More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1024 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1024  lipoyl synthase  100 
 
 		 280 aa  574  1.0000000000000001e-163  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  55.72 
 
 		 321 aa  335  7e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  55.3 
 
 		 334 aa  326  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  50.54 
 
 		 318 aa  324  9e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  53.31 
 
 		 318 aa  323  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  52.94 
 
 		 335 aa  323  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  52.57 
 
 		 338 aa  323  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  52.57 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  52.57 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  55.93 
 
 		 283 aa  322  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  52.57 
 
 		 338 aa  322  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  54.92 
 
 		 335 aa  321  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  52.94 
 
 		 309 aa  321  8e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  54.17 
 
 		 334 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  51.84 
 
 		 323 aa  318  5e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  54.38 
 
 		 306 aa  318  6e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  51.84 
 
 		 327 aa  318  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  51.84 
 
 		 340 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  55.56 
 
 		 330 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  50.91 
 
 		 303 aa  317  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  50.91 
 
 		 303 aa  317  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  55.17 
 
 		 330 aa  316  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  52.21 
 
 		 325 aa  316  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  52.45 
 
 		 355 aa  315  5e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  54.79 
 
 		 329 aa  314  8e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  53.96 
 
 		 289 aa  314  8e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  55.17 
 
 		 330 aa  314  8e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  54.79 
 
 		 329 aa  314  8e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  54.79 
 
 		 329 aa  314  8e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  55.17 
 
 		 330 aa  314  8e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  54.79 
 
 		 329 aa  314  8e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  54.79 
 
 		 329 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  54.79 
 
 		 329 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  54.79 
 
 		 329 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  54.05 
 
 		 282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  54.79 
 
 		 329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  52.36 
 
 		 357 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  54.41 
 
 		 330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  54.41 
 
 		 330 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  51.7 
 
 		 320 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  54.41 
 
 		 330 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  51.3 
 
 		 339 aa  311  4.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  51.8 
 
 		 291 aa  311  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2940  lipoyl synthase  53.6 
 
 		 289 aa  311  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  51.69 
 
 		 318 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  56.32 
 
 		 291 aa  311  6.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  52.73 
 
 		 326 aa  311  9e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  52.73 
 
 		 326 aa  311  9e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0086  lipoyl synthase  53.41 
 
 		 331 aa  310  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0061  lipoyl synthase  53.41 
 
 		 330 aa  310  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0567  lipoic acid synthetase  52.35 
 
 		 289 aa  310  2e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  52.77 
 
 		 304 aa  310  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  52 
 
 		 327 aa  309  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0242  lipoyl synthase  52.59 
 
 		 332 aa  308  5.9999999999999995e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  50.37 
 
 		 319 aa  308  6.999999999999999e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  53.14 
 
 		 292 aa  308  6.999999999999999e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0322  lipoyl synthase  53.03 
 
 		 333 aa  308  9e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0410  lipoyl synthase  52.36 
 
 		 326 aa  308  9e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3093  lipoyl synthase  50 
 
 		 324 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  53.41 
 
 		 314 aa  307  1.0000000000000001e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2200  lipoyl synthase  50.92 
 
 		 317 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.810557  normal  0.0342252 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2570  lipoyl synthase  50.92 
 
 		 317 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0401  lipoyl synthase  51.47 
 
 		 331 aa  306  4.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.192986 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  52.16 
 
 		 294 aa  305  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  50.91 
 
 		 332 aa  305  5.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0184  lipoyl synthase  52.27 
 
 		 333 aa  305  6e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  0.998847 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0178  lipoyl synthase  52.27 
 
 		 333 aa  305  7e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  52 
 
 		 321 aa  305  7e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5917  lipoyl synthase  51.15 
 
 		 328 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0749  lipoyl synthase  51.28 
 
 		 347 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.58387  normal  0.798574 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  50.37 
 
 		 311 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  48.9 
 
 		 324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0899  lipoyl synthase  51.28 
 
 		 347 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0470  lipoyl synthase  51.33 
 
 		 332 aa  303  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  54.17 
 
 		 315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  52.4 
 
 		 297 aa  304  1.0000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  50.18 
 
 		 337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  54.17 
 
 		 315 aa  303  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  52.36 
 
 		 322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  55.77 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  54.75 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  53.85 
 
 		 308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  50.9 
 
 		 320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  49.09 
 
 		 298 aa  302  3.0000000000000004e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  51.1 
 
 		 325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  55.38 
 
 		 298 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0744  lipoyl synthase  51.28 
 
 		 347 aa  302  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  55.38 
 
 		 298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  55.38 
 
 		 298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  55.38 
 
 		 298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  55.38 
 
 		 298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  55.38 
 
 		 298 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  55.38 
 
 		 298 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0287  lipoyl synthase  53.26 
 
 		 314 aa  302  5.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0533885  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  55.38 
 
 		 298 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3757  lipoyl synthase  50.38 
 
 		 326 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0485522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4749  lipoyl synthase  51.66 
 
 		 306 aa  301  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108215 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 328 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  54.23 
 
 		 298 aa  300  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  55 
 
 		 298 aa  300  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>