56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_B0086 on replicon NC_011092
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011092  SeSA_B0086  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  440  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307031  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0281  hypothetical protein  28.38 
 
 
163 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0229241 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  24.38 
 
 
396 aa  63.2  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5304  hypothetical protein  22.53 
 
 
258 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3660  beta-lactamase domain-containing protein  23.2 
 
 
239 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3489  hypothetical protein  23.39 
 
 
242 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.969002  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1524  hypothetical protein  22.09 
 
 
249 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0082  beta-lactamase domain protein  24.56 
 
 
414 aa  59.3  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.143007  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0594  hypothetical protein  21.6 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0461  hypothetical protein  23.26 
 
 
247 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.304933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0472  hypothetical protein  23.26 
 
 
247 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.249938  normal  0.535874 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2887  Beta-lactamase-like protein  22.22 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5452  beta-lactamase domain-containing protein  24.5 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0473701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0448  hypothetical protein  23.26 
 
 
247 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  25.76 
 
 
572 aa  55.5  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  24.06 
 
 
396 aa  55.1  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2027  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.74 
 
 
404 aa  53.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.719198  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0804  flavodoxin  25.62 
 
 
402 aa  53.1  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0232  flavodoxin  25.73 
 
 
401 aa  52  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3079  beta-lactamase domain protein  23.73 
 
 
248 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1439  flavin reductase-like, FMN-binding  25.64 
 
 
579 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0770  flavin reductase-like, FMN-binding  24.23 
 
 
574 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2889  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 
410 aa  48.9  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.726482  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2974  beta-lactamase-like protein  23.16 
 
 
252 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0313098  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  23.53 
 
 
406 aa  48.5  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  20.71 
 
 
406 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  24.06 
 
 
370 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2520  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 
306 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118194  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  31.08 
 
 
312 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0503  beta-lactamase domain-containing protein  24.1 
 
 
401 aa  47.4  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0527629  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.64 
 
 
575 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0538  Beta-lactamase-like  24.09 
 
 
233 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  28.03 
 
 
401 aa  46.2  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.79 
 
 
394 aa  45.8  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000351493  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3876  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
402 aa  45.8  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1803  flavin reductase-like, FMN-binding  24.1 
 
 
570 aa  45.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.44 
 
 
575 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  24.85 
 
 
399 aa  45.4  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  26.53 
 
 
308 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  27.37 
 
 
308 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  29.11 
 
 
405 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.91 
 
 
575 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.91 
 
 
575 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0121  beta-lactamase-like protein  25 
 
 
309 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381436  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2557  beta-lactamase domain protein  26.76 
 
 
263 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.583667  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  24.63 
 
 
498 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0504  beta-lactamase domain protein  23.72 
 
 
405 aa  43.5  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  23.12 
 
 
398 aa  43.1  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  35.21 
 
 
310 aa  43.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  22.41 
 
 
404 aa  42.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.0000871777 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0320  beta-lactamase domain-containing protein  21.24 
 
 
388 aa  42.7  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
396 aa  42.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  25 
 
 
396 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000111538  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.13 
 
 
493 aa  42.4  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.47 
 
 
306 aa  42  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2821  beta-lactamase domain-containing protein  23.67 
 
 
404 aa  42  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000596505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>