More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0036 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0036  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 532 aa  1048    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  33.52 
 
 		 558 aa  296  9e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  33.7 
 
 		 554 aa  293  7e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  34.18 
 
 		 553 aa  291  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  32.54 
 
 		 559 aa  284  4.0000000000000003e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  34.18 
 
 		 553 aa  282  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  31.16 
 
 		 569 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  31 
 
 		 559 aa  274  3e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  31.34 
 
 		 554 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  31.98 
 
 		 573 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  34.46 
 
 		 580 aa  271  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  34.82 
 
 		 565 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  32.75 
 
 		 577 aa  270  5e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  30.6 
 
 		 568 aa  269  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  32.2 
 
 		 608 aa  268  2e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  32.19 
 
 		 556 aa  267  4e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 572 aa  265  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  33.69 
 
 		 561 aa  265  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  31.55 
 
 		 555 aa  265  2e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  30.22 
 
 		 568 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  32.93 
 
 		 579 aa  263  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  32.87 
 
 		 579 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  33.04 
 
 		 579 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  32.87 
 
 		 583 aa  261  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  32.87 
 
 		 579 aa  261  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  33.04 
 
 		 579 aa  261  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  29.41 
 
 		 605 aa  260  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  32.87 
 
 		 583 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  31.02 
 
 		 555 aa  259  6e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  31.95 
 
 		 553 aa  259  6e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  34.51 
 
 		 562 aa  259  7e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  32.87 
 
 		 579 aa  259  8e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  32.87 
 
 		 579 aa  259  8e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  33.95 
 
 		 567 aa  258  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  30.85 
 
 		 556 aa  258  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  31.25 
 
 		 560 aa  257  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  32.69 
 
 		 579 aa  257  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1860  DNA repair protein RecN  31.35 
 
 		 558 aa  256  5e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.457848  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  33.09 
 
 		 551 aa  256  7e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  30.52 
 
 		 553 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  30.51 
 
 		 573 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  29.09 
 
 		 589 aa  254  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  31.16 
 
 		 556 aa  254  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 555 aa  254  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  31.27 
 
 		 588 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  31.24 
 
 		 588 aa  253  8.000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  32.23 
 
 		 559 aa  252  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  32.01 
 
 		 556 aa  252  1e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  32.23 
 
 		 559 aa  252  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  30.94 
 
 		 574 aa  252  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  32.38 
 
 		 572 aa  252  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  31.67 
 
 		 601 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  31.42 
 
 		 563 aa  251  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  30.16 
 
 		 553 aa  251  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  32.49 
 
 		 557 aa  250  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  31.49 
 
 		 553 aa  250  5e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  31.86 
 
 		 553 aa  250  5e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  31.86 
 
 		 553 aa  250  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  31.49 
 
 		 553 aa  250  5e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  31.86 
 
 		 553 aa  250  5e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  30.29 
 
 		 586 aa  249  6e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  30.38 
 
 		 553 aa  249  6e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  34.93 
 
 		 566 aa  249  6e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  31.86 
 
 		 553 aa  250  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0651  DNA repair protein  32.01 
 
 		 559 aa  249  7e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  31.86 
 
 		 553 aa  249  9e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  30.47 
 
 		 549 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0963  recombination and repair protein  30.38 
 
 		 553 aa  249  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0199907  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  30.34 
 
 		 553 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3335  putative DNA repair protein  30.68 
 
 		 573 aa  249  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  30.47 
 
 		 549 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  29.58 
 
 		 547 aa  249  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  30.47 
 
 		 549 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  31.19 
 
 		 553 aa  249  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  30.34 
 
 		 553 aa  249  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  30.47 
 
 		 549 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  30.34 
 
 		 553 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  30.47 
 
 		 549 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  30.47 
 
 		 549 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  32.87 
 
 		 579 aa  248  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  31.68 
 
 		 553 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  30.47 
 
 		 549 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  29.84 
 
 		 574 aa  248  2e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  30.99 
 
 		 588 aa  248  3e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  34.57 
 
 		 552 aa  248  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  29.72 
 
 		 564 aa  248  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  31.77 
 
 		 555 aa  247  4e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  32.21 
 
 		 529 aa  246  4.9999999999999997e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  29.36 
 
 		 567 aa  246  6e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  30.29 
 
 		 549 aa  246  8e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1303  DNA repair protein RecN  31.12 
 
 		 557 aa  246  8e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.523963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  30.29 
 
 		 576 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  28.78 
 
 		 556 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  31.55 
 
 		 599 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  29.98 
 
 		 553 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  32.68 
 
 		 570 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  32.44 
 
 		 572 aa  243  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  31.69 
 
 		 555 aa  243  5e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2505  DNA repair protein RecN  30.16 
 
 		 555 aa  243  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  31.75 
 
 		 553 aa  243  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>