More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1275 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1275  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 477 aa  961    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000150477  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1071  transcriptional activator-exopolysaccharide biosynthesis  37.31 
 
 		 486 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.903122  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1175  capsular polysaccharide biosynthesis protein CpsA  35.71 
 
 		 485 aa  276  4e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.46 
 
 		 310 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.58 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.04 
 
 		 304 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.04 
 
 		 304 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  28.47 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  28.27 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.82 
 
 		 303 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.74 
 
 		 383 aa  123  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.98 
 
 		 338 aa  123  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  27.92 
 
 		 337 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  27.92 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.33 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  27.92 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  27.92 
 
 		 333 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.33 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 337 aa  121  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 337 aa  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.33 
 
 		 303 aa  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  27.76 
 
 		 338 aa  121  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33 
 
 		 304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.04 
 
 		 337 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.86 
 
 		 302 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08810  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.87 
 
 		 374 aa  119  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.155806  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3796  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.55 
 
 		 302 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000323774  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.48 
 
 		 335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  29.07 
 
 		 375 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.55 
 
 		 302 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  29.07 
 
 		 375 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  29.07 
 
 		 375 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 375 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 375 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.02 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  28.68 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  28.68 
 
 		 377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  28.68 
 
 		 372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  29.07 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.31 
 
 		 322 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.94 
 
 		 374 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1352  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.06 
 
 		 488 aa  107  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00278352  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1893  transcriptional regulator, putative  30.89 
 
 		 316 aa  107  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.25 
 
 		 317 aa  106  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1851  transcriptional regulator  31.85 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1057  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.08 
 
 		 333 aa  105  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0371332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  25.27 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 335 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  25.27 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  25.27 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.91 
 
 		 333 aa  104  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  25.27 
 
 		 333 aa  103  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  25.27 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2377  transcription attenuator LytR  30.12 
 
 		 318 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2334  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.12 
 
 		 318 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.591324  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  26.14 
 
 		 333 aa  100  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0368  hypothetical protein  27.84 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0174  transcriptional regulator  28.93 
 
 		 374 aa  99.8  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0565386  hitchhiker  0.0000000000000158467 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.05 
 
 		 329 aa  99.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  24.91 
 
 		 335 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0332  transcriptional regulator  30.35 
 
 		 386 aa  97.8  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  33.12 
 
 		 349 aa  97.4  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0640  transcriptional regulator, putative  28.62 
 
 		 412 aa  97.4  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.84 
 
 		 497 aa  95.9  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 563 aa  96.3  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03580  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.8 
 
 		 448 aa  94  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.742286  normal  0.880699 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1715  transcriptional regulator  26.92 
 
 		 374 aa  93.6  7e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565214 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.56 
 
 		 509 aa  93.2  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.25 
 
 		 405 aa  93.2  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08920  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  29.32 
 
 		 381 aa  93.2  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.36 
 
 		 390 aa  92.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0378  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0016641  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1138  transcription attenuator LytR  28.75 
 
 		 405 aa  90.5  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.195072  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1732  transcriptional regulator  32.28 
 
 		 296 aa  90.5  6e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1115  hypothetical protein  28.75 
 
 		 405 aa  90.5  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.108667  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1157  transcriptional regulator  28.76 
 
 		 334 aa  89.4  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000266671  hitchhiker  6.72858e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0838  transcription antiterminator, LytR family  25.77 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1700  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.77 
 
 		 463 aa  89  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0435  transcriptional regulator  31.84 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3228  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.1 
 
 		 377 aa  87.8  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0471557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0875  LytR family transcription antiterminator  26.12 
 
 		 400 aa  87  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0676567  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4498  transcription antiterminator, LytR family  26.03 
 
 		 399 aa  87  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000182536 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0648  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.05 
 
 		 388 aa  87  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.500203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0680  LytR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 398 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3081  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.36 
 
 		 531 aa  86.7  8e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0746  LytR family transcription antiterminator  26.74 
 
 		 398 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0694  LytR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 398 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0354301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0783  LytR family transcription antiterminator  26.74 
 
 		 398 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0489  transcription regulator  25.99 
 
 		 450 aa  86.3  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0694  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.91 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0271  cell envelope-related function transcriptional attenuator  30.64 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.968761  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0961  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.57 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0280  putative transcriptional regulator  32.45 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0878  transcription antiterminator, LytR family  26.39 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78734e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0946  transcription antiterminator, LytR family  27.2 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1739  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.87 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3347  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  26.21 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000255205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>