93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3454 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3454  cation antiporter  100 
 
 		 133 aa  255  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3228  cation antiporter  90.6 
 
 		 129 aa  199  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357833  normal  0.10226 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2931  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  49.53 
 
 		 139 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1732  cation antiporter  46.67 
 
 		 125 aa  98.6  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  40.37 
 
 		 159 aa  87.4  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11080  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  42.73 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  40 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  41.18 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  37.14 
 
 		 157 aa  84.3  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  42.86 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  41.18 
 
 		 157 aa  84  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  43.14 
 
 		 157 aa  83.6  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26960  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  45.79 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.75 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.53 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1916  cation antiporter  38.89 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  47.67 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  36.19 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3535  cation antiporter  37.37 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0624432  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  35.45 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.78 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  34.07 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  34.07 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3691  cation antiporter  34.52 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.08 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  39.58 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  39.51 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3222  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.2 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.05 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.28 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.23 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000415  Na(+) H(+) antiporter subunit E  36.79 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.52 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  35.14 
 
 		 198 aa  60.5  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0732  cation antiporter  36.19 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.14 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  34.52 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.53 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0494  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.36 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0501  cation antiporter  32.1 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000454407  hitchhiker  0.0000410106 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1541  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.11 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3453  cation antiporter  36.11 
 
 		 349 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358636  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0948  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.79 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.79 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.259527  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  38.46 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.45 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1444  cation antiporter  32.1 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0242697  normal  0.798428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4321  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.71 
 
 		 174 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19560  sodium hydrogen antiporter subunitE, ShaE  34.88 
 
 		 167 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0245623  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5159  cation antiporter  32.94 
 
 		 344 aa  50.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.77 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0884  cation antiporter  31.71 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136133  normal  0.207423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.46 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968522 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.05 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0765  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  22.12 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.922153  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  28.41 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.14 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0948  membrane bound hydrogenase subunit mbhA  35.14 
 
 		 179 aa  48.1  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0174766  normal  0.241489 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0579  cation antiporter  33.33 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0216682  decreased coverage  0.00989196 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2216  membrane bound protein complex subunit mbxA  34.31 
 
 		 172 aa  47.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.11 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00123614  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0438  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.22 
 
 		 171 aa  46.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0503  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.22 
 
 		 171 aa  46.2  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1641  cation antiporter  33.77 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296097  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3985  cation antiporter  31.33 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0497  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like protein  33.33 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.701865  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.33 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0897  cation antiporter  35.38 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.675362  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.08 
 
 		 344 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.951663 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0995  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.33 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0487  cation antiporter  26.8 
 
 		 219 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.700511 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1159  cation antiporter  31.43 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0900  cation antiporter  26.26 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0044  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like protein  40.58 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.18 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.955338  normal  0.798381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4627  cation antiporter  30.33 
 
 		 174 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0386  cation antiporter  30.49 
 
 		 174 aa  43.9  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.265532  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0664  cation antiporter  35.29 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1748  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.29 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.25 
 
 		 166 aa  42.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3144  cation antiporter  37.5 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2579  cation antiporter  29.73 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2436  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.68 
 
 		 202 aa  42  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.425065 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18940  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  30 
 
 		 205 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0573  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.71 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.933363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0741  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.73 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.60471 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0595  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.71 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0583  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.71 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.56 
 
 		 162 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.911749 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4891  cation antiporter  29.17 
 
 		 205 aa  41.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.33 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0362047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0165  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.85 
 
 		 179 aa  40.4  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.792787 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2281  cation antiporter  27.18 
 
 		 173 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>