193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2557 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2557  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
263 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.583667  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2027  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.79 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.719198  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  27.14 
 
 
395 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3876  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 
402 aa  75.9  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0504  beta-lactamase domain protein  29.29 
 
 
405 aa  75.5  0.0000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.41 
 
 
498 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  23.56 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.6 
 
 
575 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1439  flavin reductase-like, FMN-binding  29.85 
 
 
579 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.6 
 
 
575 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3033  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.15 
 
 
485 aa  73.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.583429  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  22.81 
 
 
406 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0082  beta-lactamase domain protein  25.14 
 
 
414 aa  72.4  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.143007  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.21 
 
 
505 aa  72.4  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.94 
 
 
493 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.41 
 
 
504 aa  72  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  28.36 
 
 
572 aa  71.6  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  26.87 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.41 
 
 
500 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.68 
 
 
494 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2086  beta-lactamase domain-containing protein  29.56 
 
 
394 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  25.19 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 
407 aa  69.3  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.85 
 
 
575 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  30.6 
 
 
571 aa  68.9  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.68 
 
 
482 aa  68.9  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  30.34 
 
 
407 aa  68.6  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.36 
 
 
575 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.85 
 
 
574 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  23.01 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.94 
 
 
479 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  27.94 
 
 
479 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.94 
 
 
479 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.94 
 
 
479 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.94 
 
 
479 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000635155 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.94 
 
 
479 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  28.4 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  27.66 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25.71 
 
 
499 aa  67.8  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  27.94 
 
 
479 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 
395 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.94 
 
 
479 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.94 
 
 
479 aa  67.8  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.94 
 
 
479 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.94 
 
 
479 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.94 
 
 
479 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  26.43 
 
 
399 aa  67  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2180  flavoprotein  28.28 
 
 
582 aa  67  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0281  hypothetical protein  31.11 
 
 
163 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0229241 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.94 
 
 
479 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1524  hypothetical protein  28.51 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  25.58 
 
 
395 aa  67  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  25.6 
 
 
400 aa  66.6  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00481  flavoprotein  23.57 
 
 
589 aa  65.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  25.29 
 
 
404 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2480  beta-lactamase domain protein  24.53 
 
 
394 aa  65.9  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.877522  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  27.65 
 
 
425 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  26.95 
 
 
403 aa  65.5  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1376  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  23.17 
 
 
591 aa  65.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  27.01 
 
 
393 aa  65.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06350  uncharacterized flavoprotein  28.74 
 
 
420 aa  65.1  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.882044  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  27.61 
 
 
576 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.21 
 
 
503 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0302  flavin reductase-like, FMN-binding  27.61 
 
 
575 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225736  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2821  beta-lactamase domain-containing protein  26.39 
 
 
404 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000596505  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  24.05 
 
 
402 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28461  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  25.52 
 
 
591 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.751796 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2530  flavoprotein  26.9 
 
 
582 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.707378 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  24.75 
 
 
393 aa  63.9  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00571  flavoprotein  22.89 
 
 
592 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  23.6 
 
 
392 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0804  flavodoxin  26.39 
 
 
402 aa  63.5  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3149  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.21 
 
 
479 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0409708 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0795  beta-lactamase-like  31.39 
 
 
395 aa  63.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0893314  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1413  beta-lactamase domain-containing protein  24.26 
 
 
392 aa  62.4  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  27.43 
 
 
407 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  27.7 
 
 
582 aa  62.8  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1802  flavin reductase-like, FMN-binding  29.85 
 
 
574 aa  62.4  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  23.12 
 
 
402 aa  62.4  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.27 
 
 
394 aa  62.4  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000351493  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  27.07 
 
 
399 aa  62  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000705459 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  32.37 
 
 
431 aa  62  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  29.2 
 
 
387 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0174  ATPase domain-containing protein  27 
 
 
394 aa  62  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00461  flavoprotein  23.57 
 
 
591 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.551818  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  20.19 
 
 
396 aa  61.6  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  26.62 
 
 
407 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00501  flavoprotein  22.76 
 
 
591 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1078  metallo-beta-lactamase family protein  25.66 
 
 
408 aa  60.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  27.21 
 
 
396 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000111538  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  25.15 
 
 
407 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  23.35 
 
 
396 aa  60.1  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  23.74 
 
 
508 aa  60.1  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.32 
 
 
576 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2942  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  20.79 
 
 
397 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0065497  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3660  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 
239 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.32 
 
 
576 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  24.11 
 
 
397 aa  59.7  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000136277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>