77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2709 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0849  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  75.49 
 
 		 456 aa  700    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.423652  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3378  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  76.54 
 
 		 456 aa  717    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3564  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  74.4 
 
 		 457 aa  698    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.440257  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3272  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  76.32 
 
 		 456 aa  717    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0748  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  75.88 
 
 		 456 aa  713    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3582  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  76.6 
 
 		 453 aa  734    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1573  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  73.51 
 
 		 453 aa  692    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.167063  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3495  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  74.4 
 
 		 457 aa  697    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3685  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  74.18 
 
 		 457 aa  694    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.627974  normal  0.0175665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0754  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  74.4 
 
 		 457 aa  697    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.765141  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2709  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  100 
 
 		 456 aa  925    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000704045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0902  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  76.75 
 
 		 456 aa  717    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3405  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  76.32 
 
 		 456 aa  721    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.315952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3211  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  68.85 
 
 		 459 aa  631  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0179113  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2981  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  67.11 
 
 		 455 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1693  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  60.09 
 
 		 446 aa  548  1e-155  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03275  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  60 
 
 		 466 aa  542  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2539  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  59.87 
 
 		 444 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.289464  normal  0.687458 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3431  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  60.09 
 
 		 444 aa  531  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.210332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0936  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  60.99 
 
 		 444 aa  534  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0974  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  60.99 
 
 		 444 aa  534  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000147177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3305  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  60.44 
 
 		 453 aa  534  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.478432  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1884  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  58.67 
 
 		 462 aa  528  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000568593  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0940  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  60.54 
 
 		 444 aa  528  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0938  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  60.31 
 
 		 444 aa  531  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000225132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3166  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  60.9 
 
 		 447 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.544269  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3317  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  60.9 
 
 		 447 aa  530  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000807334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3438  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  60.09 
 
 		 444 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0116179  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3103  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  59.42 
 
 		 444 aa  527  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0924  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  60.09 
 
 		 444 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0108933  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1103  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  59.42 
 
 		 444 aa  525  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2881  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  60.31 
 
 		 444 aa  527  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0069433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3563  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  60.09 
 
 		 444 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0832128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3366  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  59.87 
 
 		 444 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00916796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3617  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  60.09 
 
 		 472 aa  521  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00607859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002707  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  60.9 
 
 		 428 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000207238  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1080  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  59.42 
 
 		 445 aa  523  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0452  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  57.75 
 
 		 457 aa  523  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441683  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0949  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  57.4 
 
 		 446 aa  514  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0949  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  58.97 
 
 		 444 aa  514  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00658767  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00745  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  56.4 
 
 		 446 aa  509  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0746  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  56.38 
 
 		 446 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.122906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1711  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  55.51 
 
 		 445 aa  501  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.282478  normal  0.0341241 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1595  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  57.17 
 
 		 445 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0982  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  58.97 
 
 		 444 aa  495  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150334  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1797  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  54.83 
 
 		 447 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2160  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  57.17 
 
 		 445 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.952196  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0953  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  59.73 
 
 		 449 aa  488  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.870804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25280  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  56.73 
 
 		 445 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14590  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  55.61 
 
 		 445 aa  471  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0811  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  54.59 
 
 		 446 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1569  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  54.48 
 
 		 449 aa  468  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272419  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1931  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  54.46 
 
 		 451 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0100  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  51.43 
 
 		 454 aa  433  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.178382  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2389  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  52.9 
 
 		 452 aa  434  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2424  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  52.33 
 
 		 450 aa  423  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2104  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  52.11 
 
 		 450 aa  421  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3417  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  48.66 
 
 		 447 aa  415  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2138  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  36.47 
 
 		 448 aa  272  1e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000022983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2385  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  34.67 
 
 		 451 aa  271  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0043  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  34.75 
 
 		 451 aa  258  1e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12163  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  31.79 
 
 		 449 aa  248  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2182  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  31.42 
 
 		 451 aa  219  8.999999999999998e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2536  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  28.21 
 
 		 446 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.892294  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0002  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  30.25 
 
 		 465 aa  170  4e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0494  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  22.82 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0552147  hitchhiker  0.00321553 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0936  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  23.2 
 
 		 609 aa  57  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.787123  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0704  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  19 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0680  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  18.55 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0988  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  21.8 
 
 		 441 aa  53.5  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0079  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  21.82 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000481582  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1155  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  22.99 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.47563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1161  electron transport complex protein RnfC  30.48 
 
 		 570 aa  47  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2593  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  24.64 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1848  electron transport complex protein RnfC  19.91 
 
 		 793 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00264282  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1091  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  22.08 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.566886  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1785  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  22.84 
 
 		 567 aa  45.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>