50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2601 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  313  6e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2946  hypothetical protein  44.37 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125573  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3168  hypothetical protein  46.32 
 
 		 154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000633672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3576  hypothetical protein  44.68 
 
 		 154 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3071  hypothetical protein  44.85 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3719  hypothetical protein  46.46 
 
 		 148 aa  125  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000989384  normal  0.0383104 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2990  hypothetical protein  44.12 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000446281  normal  0.422538 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3162  hypothetical protein  42.42 
 
 		 187 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000326454  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1122  hypothetical protein  39.71 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000205985  normal  0.233923 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3496  hypothetical protein  41.38 
 
 		 144 aa  114  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00242449  hitchhiker  0.00393071 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3269  hypothetical protein  39.71 
 
 		 155 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575849  normal  0.0306422 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1020  hypothetical protein  38.97 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000462608  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1089  hypothetical protein  38.97 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000360525  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1025  hypothetical protein  39.29 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000544137  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0670  hypothetical protein  35.43 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00376699  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2860  hypothetical protein  29.79 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013794  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4789  hypothetical protein  34.29 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0307864  hitchhiker  0.00167919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5412  hypothetical protein  36.69 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0845  hypothetical protein  36.57 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62170  hypothetical protein  34.09 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.157561 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1005  hypothetical protein  32.86 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368062  hitchhiker  0.00000000000106362 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0980  hypothetical protein  35.66 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42530  hypothetical protein  29.45 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1795  hypothetical protein  27.34 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1728  hypothetical protein  28.12 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03187  hypothetical protein  28.47 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  26.15 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1508  hypothetical protein  41.38 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0660289  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1127  hypothetical protein  28.97 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0795312  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  30.84 
 
 		 179 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  26.14 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  41.18 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  41.18 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  41.18 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  41.18 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  36.51 
 
 		 178 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.31492 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56190  hypothetical protein  25.69 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4894  hypothetical protein  25.69 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  33.04 
 
 		 196 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0696  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001906  hypothetical protein  57.14 
 
 		 193 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661466  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3762  hypothetical protein  47.5 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0259  hypothetical protein  47.5 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328034 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  52.94 
 
 		 178 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0205  hypothetical protein  47.5 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.228683  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0260  hypothetical protein  47.5 
 
 		 177 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.454469  hitchhiker  0.00000127449 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0636  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00424939  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2066  ATP-binding region, ATPase-like  40.91 
 
 		 161 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000294793  normal  0.545491 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2650  hypothetical protein  31 
 
 		 203 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4470  hypothetical protein  47.37 
 
 		 177 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>