257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1332 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1332  thymidylate synthase  100 
 
 		 320 aa  663    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0118279  normal  0.0426843 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1977  thymidylate synthase  70.29 
 
 		 316 aa  453  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3787  thymidylate synthase  65.36 
 
 		 308 aa  420  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0846  thymidylate synthase  57.19 
 
 		 298 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0390  thymidylate synthase  56.21 
 
 		 298 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.137762  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2044  thymidylate synthase  55.88 
 
 		 298 aa  346  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.544458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0889  thymidylate synthase  50.17 
 
 		 280 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2861  thymidylate synthase  47.68 
 
 		 264 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.390329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2943  thymidylate synthase  47.68 
 
 		 264 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.782101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3039  thymidylate synthase  47.68 
 
 		 264 aa  272  7e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.448535 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1335  thymidylate synthase  47.02 
 
 		 264 aa  271  9e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  49.5 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0818  thymidylate synthase  49.83 
 
 		 264 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0867  thymidylate synthase  47.35 
 
 		 264 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1188  thymidylate synthase  46.69 
 
 		 264 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.122155  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1265  thymidylate synthase  47.02 
 
 		 264 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.678251  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1232  thymidylate synthase  47.02 
 
 		 264 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.902192  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2779  thymidylate synthase  45.7 
 
 		 264 aa  268  8e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.629836  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3269  thymidylate synthase  47.35 
 
 		 264 aa  268  8e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0325419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1146  thymidylate synthase  47.35 
 
 		 264 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153676  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0864  Thymidylate synthase  47.68 
 
 		 264 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4093  thymidylate synthase  47.68 
 
 		 264 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00531915  normal  0.186397 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3125  thymidylate synthase  46.69 
 
 		 264 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241682  normal  0.408001 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2974  thymidylate synthase  47.68 
 
 		 264 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0248193  normal  0.0110834 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3147  thymidylate synthase  47.68 
 
 		 264 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0907  thymidylate synthase  46.36 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3018  thymidylate synthase  48.84 
 
 		 267 aa  267  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0786237  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3148  thymidylate synthase  46.69 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3228  thymidylate synthase  46.69 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434826 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3214  thymidylate synthase  46.69 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0238211 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17460  thymidylate synthase  48.04 
 
 		 276 aa  266  2.9999999999999995e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.171384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3328  thymidylate synthase  46.69 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937763 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3165  thymidylate synthase  46.69 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.623255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2973  thymidylate synthase  47.35 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.942182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0888  thymidylate synthase  47.35 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3035  thymidylate synthase  47.02 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3396  thymidylate synthase  46.36 
 
 		 264 aa  266  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0862662  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02675  thymidylate synthase  47.35 
 
 		 264 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02636  hypothetical protein  47.35 
 
 		 264 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0282174  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4970  thymidylate synthase  48.68 
 
 		 274 aa  265  7e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3172  thymidylate synthase  49.84 
 
 		 298 aa  265  7e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  48.17 
 
 		 267 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1450  thymidylate synthase  47.08 
 
 		 279 aa  264  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.810743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1581  thymidylate synthase  46.86 
 
 		 264 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000941291  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  47.35 
 
 		 264 aa  262  6e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  47.35 
 
 		 264 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3821  thymidylate synthase  45.36 
 
 		 264 aa  262  6.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0782248  normal  0.435378 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1036  thymidylate synthase  45.03 
 
 		 264 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0984  thymidylate synthase  45.03 
 
 		 264 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00298799  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2568  thymidylate synthase  45.7 
 
 		 264 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2772  thymidylate synthase  47.73 
 
 		 276 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.023604 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3238  thymidylate synthase  45.03 
 
 		 264 aa  259  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1116  thymidylate synthase  46.75 
 
 		 277 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0387  thymidylate synthase  45.7 
 
 		 264 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4491  thymidylate synthase  46.95 
 
 		 276 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232863 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl419  thymidylate synthase  44.55 
 
 		 288 aa  258  8e-68  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0183487  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1197  thymidylate synthase  46.75 
 
 		 277 aa  257  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  47.51 
 
 		 264 aa  257  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  47.51 
 
 		 264 aa  257  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2832  thymidylate synthase  46.36 
 
 		 264 aa  257  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3195  thymidylate synthase  46.36 
 
 		 264 aa  257  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  45.03 
 
 		 264 aa  257  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0381  thymidylate synthase  45.36 
 
 		 264 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2051  thymidylate synthase  47.08 
 
 		 283 aa  255  6e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.266097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1592  thymidylate synthase  47.35 
 
 		 264 aa  255  8e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00136284  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29370  thymidylate synthase  47.18 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1664  thymidylate synthase  46.1 
 
 		 289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  46.03 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2864  thymidylate synthase  46.38 
 
 		 275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.292477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1823  thymidylate synthase  46.43 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10557  hitchhiker  0.00355293 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2589  thymidylate synthase  45.7 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  46.69 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0572  thymidylate synthase  44.76 
 
 		 277 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3014  thymidylate synthase  45.36 
 
 		 264 aa  253  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1760  thymidylate synthase  47.18 
 
 		 265 aa  252  5.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2099  thymidylate synthase  46.51 
 
 		 266 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2112  thymidylate synthase  46.51 
 
 		 266 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2158  thymidylate synthase  46.51 
 
 		 266 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.46216 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4439  Thymidylate synthase  47.37 
 
 		 268 aa  251  9.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.613573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2986  thymidylate synthase  46.1 
 
 		 277 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1309  thymidylate synthase  44.37 
 
 		 264 aa  249  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00097821  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4007  thymidylate synthase  46.18 
 
 		 266 aa  250  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211563  normal  0.0387456 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  46.18 
 
 		 264 aa  249  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2331  thymidylate synthase  45.07 
 
 		 286 aa  249  4e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0544  thymidylate synthase  44.88 
 
 		 264 aa  249  6e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.249699  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0769  thymidylate synthase  43.56 
 
 		 320 aa  249  6e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  45.85 
 
 		 264 aa  248  7e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2728  thymidylate synthase  45.51 
 
 		 260 aa  248  8e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218702  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2927  thymidylate synthase  45.18 
 
 		 264 aa  248  8e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2781  thymidylate synthase  45.18 
 
 		 264 aa  248  8e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12777  thymidylate synthase  46.51 
 
 		 263 aa  248  9e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.470596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  47.68 
 
 		 264 aa  248  9e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1260  thymidylate synthase  45.95 
 
 		 282 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000721083 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0442  thymidylate synthase  44.37 
 
 		 296 aa  247  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  47.02 
 
 		 271 aa  247  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0404  thymidylate synthase  46.51 
 
 		 290 aa  247  2e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2380  thymidylate synthase  45.85 
 
 		 266 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.029199 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0350  thymidylate synthase  44.44 
 
 		 277 aa  246  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.82099  normal  0.227002 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1731  thymidylate synthase  44.37 
 
 		 264 aa  246  3e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  47.18 
 
 		 264 aa  246  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>