66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12163 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12163  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  100 
 
 		 449 aa  926    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0043  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  56.32 
 
 		 451 aa  538  9.999999999999999e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2182  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  42.98 
 
 		 451 aa  351  2e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2385  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  39.82 
 
 		 451 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2138  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  36.71 
 
 		 448 aa  300  3e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000022983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03275  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  35.43 
 
 		 466 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1931  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  35.37 
 
 		 451 aa  281  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1797  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  34.75 
 
 		 447 aa  280  4e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1884  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  35.2 
 
 		 462 aa  280  4e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000568593  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25280  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  35.71 
 
 		 445 aa  277  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3166  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  34.3 
 
 		 447 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.544269  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2389  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  35.86 
 
 		 452 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1693  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  35.12 
 
 		 446 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2881  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  33.78 
 
 		 444 aa  274  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0069433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3317  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  34.08 
 
 		 447 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000807334 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2160  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  34.53 
 
 		 445 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.952196  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3305  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  34.08 
 
 		 453 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.478432  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0452  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  33.86 
 
 		 457 aa  271  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441683  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0949  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  32.74 
 
 		 444 aa  265  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00658767  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0938  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  33.56 
 
 		 444 aa  265  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000225132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0974  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  33.33 
 
 		 444 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000147177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0936  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  33.33 
 
 		 444 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1711  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  34.61 
 
 		 445 aa  265  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.282478  normal  0.0341241 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002707  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  35.63 
 
 		 428 aa  264  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000207238  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0940  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  33.33 
 
 		 444 aa  263  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3438  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  33.56 
 
 		 444 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0116179  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0924  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  33.56 
 
 		 444 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0108933  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3366  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  33.56 
 
 		 444 aa  262  8e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00916796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3103  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  33.11 
 
 		 444 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00745  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  34.52 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2981  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  33.41 
 
 		 455 aa  261  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3563  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  33.33 
 
 		 444 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0832128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0746  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  34.15 
 
 		 446 aa  260  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.122906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2539  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  34.08 
 
 		 444 aa  259  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.289464  normal  0.687458 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1080  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  35.2 
 
 		 445 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0953  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  34.45 
 
 		 449 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.870804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0949  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  32.96 
 
 		 446 aa  257  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3617  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  33.11 
 
 		 472 aa  257  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00607859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1573  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  32.66 
 
 		 453 aa  256  5e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.167063  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3417  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  34 
 
 		 447 aa  256  5e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1103  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  32.89 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0982  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  33.93 
 
 		 444 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150334  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0811  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  32.89 
 
 		 446 aa  253  6e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3378  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  32.07 
 
 		 456 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0748  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  31.85 
 
 		 456 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1569  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  33.04 
 
 		 449 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272419  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3272  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  31.63 
 
 		 456 aa  251  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3431  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  32.21 
 
 		 444 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.210332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0849  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  32.52 
 
 		 456 aa  250  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.423652  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0902  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  31.85 
 
 		 456 aa  249  5e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2709  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  31.79 
 
 		 456 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000704045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3564  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  31.78 
 
 		 457 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.440257  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0754  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  31.78 
 
 		 457 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.765141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3495  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  31.78 
 
 		 457 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3685  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  31.78 
 
 		 457 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.627974  normal  0.0175665 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14590  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  32.14 
 
 		 445 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3582  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  30.54 
 
 		 453 aa  244  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3405  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  30.11 
 
 		 456 aa  236  8e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.315952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1595  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  31.25 
 
 		 445 aa  233  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3211  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  30.38 
 
 		 459 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0179113  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0100  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  32.74 
 
 		 454 aa  227  3e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.178382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2104  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  31.53 
 
 		 450 aa  215  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2424  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  31.08 
 
 		 450 aa  211  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2536  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  28.77 
 
 		 446 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.892294  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0002  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  28.91 
 
 		 465 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0079  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  20.87 
 
 		 443 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000481582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>