67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1524 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1524  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  496  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5304  hypothetical protein  61.35 
 
 		 258 aa  304  8.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0472  hypothetical protein  56.36 
 
 		 247 aa  265  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.249938  normal  0.535874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0461  hypothetical protein  56.36 
 
 		 247 aa  265  5e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.304933  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0448  hypothetical protein  55.93 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0594  hypothetical protein  56.12 
 
 		 240 aa  261  6e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3660  beta-lactamase domain-containing protein  55.56 
 
 		 239 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2887  Beta-lactamase-like protein  49.57 
 
 		 248 aa  214  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3079  beta-lactamase domain protein  49.37 
 
 		 248 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2974  beta-lactamase-like protein  48.97 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3489  hypothetical protein  47.7 
 
 		 242 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.969002  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5452  beta-lactamase domain-containing protein  47.75 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0473701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0281  hypothetical protein  52.45 
 
 		 163 aa  161  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0229241 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0538  Beta-lactamase-like  30.09 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5045  beta-lactamase domain-containing protein  30.4 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.521879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4522  beta-lactamase domain-containing protein  30.4 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.88502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  23.65 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0086  hypothetical protein  22.09 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  26.83 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  25.85 
 
 		 395 aa  58.5  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2557  beta-lactamase domain protein  28.4 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.583667  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  22.27 
 
 		 425 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 		 405 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  21.23 
 
 		 407 aa  54.3  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  22.89 
 
 		 397 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2480  beta-lactamase domain protein  22.27 
 
 		 394 aa  52.8  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.877522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  21.08 
 
 		 407 aa  52  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2284  uncharacterized flavoprotein  28.33 
 
 		 411 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0014767  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  21.8 
 
 		 407 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  20.75 
 
 		 407 aa  50.4  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  19.81 
 
 		 407 aa  50.1  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  21.4 
 
 		 406 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  19.81 
 
 		 407 aa  48.9  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  23.19 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  23.12 
 
 		 396 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  23.66 
 
 		 402 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.36 
 
 		 575 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  20.93 
 
 		 406 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  29.65 
 
 		 409 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 		 421 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  28.78 
 
 		 263 aa  46.2  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  21.08 
 
 		 575 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.26 
 
 		 394 aa  45.4  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000351493  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1078  metallo-beta-lactamase family protein  29.31 
 
 		 408 aa  45.8  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  22.64 
 
 		 396 aa  45.4  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  22.02 
 
 		 418 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0386  beta-lactamase domain-containing protein  25.74 
 
 		 407 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  24.42 
 
 		 404 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1458  uncharacterized flavoprotein  22.58 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408198  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  25.3 
 
 		 423 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  21.79 
 
 		 582 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  20.98 
 
 		 399 aa  43.9  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  23.27 
 
 		 402 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0503  beta-lactamase domain-containing protein  23.56 
 
 		 401 aa  44.3  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0527629  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  22.22 
 
 		 399 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  22.22 
 
 		 399 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  20.98 
 
 		 576 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  25.36 
 
 		 571 aa  43.5  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  19.16 
 
 		 396 aa  43.1  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  21.15 
 
 		 576 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  21.64 
 
 		 404 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.0000871777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  27.12 
 
 		 322 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  22.09 
 
 		 400 aa  42.7  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  31.86 
 
 		 247 aa  42.4  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0504  beta-lactamase domain protein  23.19 
 
 		 405 aa  42.4  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0082  beta-lactamase domain protein  21.32 
 
 		 414 aa  42  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.143007  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.56 
 
 		 574 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>