98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0594 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0594  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  487  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5304  hypothetical protein  57.58 
 
 
258 aa  275  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1524  hypothetical protein  56.12 
 
 
249 aa  274  8e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0472  hypothetical protein  54.62 
 
 
247 aa  262  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.249938  normal  0.535874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0461  hypothetical protein  54.62 
 
 
247 aa  262  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.304933  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0448  hypothetical protein  54.2 
 
 
247 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3660  beta-lactamase domain-containing protein  52.5 
 
 
239 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2887  Beta-lactamase-like protein  45.22 
 
 
248 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5452  beta-lactamase domain-containing protein  47.64 
 
 
243 aa  210  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0473701 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3489  hypothetical protein  47.56 
 
 
242 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.969002  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3079  beta-lactamase domain protein  44.77 
 
 
248 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2974  beta-lactamase-like protein  44.86 
 
 
252 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0313098  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0281  hypothetical protein  44.22 
 
 
163 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0229241 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  24.46 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  23.17 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  24.3 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0538  Beta-lactamase-like  26.58 
 
 
233 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2284  uncharacterized flavoprotein  27.95 
 
 
411 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0014767  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3876  beta-lactamase domain protein  21.66 
 
 
402 aa  62  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0232  flavodoxin  24.47 
 
 
401 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0086  hypothetical protein  22.69 
 
 
213 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307031  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5045  beta-lactamase domain-containing protein  28.12 
 
 
234 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.521879  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4522  beta-lactamase domain-containing protein  28.12 
 
 
234 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.88502  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  22.62 
 
 
405 aa  58.9  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  23.53 
 
 
404 aa  58.9  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.0000871777 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  19.82 
 
 
387 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  21.7 
 
 
395 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  23.58 
 
 
395 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0504  beta-lactamase domain protein  22.13 
 
 
405 aa  56.2  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  22.37 
 
 
425 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  21.67 
 
 
407 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  20.72 
 
 
387 aa  55.5  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  22.11 
 
 
393 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  22.71 
 
 
407 aa  53.9  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  24.85 
 
 
404 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  25.51 
 
 
582 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  19.82 
 
 
407 aa  54.3  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0082  beta-lactamase domain protein  23.38 
 
 
414 aa  53.9  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.143007  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  24.88 
 
 
406 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  23.45 
 
 
418 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  23.69 
 
 
399 aa  52.8  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000705459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  21.76 
 
 
576 aa  52.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  24.17 
 
 
402 aa  52  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.48 
 
 
574 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  24.88 
 
 
406 aa  52  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  25.18 
 
 
400 aa  52  0.000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2557  beta-lactamase domain protein  26.05 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.583667  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2086  beta-lactamase domain-containing protein  23.79 
 
 
394 aa  51.2  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  21.78 
 
 
387 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  22.12 
 
 
398 aa  50.4  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2889  beta-lactamase domain-containing protein  25.2 
 
 
410 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.726482  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  21.92 
 
 
575 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.09 
 
 
397 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  20.69 
 
 
407 aa  49.7  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  21.65 
 
 
576 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  23.98 
 
 
572 aa  49.3  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0804  flavodoxin  22.22 
 
 
402 aa  48.9  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  28.17 
 
 
395 aa  48.9  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  21.13 
 
 
576 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  19.64 
 
 
394 aa  48.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000351493  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1920  beta-lactamase domain protein  27.37 
 
 
393 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0302  flavin reductase-like, FMN-binding  22.94 
 
 
575 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225736  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  21.83 
 
 
392 aa  48.5  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2027  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.52 
 
 
404 aa  47.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.719198  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1332  beta-lactamase domain protein  24.49 
 
 
254 aa  47  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  20.44 
 
 
397 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2821  beta-lactamase domain-containing protein  21.2 
 
 
404 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000596505  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.73 
 
 
575 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0503  beta-lactamase domain-containing protein  22.48 
 
 
401 aa  47  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0527629  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.73 
 
 
575 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  25.86 
 
 
402 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  22.64 
 
 
391 aa  46.2  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1485  beta-lactamase-like protein  20.83 
 
 
417 aa  45.8  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000931355  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  24.31 
 
 
396 aa  45.4  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1439  flavin reductase-like, FMN-binding  22.96 
 
 
579 aa  45.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06350  uncharacterized flavoprotein  23.84 
 
 
420 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.882044  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  24.39 
 
 
387 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3243  beta-lactamase domain-containing protein  24.11 
 
 
308 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.012802  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  19.84 
 
 
884 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0910  beta-lactamase domain-containing protein  20.63 
 
 
253 aa  43.9  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  21.28 
 
 
407 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  20.75 
 
 
404 aa  43.9  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1078  metallo-beta-lactamase family protein  19.2 
 
 
408 aa  43.9  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0932  beta-lactamase domain-containing protein  20.63 
 
 
253 aa  43.9  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  29.83 
 
 
431 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  23.74 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  24.34 
 
 
504 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  27.82 
 
 
321 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  22.12 
 
 
259 aa  43.1  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1802  flavin reductase-like, FMN-binding  21.94 
 
 
574 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0386  beta-lactamase domain-containing protein  22.73 
 
 
407 aa  42.4  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  20.88 
 
 
423 aa  42.4  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1459  flavin reductase domain protein FMN-binding  21.36 
 
 
573 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  23.36 
 
 
571 aa  42.4  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  19.84 
 
 
395 aa  42  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057389  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  22.22 
 
 
387 aa  42  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  25.97 
 
 
421 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.97 
 
 
575 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>