aa  45.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287518  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1683  hypothetical protein  36.62 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0230  hypothetical protein  35.21 
 
 		 90 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.867874  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1671  hypothetical protein  29.07 
 
 		 100 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313942  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2431  amino acid-binding ACT domain-containing protein  23.08 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0267912  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1863  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  24.37 
 
 		 178 aa  44.7  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000211112  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3885  ACT domain-containing protein  23.95 
 
 		 165 aa  44.3  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  22.94 
 
 		 400 aa  44.3  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1697  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.01 
 
 		 165 aa  44.3  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.54674 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1734  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  21.97 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0944  hypothetical protein  34.33 
 
 		 90 aa  43.9  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1181  hypothetical protein  34.33 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.254415  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0409  hypothetical protein  28.21 
 
 		 89 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.168136  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0278  amino acid-binding ACT domain protein  26.92 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.305725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  39.44 
 
 		 300 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3169  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.39 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.765517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0665  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  27.13 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3185  glycine cleavage system transcriptional repressor  24.03 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.168662  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2118  hypothetical protein  28.92 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  28.9 
 
 		 420 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0918  hypothetical protein  33.8 
 
 		 90 aa  43.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0844317  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1034  hypothetical protein  34.72 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0342  ACT domain-containing protein  42.86 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1361  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.23 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.243595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>