75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2981 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2981  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  100 
 
 		 455 aa  925    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3582  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  68.64 
 
 		 453 aa  628  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0902  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  67.9 
 
 		 456 aa  619  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3272  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  67.69 
 
 		 456 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0748  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  67.69 
 
 		 456 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3378  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  67.69 
 
 		 456 aa  617  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0754  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  66.88 
 
 		 457 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.765141  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2709  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  67.11 
 
 		 456 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000704045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3495  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  66.88 
 
 		 457 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3564  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  66.88 
 
 		 457 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.440257  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3685  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  66.67 
 
 		 457 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.627974  normal  0.0175665 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0849  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  66.81 
 
 		 456 aa  608  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.423652  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1573  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  66.45 
 
 		 453 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.167063  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3405  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  67.32 
 
 		 456 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.315952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3211  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  64.57 
 
 		 459 aa  595  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0179113  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2539  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  53.88 
 
 		 444 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.289464  normal  0.687458 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3317  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  56.67 
 
 		 447 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000807334 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3166  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  56.67 
 
 		 447 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.544269  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3305  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  56.67 
 
 		 453 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.478432  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3431  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  53.86 
 
 		 444 aa  489  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.210332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2881  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  53.54 
 
 		 444 aa  489  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0069433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3438  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  53.76 
 
 		 444 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0116179  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3563  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  53.76 
 
 		 444 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0832128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0924  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  53.76 
 
 		 444 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0108933  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3366  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  53.76 
 
 		 444 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00916796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0938  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  53.54 
 
 		 444 aa  488  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000225132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0974  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  53.76 
 
 		 444 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000147177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0936  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  53.76 
 
 		 444 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0940  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  54.3 
 
 		 444 aa  486  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3103  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  53.1 
 
 		 444 aa  483  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1080  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  53.54 
 
 		 445 aa  484  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1103  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  53.64 
 
 		 444 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3617  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  53.42 
 
 		 472 aa  478  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00607859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00745  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  52.67 
 
 		 446 aa  476  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1693  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  53.56 
 
 		 446 aa  476  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0452  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  51.54 
 
 		 457 aa  476  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441683  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1884  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  53.11 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000568593  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03275  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  54 
 
 		 466 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0953  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  56.07 
 
 		 449 aa  468  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.870804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25280  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  54.22 
 
 		 445 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1569  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  52.56 
 
 		 449 aa  465  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272419  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0746  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  52.89 
 
 		 446 aa  464  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.122906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2160  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  53.78 
 
 		 445 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.952196  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0949  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  53.2 
 
 		 444 aa  464  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00658767  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0982  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  52.31 
 
 		 444 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150334  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1711  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  51.33 
 
 		 445 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.282478  normal  0.0341241 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1595  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  53.11 
 
 		 445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1931  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  49.78 
 
 		 451 aa  450  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1797  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  50.67 
 
 		 447 aa  445  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002707  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  53.19 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000207238  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0811  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  51.66 
 
 		 446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0949  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  50.22 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14590  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  50.56 
 
 		 445 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2389  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  50.77 
 
 		 452 aa  426  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3417  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  45.86 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2424  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  49.45 
 
 		 450 aa  411  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2104  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  49.01 
 
 		 450 aa  409  1e-113  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0100  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  48.6 
 
 		 454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.178382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2385  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  35.32 
 
 		 451 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2138  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  36.06 
 
 		 448 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000022983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12163  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  33.41 
 
 		 449 aa  261  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0043  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  33.11 
 
 		 451 aa  260  4e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2182  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  32.6 
 
 		 451 aa  225  1e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2536  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  27.56 
 
 		 446 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.892294  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0002  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  28.97 
 
 		 465 aa  162  9e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0536  electron transport complex protein RnfC  22.25 
 
 		 773 aa  57.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000392819  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2355  electron transport complex protein RnfC  23.84 
 
 		 825 aa  50.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0988  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  20.98 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002947  electron transport complex protein RnfC  21.4 
 
 		 916 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.703595  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1870  electron transport complex protein RnfC  25 
 
 		 716 aa  47.8  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00517809  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1310  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  21.59 
 
 		 441 aa  47  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1529  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  20.41 
 
 		 441 aa  47  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.427394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1155  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  20.13 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.47563 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0936  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  20.54 
 
 		 609 aa  45.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.787123  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1832  electron transport complex protein RnfC  22.92 
 
 		 880 aa  43.9  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0828396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>