97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0393 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0393  transposase (class IV)  100 
 
 		 71 aa  144  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216875  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  81.69 
 
 		 273 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  81.69 
 
 		 273 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  71.83 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  71.83 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  71.83 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  71.83 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  71.83 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  71.83 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  71.83 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  71.83 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  71.83 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  71.83 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  71.83 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  71.83 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  67.61 
 
 		 278 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  66.2 
 
 		 274 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2358  transposase, IS4 family protein  64.79 
 
 		 235 aa  99.4  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.501674  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0095  transposase, IS4 family protein  64.79 
 
 		 293 aa  99  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  63.38 
 
 		 275 aa  99  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  61.97 
 
 		 276 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1515  IS4 family transposase  57.14 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00015813  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3112  hypothetical protein  56.92 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2723  transposase  52.78 
 
 		 278 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  45.07 
 
 		 274 aa  61.6  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  45.07 
 
 		 274 aa  61.6  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1794  transposase IS5 family protein  45.07 
 
 		 274 aa  61.6  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0951166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  45.07 
 
 		 274 aa  61.6  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  45.07 
 
 		 274 aa  61.6  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  45.07 
 
 		 274 aa  61.6  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  45.07 
 
 		 274 aa  61.6  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  45.07 
 
 		 274 aa  61.6  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  45.07 
 
 		 274 aa  61.6  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4117  transposase, IS4  47.89 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3075  transposase, IS4  46.48 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  46.48 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2998  transposase, IS4  45.07 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5099  IS4 family transposase  43.48 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.402428 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  43.48 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  43.48 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  43.48 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  43.48 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  43.48 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  43.48 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  43.48 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  43.48 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7626  transposase IS4 family protein  33.8 
 
 		 298 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  42.03 
 
 		 270 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  42.03 
 
 		 270 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8348  transposase IS4 family protein  30.99 
 
 		 285 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12651  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8548  transposase IS4 family protein  30.99 
 
 		 285 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.303923  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8570  transposase IS4 family protein  30.99 
 
 		 285 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0640  transposase IS4 family protein  30.99 
 
 		 285 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0928  transposase IS4 family protein  30.99 
 
 		 285 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0942  transposase IS4 family protein  30.99 
 
 		 285 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2057  transposase IS4 family protein  30.99 
 
 		 285 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2130  transposase IS4 family protein  30.99 
 
 		 285 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2551  transposase IS4 family protein  30.99 
 
 		 285 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3566  transposase IS4 family protein  30.99 
 
 		 285 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2970  transposase IS4 family protein  30.99 
 
 		 285 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0996557  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2689  transposase IS4 family protein  30.99 
 
 		 285 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3172  transposase IS4 family protein  30.99 
 
 		 285 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274385  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4866  transposase IS4 family protein  30.99 
 
 		 285 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6121  transposase IS4 family protein  30.99 
 
 		 285 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6956  transposase IS4 family protein  30.99 
 
 		 285 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7344  transposase IS4 family protein  30.99 
 
 		 285 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.298249  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7484  transposase IS4 family protein  30.99 
 
 		 285 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4213  transposase, IS4  40.3 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  38.81 
 
 		 274 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  37.14 
 
 		 280 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  38.81 
 
 		 274 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  38.81 
 
 		 274 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  38.81 
 
 		 274 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  38.81 
 
 		 274 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0151  transposase, IS4  40.3 
 
 		 250 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  38.81 
 
 		 274 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  39.13 
 
 		 268 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2961  transposase IS4 family protein  43.28 
 
 		 250 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  34.29 
 
 		 274 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  39.19 
 
 		 295 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  39.19 
 
 		 295 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  39.19 
 
 		 295 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  37.68 
 
 		 268 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0762  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 276 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0641157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7602  transposase IS4 family protein  42.03 
 
 		 270 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0954844  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0893  transposase  32.76 
 
 		 294 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0746  transposase  28.17 
 
 		 156 aa  42  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.243384  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0744  transposase  28.17 
 
 		 156 aa  42  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.321514  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0335  transposase  28.17 
 
 		 156 aa  42  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4093  transposase, IS4  34.78 
 
 		 254 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  32 
 
 		 274 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  32 
 
 		 274 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02776  ISXo3 transposase ORF B  33.33 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  32 
 
 		 274 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  30.99 
 
 		 274 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  32.39 
 
 		 270 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>