67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2539 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3438  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  81.98 
 
 		 444 aa  766    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0116179  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2539  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  100 
 
 		 444 aa  906    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.289464  normal  0.687458 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0938  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  83.78 
 
 		 444 aa  780    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000225132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0924  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  81.98 
 
 		 444 aa  766    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0108933  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2881  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  82.66 
 
 		 444 aa  768    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0069433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0949  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  80.18 
 
 		 444 aa  741    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00658767  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0940  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  82.66 
 
 		 444 aa  773    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0974  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  82.88 
 
 		 444 aa  773    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000147177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0936  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  82.88 
 
 		 444 aa  773    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0452  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  67.26 
 
 		 457 aa  645    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441683  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3431  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  80.41 
 
 		 444 aa  752    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.210332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0982  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  77.93 
 
 		 444 aa  701    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150334  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3103  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  80.86 
 
 		 444 aa  758    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3563  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  81.76 
 
 		 444 aa  763    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0832128  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1103  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  82.88 
 
 		 444 aa  774    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3617  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  81.08 
 
 		 472 aa  755    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00607859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3366  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  81.76 
 
 		 444 aa  764    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00916796  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1080  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  66.52 
 
 		 445 aa  625  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00745  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  65.47 
 
 		 446 aa  617  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1884  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  65.1 
 
 		 462 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000568593  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03275  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  64.43 
 
 		 466 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1693  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  64.43 
 
 		 446 aa  605  9.999999999999999e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002707  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  63.64 
 
 		 428 aa  579  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000207238  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0746  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  61.74 
 
 		 446 aa  568  1e-161  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.122906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0949  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  61.52 
 
 		 446 aa  568  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3305  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  59.96 
 
 		 453 aa  558  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.478432  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3166  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  59.96 
 
 		 447 aa  557  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.544269  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3317  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  59.73 
 
 		 447 aa  556  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000807334 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1573  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  59.56 
 
 		 453 aa  543  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.167063  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3582  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  60 
 
 		 453 aa  544  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2709  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  59.87 
 
 		 456 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000704045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0902  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  60.09 
 
 		 456 aa  535  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3272  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  60.09 
 
 		 456 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0748  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  60.09 
 
 		 456 aa  531  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1595  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  59.51 
 
 		 445 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0849  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  59.69 
 
 		 456 aa  533  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.423652  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1931  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  57.14 
 
 		 451 aa  531  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3378  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  60.09 
 
 		 456 aa  533  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1797  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  57.27 
 
 		 447 aa  531  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3405  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  58.61 
 
 		 456 aa  531  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.315952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1711  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  57.98 
 
 		 445 aa  524  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.282478  normal  0.0341241 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0811  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  58.04 
 
 		 446 aa  521  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3564  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  58.22 
 
 		 457 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.440257  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0953  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  59.02 
 
 		 449 aa  521  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.870804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0754  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  58.22 
 
 		 457 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.765141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3495  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  58.22 
 
 		 457 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3685  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  58 
 
 		 457 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.627974  normal  0.0175665 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2981  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  53.88 
 
 		 455 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2389  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  56.76 
 
 		 452 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14590  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  56.57 
 
 		 445 aa  505  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2160  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  56.82 
 
 		 445 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.952196  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3211  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  55.63 
 
 		 459 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0179113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25280  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  56.6 
 
 		 445 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1569  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  54.24 
 
 		 449 aa  486  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272419  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0100  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  51.42 
 
 		 454 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.178382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2424  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  50.99 
 
 		 450 aa  426  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3417  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  49.22 
 
 		 447 aa  425  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2104  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  50.55 
 
 		 450 aa  424  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2138  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  34.52 
 
 		 448 aa  268  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000022983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2385  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  33.56 
 
 		 451 aa  266  8e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12163  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  34.08 
 
 		 449 aa  259  6e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0043  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  32.81 
 
 		 451 aa  243  3.9999999999999997e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2182  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  32.14 
 
 		 451 aa  231  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2536  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  26.77 
 
 		 446 aa  187  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.892294  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0002  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  28.51 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0494  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  36.19 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0552147  hitchhiker  0.00321553 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2830  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  20.98 
 
 		 427 aa  43.9  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>