More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1071 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1071  transcriptional activator-exopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 486 aa  977    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.903122  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1175  capsular polysaccharide biosynthesis protein CpsA  56.91 
 
 		 485 aa  553  1e-156  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1275  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.81 
 
 		 477 aa  276  4e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000150477  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.88 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  35.12 
 
 		 310 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.33 
 
 		 313 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.25 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.26 
 
 		 304 aa  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  32.58 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  32.58 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  32.88 
 
 		 333 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.06 
 
 		 317 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  32.42 
 
 		 333 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 333 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 335 aa  111  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  32.42 
 
 		 333 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  32.42 
 
 		 333 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.58 
 
 		 338 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  32.13 
 
 		 338 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  32.13 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  31.4 
 
 		 337 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 337 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  31.4 
 
 		 333 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  31.4 
 
 		 338 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.96 
 
 		 329 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.96 
 
 		 333 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  32.42 
 
 		 333 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.33 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  31.96 
 
 		 333 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  31.51 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3796  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.5 
 
 		 302 aa  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000323774  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.2 
 
 		 335 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.1 
 
 		 405 aa  107  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.7 
 
 		 337 aa  107  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.92 
 
 		 302 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.6 
 
 		 304 aa  103  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.44 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.44 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.44 
 
 		 303 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2334  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.02 
 
 		 318 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.591324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2377  transcription attenuator LytR  32.02 
 
 		 318 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08810  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  30.05 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.155806  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.42 
 
 		 303 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  29 
 
 		 374 aa  100  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  28.25 
 
 		 375 aa  100  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  28.25 
 
 		 375 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 375 aa  99.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 375 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  28.25 
 
 		 375 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  28.25 
 
 		 377 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  28.91 
 
 		 374 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.47 
 
 		 362 aa  99.4  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0368  hypothetical protein  31.38 
 
 		 435 aa  99  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.42 
 
 		 299 aa  99  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  27.88 
 
 		 377 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  28.23 
 
 		 372 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0125  putative transcriptional regulator  31.09 
 
 		 380 aa  95.5  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00440963  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0280  putative transcriptional regulator  33.79 
 
 		 340 aa  94.7  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.13 
 
 		 390 aa  94.4  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.28 
 
 		 319 aa  93.6  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.1 
 
 		 383 aa  94  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0271  cell envelope-related function transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 340 aa  93.6  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.968761  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.05 
 
 		 509 aa  93.2  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  28.98 
 
 		 349 aa  92.8  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5021  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.44 
 
 		 312 aa  92.8  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1893  transcriptional regulator, putative  28.39 
 
 		 316 aa  92  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0746  LytR family transcription antiterminator  32.64 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0694  LytR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0354301  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0680  LytR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0783  LytR family transcription antiterminator  32.64 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0878  transcription antiterminator, LytR family  32.64 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78734e-21 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0378  transcriptional regulator  31.38 
 
 		 408 aa  92.4  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0016641  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0648  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.45 
 
 		 388 aa  92  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.500203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.61 
 
 		 411 aa  92.4  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0875  LytR family transcription antiterminator  32.64 
 
 		 400 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0676567  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1726  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.02 
 
 		 493 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3347  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  30.47 
 
 		 345 aa  89.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000255205  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0694  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.75 
 
 		 401 aa  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1057  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.14 
 
 		 333 aa  89.7  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0371332  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.97 
 
 		 468 aa  89.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0640  transcriptional regulator, putative  30.66 
 
 		 412 aa  89  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0838  transcription antiterminator, LytR family  31.75 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3598  transcription antiterminator, LytR family  31.44 
 
 		 345 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000156827 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.18 
 
 		 445 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4511  transcription attenuator LytR  31.19 
 
 		 358 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3605  LytR family transcription antiterminator  30.57 
 
 		 345 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0149783  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3381  LytR family transcription antiterminator  31 
 
 		 345 aa  88.6  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.288134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3295  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  30.57 
 
 		 345 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189328  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3647  LytR family transcription antiterminator  31 
 
 		 345 aa  88.6  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0513784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1619  transcription antiterminator, LytR family  31 
 
 		 345 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00116574  hitchhiker  0.0000348163 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.79 
 
 		 308 aa  88.2  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0174  transcriptional regulator  31.47 
 
 		 374 aa  88.2  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0565386  hitchhiker  0.0000000000000158467 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0946  transcription antiterminator, LytR family  31.22 
 
 		 400 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.66 
 
 		 563 aa  87.8  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0189  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.47 
 
 		 403 aa  87.4  6e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.84 
 
 		 486 aa  86.7  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3698  transcription antiterminator, LytR family  31 
 
 		 345 aa  87  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00180581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4498  transcription antiterminator, LytR family  31.22 
 
 		 399 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000182536 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3273  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.47 
 
 		 345 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>